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J-GLOBAL ID：202202232104247985   整理番号：22A0315045

再パッケージCRISPRプラットフォームは酵母工学のための相同性指向修復を増加させる【JST・京大機械翻訳】

A repackaged CRISPR platform increases homology-directed repair for yeast engineering

著者 (21件)： Ploessl Deon (Department of Chemical and Biological Engineering, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Ploessl Deon (NSF Engineering Research Center for Biorenewable Chemicals, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Zhao Yuxin (Department of Chemical and Biological Engineering, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Zhao Yuxin (NSF Engineering Research Center for Biorenewable Chemicals, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Cao Mingfeng (Department of Chemical and Biological Engineering, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Cao Mingfeng (NSF Engineering Research Center for Biorenewable Chemicals, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Ghosh Saptarshi (Department of Chemical and Biological Engineering, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Ghosh Saptarshi (NSF Engineering Research Center for Biorenewable Chemicals, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Lopez Carmen (Department of Chemical and Biological Engineering, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Lopez Carmen (Interdepartmental Microbiology Program, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Sayadi Maryam (The Genome Informatics Facility, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Chudalayandi Siva (The Genome Informatics Facility, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Severin Andrew (The Genome Informatics Facility, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Huang Lei (Department of Chemical and Biological Engineering, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Gustafson Marissa (Department of Chemical and Biological Engineering, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Shao Zengyi (Department of Chemical and Biological Engineering, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Shao Zengyi (NSF Engineering Research Center for Biorenewable Chemicals, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Shao Zengyi (Interdepartmental Microbiology Program, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Shao Zengyi (Bioeconomy Institute, Iowa State University, Ames, IA, USA) ,  Shao Zengyi (The Ames Laboratory, Ames, IA, USA) ,  Shao Zengyi (DOE Center for Advanced Bioenergy and Bioproducts Innovation, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, IL, USA)
資料名： Nature Chemical Biology  (Nature Chemical Biology)
巻： 18  号： 1  ページ： 38-46  発行年： 2022年 
JST資料番号： W2213A  ISSN： 1552-4450  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 効率的な相同性指向修復(HDR)は,DNA二本鎖切断(DSB)を固定するために非相同末端結合(NHEJ)を優先的に使用する生物におけるCRISPR-Cas9ゲノム編集を制約する。NHEJの技能を軽減するために使用される現在の戦略はNHEJ破壊を含む。NHEJ破壊のない精度編集を与えるため,従来のCRISPRプラットフォームの欠点を同定し,4つのNHEJ-プロピテント酵母における従来のプラットフォームを用いた以前の報告と比較して,HDR速度(67~100%)を増強する正確な修復(LINEAR)を可能にするCRISPRプラットフォームを下したインデルヌクレアーゼ系を開発した。NHEJ保存により,ゲノム景観を調べる能力を示し,時空間ゲノム構造が異種経路に対する良好な発現動力学を生じる遺伝子座を同定した。(S)-ノルコクラリンを生産するために,微生物工場を迅速にエンジニアし最適化するために,LINEAR精度編集とNHEJ仲介ランダム統合を展開する事例研究を示した。まとめると,本研究は,微生物工場の現在の収集を拡大するために,DNA DSB修復経路の拮抗対をいかに活用するかを示した。CRISPR-Cas9ゲノム編集は,非効率的な相同性指向修復(HDR)を有する生物において制限されるが,特殊化したCRISPRプラットフォームの開発は,4つの非標準酵母におけるHDR速度を増加させ,菌株工学を増強する。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature America, Inc. 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 最適化 ,  微生物 ,  DNA【核酸】 ,  *酵母 ,  ゲノム ,  事例研究 ,  *相同性 ,  二本鎖DNA切断
準シソーラス用語： 非相同末端結合 ,  ゲノム構造 ,  *CRISPR配列 ,  ゲノムエディティング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 生物学的機能  (EB03040U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  植物ホルモン  (EH02070M)

タイトルに関連する用語 (7件)： パッケージ ,  CRISPR ,  プラットフォーム ,  酵母 ,  工学 ,  相同性 ,  修復