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J-GLOBAL ID:202202231247119336   整理番号:22A0584794

Mapk14は予後バイオマーカーであり,結腸直腸癌の臨床病理学的特徴および免疫浸潤と相関する【JST・京大機械翻訳】

Mapk14 is a Prognostic Biomarker and Correlates with the Clinicopathological Features and Immune Infiltration of Colorectal Cancer
著者 (6件):
資料名:
巻: 10  ページ: 817800  発行年: 2022年 
JST資料番号: U7062A  ISSN: 2296-634X  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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背景:結腸直腸癌(CRC)は,最も一般的な胃腸腫瘍の1つであり,発生と死亡率に関して,すべての一般的腫瘍のトップ5でランキングする。しかし,結腸直腸癌の進化を駆動する機構は不明のままである。このため,Mapk14発現と臨床病理学的および腫瘍浸潤免疫細胞の間の関係を検討した。方法:本研究では,Cancer Genome Atlas(TCGA)からのCRC患者データを収集し,Wilcoxon順位和検定を用いてCRCと正常結腸直腸組織における発現レベルを比較し,Welch一元配置ANOVA試験を用いてMapk14と臨床病理学的特徴の間の関係を評価した。Kaplan-Meierおよび時間ROCGSE17537データセットを,結腸直腸癌に及ぼすMapk14遺伝子の予後影響を評価するために,遺伝子発現Omnibus(GEO)データセットから得た。第二に,Mapk14のメチル化レベルとその影響因子をさらに調査した。腫瘍免疫微小環境(TIME)におけるMapk14の単細胞配列決定を,GSE108989データセットを用いて分析した。Mapk14と腫瘍免疫浸潤,免疫チェックポイント,腫瘍変異負荷およびマイクロサテライト不安定性の間の相関を評価するために,TIMER法に基づく更なる分析を行った。最後に,バイオインフォマティクス分析の結果を免疫組織化学的分析により確認した。【結果】結果は,Mapk14の発現が正常な結腸直腸組織と比較してCRC腫瘍組織で上方制御され,Mapk14の高発現がCRC配列における不良な臨床病理学的特徴および予後不良と関連することを示した。加えて,Mapk14のcg05798012とcg25375420はOSに影響する主なDNAメチル化部位である。腫瘍免疫微小環境の単細胞配列決定は,機能不全T細胞の豊度と細胞状態が大いに変化することを示した。重要なことに,結腸直腸癌におけるMapk14の異常な過剰発現は,免疫細胞(CD8+T細胞,好中球,樹状細胞,B細胞,CD4+T細胞,およびマクロファージを含む)の免疫浸潤のレベルに関連がある。Mapk14の高発現は免疫チェックポイント(SIGLEC15,TIGIT,LAG3,CTLA4およびPDCDILG2)と有意に相関していたが,Mapk14の高発現はTMBおよびMSIと負に相関したが,薬物感受性とは正の相関を示した。最後に,免疫組織化学的結果は,臨床病期(I,II,IIIおよびIV)およびM段階(M0およびM1)がMapk14の異常に高い発現に影響することを確認した:包括的なバイオインフォマティクス研究および実験的検証は,Mapk14が免疫浸潤および薬物療法と関係した新しい予後バイオマーカーとして機能し,CRCの治療に対する可能性のある治療標的になることを示す。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
消化器の腫よう  ,  腫ようの化学・生化学・病理学 
引用文献 (54件):
  • AlbiniA., SpornM. B. (2007). The Tumour Microenvironment as a Target for Chemoprevention. Nat. Rev. Cancer 7, 139-147. doi: 10.1038/nrc2067
  • Alvarez-ErricoD. (2021). Perspectives on Epigenetics and Cancer Immunotherapy: A Preface to Special Issue. Cancers 13, 1452. doi: 10.3390/cancers13061452
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  • BechtE., GiraldoN. A., LacroixL., ButtardB., ElarouciN., PetitprezF., et al (2016). Estimating the Population Abundance of Tissue-Infiltrating Immune and Stromal Cell Populations Using Gene Expression. Genome Biol. 17, 218. doi: 10.1186/s13059-016-1070-5
  • ChangL., ChangM., ChangH. M., ChangF. (2018). Microsatellite Instability: A Predictive Biomarker for Cancer Immunotherapy. Appl. Immunohistochem. Mol. Morphol. 26, e15-e21. doi: 10.1097/PAI.0000000000000575
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