文献

J-GLOBAL ID：202202230737102051   整理番号：22A0433740

Psammochloa villosa(イネ科)における非生物的ストレス耐性のゲノム基盤の研究のための定量的リアルタイムPCRによる参照(ハウスキーピング)遺伝子の確立【JST・京大機械翻訳】

Establishment of reference (housekeeping) genes via quantitative real-time PCR for investigation of the genomic basis of abiotic stress resistance in Psammochloa villosa (Poaceae)

著者 (19件)： Liu Yu Ping (School of Life Sciences, Qinghai Normal University, Xining, 810008, China) ,  Liu Yu Ping (Academy of Plateau Science and Sustainability, Qinghai Normal University, Xining, 810016, China) ,  Liu Yu Ping (Key Laboratory of Medicinal Animal and Plant Resources of the Qinghai-Tibet Plateau in Qinghai Province, Qinghai Normal University, Xining, 810008, China) ,  Zhang Yu (School of Life Sciences, Qinghai Normal University, Xining, 810008, China) ,  Liu Feng (School of Life Sciences, Qinghai Normal University, Xining, 810008, China) ,  Liu Tao (School of Geography, Qinghai Normal University, Xining, 810008, China) ,  Liu Tao (Key Laboratory of Land Surface Processes and Ecological Conservation of the Qinghai-Tibet Plateau, The Ministry of Education, Qinghai Normal University, Xining, 810008, China) ,  Chen Jin Yuan (School of Life Sciences, Qinghai Normal University, Xining, 810008, China) ,  Fu Gui (School of Geography, Qinghai Normal University, Xining, 810008, China) ,  Zheng Chang Yuan (School of Life Sciences, Qinghai Normal University, Xining, 810008, China) ,  Su Dan Dan (School of Life Sciences, Qinghai Normal University, Xining, 810008, China) ,  Wang Ya Nan (School of Life Sciences, Qinghai Normal University, Xining, 810008, China) ,  Zhou Hua Kun (Key Laboratory of Cold Regions Restoration Ecology in Qinghai Province, Northwest Institute of Plateau Biology, Chinese Academy of Sciences, Xining, 810008, China) ,  Su Xu (School of Life Sciences, Qinghai Normal University, Xining, 810008, China) ,  Su Xu (Academy of Plateau Science and Sustainability, Qinghai Normal University, Xining, 810016, China) ,  Su Xu (Key Laboratory of Medicinal Animal and Plant Resources of the Qinghai-Tibet Plateau in Qinghai Province, Qinghai Normal University, Xining, 810008, China) ,  Su Xu (Key Laboratory of Land Surface Processes and Ecological Conservation of the Qinghai-Tibet Plateau, The Ministry of Education, Qinghai Normal University, Xining, 810008, China) ,  AJ Harris (Key Laboratory of Plant Resources Conservation and Sustainable Utilization, South China Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Guangzhou, 510650, China) ,  Wang Xiu Mei (School of Life Sciences, Qinghai Normal University, Xining, 810008, China)
資料名： Journal of Plant Physiology  (Journal of Plant Physiology)
巻： 268  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： E0822B  ISSN： 0176-1617  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Psammochloa villosaは,干ばつ,寒冷および塩を含む非生物的ストレスに対するかなりの耐性を有する中国北西部で成長する砂漠植物である。Psammochloa villosaにおけるストレス耐性の将来の研究を促進するために,将来の遺伝子発現研究の中での利用のための一連の参照(またはハウスキーピング)遺伝子を確立することを試みた。特に,P.villosaに対する以前の研究と新しいトランスクリプトームデータに基づいて9つの候補遺伝子を選択し,4つの異なるバイオインフォマティクス評価を用いて非生物ストレス条件をシミュレートする異なる処理下のP.villosaの3つの異なる組織での発現安定性を評価した。結果は,TIP41(TIP41様ファミリー蛋白質)が乾燥および塩ストレス葉および塩ストレス茎において最も安定した参照遺伝子であり,ELF-1α(伸長因子1-α)が寒冷ストレス葉および乾燥および塩ストレス根において最も安定であり,ACT(アクチン)が寒冷ストレス茎において最も安定であり,TUA(α-チューブリン)が寒冷ストレス茎において最も安定であり,18S rRNA(18SリボソームRNA)が寒冷ストレス根において最も安定であることを示した。さらに,干ばつ関連遺伝子であるP5CS(Δ1 -ピロリン-5-カルボキシラートシンテターゼ)の発現パターンを検出するために,これらの候補参照遺伝子の有用性を試験した。本研究は,種々のストレス条件下でのP.villosaの参照遺伝子の選択と検証に関する最初の報告である。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： rRNA ,  アクチン ,  *遺伝子 ,  干ばつ ,  砂漠 ,  *イネ科 ,  寒冷ストレス ,  遺伝子発現 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 塩分ストレス ,  バイオインフォマティクス ,  候補遺伝子 ,  *非生物的ストレス ,  参照遺伝子 ,  遺伝子発現パターン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 砂漠植物 ,  青海-チベット高原 ,  RefFinder ,  Stipeae ,  ストレス治療 ,  トランスクリプトーム

分類 (2件)： 植物生理学一般  (EH02010Y) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (10件)： イネ科 ,  非生物的ストレス ,  耐性 ,  ゲノム ,  基盤 ,  研究 ,  定量的リアルタイムPCR ,  参照 ,  ハウスキーピング ,  遺伝子