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J-GLOBAL ID：202202231687175756   整理番号：22A0749641

肺腺癌における予後と免疫療法応答に関連するRNA結合蛋白質IGF2BP1【JST・京大機械翻訳】

RNA-Binding Protein IGF2BP1 Associated With Prognosis and Immunotherapy Response in Lung Adenocarcinoma

著者 (5件)： Liu JinFeng (1Department of Immunology, School of Medicine and Holistic Integrative Medicine, Nanjing University of Chinese Medicine, Nanjing, China) ,  Li Zhi (2Department of Cardiovascular Surgery, The First Affiliated Hospital of Nanjing Medical University, Nanjing, China) ,  Cheang Iokfai (3Department of Cardiology, The First Affiliated Hospital of Nanjing Medical University, Nanjing, China) ,  Li Jinghang (2Department of Cardiovascular Surgery, The First Affiliated Hospital of Nanjing Medical University, Nanjing, China) ,  Zhou Chunlei (4Department of Pathology, Children’s Hospital of Nanjing Medical University, Nanjing, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 777399  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： N6-メチルアデノシン(m6A)は,真核生物RNAにおける最も一般的な修飾であり,種々の癌の腫瘍形成および転移において重要な役割を果たす。しかし,肺腺癌(LUAD)におけるm6Aメチル化調節因子の包括的な研究は,まだ不足している。本研究は,LUADにおけるm6Aメチル化調節因子の役割を系統的に探索することを目的とした。20m6Aメチル化レギュレーターのRNA配列決定データとLUAD患者の臨床データを,癌ゲノムアトラス(TCGA)データベースからダウンロードした。LUADにおけるm6Aメチル化調節因子の予後値を,遺伝子発現プロファイリング相互作用分析(GEPIA)とPrognoScanデータベースを用いて評価した。LUADにおけるIGF2BP1と免疫浸潤の間の相関を,CIBERSORTと腫瘍免疫推定資源(TIMER)を通して調査した。全部で15m6A修飾調節因子はLUAD組織で著しく異常に発現した。生存分析は,4つの遺伝子(HNRNPC,HNRNPA2B1,IGF2BP1,およびIGF2BP3)がLUADにおける予後不良と有意に関連することを明らかにした。多変量Cox回帰分析は,IGF2BP1のみが一般的臨床パラメータを調整した後のLUADの独立した予測因子であることを示した。LUADにおけるm6A修飾調節因子の突然変異率は10%未満であった。更なる分析は,IGF2BP1発現が免疫浸潤,免疫チェックポイントの発現およびLUADにおける腫瘍変異負荷(TMB)と有意に相関することを示した。本知見は,IGF2BP1が独立した予測因子であり,LUADにおける免疫療法応答に関連しており,これはLUADの予後および腫瘍免疫の状態に対する潜在的新規バイオマーカーであるかもしれないことを示唆する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 回帰分析 ,  データベース ,  浸潤 ,  メチル化 ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  腫瘍 ,  *免疫療法 ,  真核生物 ,  *予後 ,  *肺腫瘍 ,  *腺癌 ,  バイオマーカー ,  腫瘍免疫
準シソーラス用語： *肺腺癌 ,  予後不良 ,  調節因子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 肺腺癌 ,  TCGA ,  m=6A修飾調節因子 ,  予後 ,  免疫療法反応

分類 (3件)： 呼吸器の腫よう  (GI04000G) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (28件)：

• BrayF., FerlayJ., SoerjomataramI., SiegelR. L., TorreL. A., JemalA., et al (2018). Global Cancer Statistics 2018: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries. Ca A Cancer J. Clinicians 68, 394-424. doi: 10.3322/caac.21492
• ChenJ., DuB. (2019). Novel Positioning from Obesity to Cancer: FTO, an m6A RNA Demethylase, Regulates Tumour Progression. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 145 (1), 19-29. doi: 10.1007/s00432-018-2796-0
• DegrauweN., SuvàM.-L., JaniszewskaM., RiggiN., StamenkovicI. (2016). IMPs: an RNA-Binding Protein Family that Provides a Link between Stem Cell Maintenance in normal Development and Cancer. Genes Dev. 30 (22), 2459-2474. doi: 10.1101/gad.287540.116
• DesrosiersR., FridericiK., RottmanF. (1974). Identification of Methylated Nucleosides in Messenger RNA from Novikoff Hepatoma Cells. Proc. Natl. Acad. Sci. 71 (10), 3971-3975. doi: 10.1073/pnas.71.10.3971
• GongP.-J., ShaoY.-C., YangY., SongW.-J., HeX., ZengY.-F., et al (2020). Analysis of N6-Methyladenosine Methyltransferase Reveals METTL14 and ZC3H13 as Tumor Suppressor Genes in Breast Cancer. Front. Oncol. 10, 578963. doi: 10.3389/fonc.2020.578963

タイトルに関連する用語 (5件)： 肺腺癌 ,  予後 ,  免疫療法 ,  応答 ,  RNA結合蛋白質