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J-GLOBAL ID：202202231398684619   整理番号：22A1177828

ドイツ,Haven川のピコルナ様ウイルス【JST・京大機械翻訳】

Picorna-Like Viruses of the Havel River, Germany

著者 (4件)： Zell Roland (Section of Experimental Virology, Institute for Medical Microbiology, Jena University Hospital, Friedrich Schiller University, Jena, Germany) ,  Groth Marco (CF DNA Sequencing, Leibniz Institute on Aging, Fritz Lipmann Institute, Jena, Germany) ,  Selinka Lukas (Section of Experimental Virology, Institute for Medical Microbiology, Jena University Hospital, Friedrich Schiller University, Jena, Germany) ,  Selinka Hans-Christoph (Section II 1.4 Microbiological Risks, Department of Environmental Hygiene, German Environment Agency, Berlin, Germany)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 13  ページ： 865287  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 大都市圏における河川生態系のビローム多様性の理解を改善するために,ドイツ,ベルリンの河川Havelから2018年6月に採取した水を用いてメタゲノム解析を行った。ウイルス粒子およびRNA抽出の濃縮後,対端Illumina配列決定を行い,ウイルス群およびファミリーへの帰属を行った。本論文は,ヒト,動物,および環境健康に影響を及ぼすウイルスの,最も多様で豊富なグループであるピコルナ様ウイルスに焦点を当てる。ここでは,1から11.5kbまでのサイズの範囲の166のウイルス配列について述べた。71のほとんど完全なゲノムは,1つの候補のイラウイルス,1つのピコナウイルス,2つのポリシプシウイルス,27のマナウイルス,27のジシストロ様ウイルス,および13の非タイプウイルスから成る。10.2kbまでの多くの部分的ピコリン様ウイルス配列も調べた。Havel ピコrna様ウイルスの配列は,これまで知られている8つのPicornavirus科の7つのゲノムを代表する。多数の遠隔関連ジシストロウイルスの検出は,異常なゲノムレイアウトを持つ少数のウイルスを含むジシストロンゲノムを有する付加的で未探索のウイルス群の存在を示唆する。特別な興味は,ゲノムの5′末端でカプシド蛋白質コード配列を有するジシストロンウイルスのクレードである。また,ジシストロウイルスのそれらに対するポリメラーゼとカプシド蛋白質の類似性を有するモノシストロンウイルスは興味深い。ソルビウイルスおよび関連ウイルスのポリ蛋白質に存在するNTP結合部位を有する第二の蛋白質は,さらなる注意を必要とする。結果は,河成生態系のビロームを研究する重要性を強調する。今までに,海洋生物からマナウイルスが単離された。しかし,本研究と利用可能な配列データは,河川と気候の生息場所が,マナウイルスの循環と未知のピコリン様ウイルスの過多との関連する生態系であることを示唆する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 気候 ,  河川 ,  *ウイルス ,  シストロン ,  タンパク質 ,  ヒト ,  系統発生 ,  ゲノム ,  結合部位 ,  海洋生物 ,  生態系 ,  生息場所
準シソーラス用語： ポリプロテイン ,  メタゲノミクス ,  クレード , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 河川生態系 ,  ビローム ,  ピコルナウイルス ,  系統発生解析 ,  メタゲノミクス ,  ピコルナ様ウイルス ,  RNAウイルス

分類 (2件)： 河川汚濁  (SB02020F) ,  微生物検査法  (EG02020G)

引用文献 (76件)：

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• Buchfink B., Xie C., Huson D. H. (2015). Fast and sensitive protein alignment using DIAMOND. Nat. Methods 12, 59-60. doi: , PMID: doi: 10.1038/nmeth.3176

タイトルに関連する用語 (2件)： ドイツ ,  ウイルス