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J-GLOBAL ID:202202230751948193   整理番号:22A0624046

蛍光性イメージングおよびセンシングタグへのアデニンリボスイッチの再利用【JST・京大機械翻訳】

Repurposing an adenine riboswitch into a fluorogenic imaging and sensing tag
著者 (7件):
資料名:
巻: 18  号:ページ: 180-190  発行年: 2022年 
JST資料番号: W2213A  ISSN: 1552-4450  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: ドイツ (DEU)  言語: 英語 (EN)
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蛍光性RNAアプタマーは,蛍光RNAを遺伝的にコード化し,RNAに基づく代謝物センサーを構築するために使用される。代謝産物誘導配座転移を効率的に折畳みし,受ける自然発生アプタマーと異なり,蛍光アプタマーは,それらの細胞蛍光を制限する貧弱な折畳みを示す。これを克服するために,自然に生じる良く折り畳まれたアデニンリボスイッチを蛍光性アプタマーに進化させた。アデニン結合ポケットがサイズと配列の両方に対してランダム化され,緑色蛍光蛋白質様フルオロフォアの蛍光を結合し活性化するSquashを選択した,およそ1015アデニンアプタマー様RNAのライブラリーを作成した。スクアッシュは,S-アデノシルメチオニン(SAM)結合アプタマーに融合した時,著しく改善された細胞折畳みと高効率代謝産物依存性折畳みを示した。Squashベースのレシオメトリックセンサは定量的SAM測定を達成し,SAMレベルの細胞-細胞不均一性を明らかにし,SAMの代謝起源を明らかにした。これらの研究は,自然発生アプタマーの効率的折畳みが,よく折り畳まれた細胞適合性蛍光アプタマーとデバイスをエンジニアするのに利用できることを示した。アデニンリボスイッチはリガンド結合ポケットの配列とサイズをランダム化することにより蛍光アプタマーに進化した。得られた蛍光性アプタマー,Squashは高度に折り畳まれ,SAMのレシオメトリックライブイメージングに適応した。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature America, Inc. 2021. corrected publication 2022 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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, 【Automatic Indexing@JST】
分類 (3件):
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核酸一般  ,  遺伝子操作  ,  遺伝子発現 
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