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J-GLOBAL ID：202202232245442579   整理番号：22A0806622

α-プロテオバクテリアの異種サイレンサーMucRを有するジンクフィンガーは適応と調節完全性をバランスさせる【JST・京大機械翻訳】

The zinc-finger bearing xenogeneic silencer MucR in α-proteobacteria balances adaptation and regulatory integrity

著者 (9件)： Jiao Jian (State Key Laboratory of Agrobiotechnology, and College of Biological Sciences, China Agricultural University, Beijing, China) ,  Jiao Jian (MOA Key Laboratory of Soil Microbiology, and Rhizobium Research Center, China Agricultural University, Beijing, China) ,  Zhang Biliang (State Key Laboratory of Agrobiotechnology, and College of Biological Sciences, China Agricultural University, Beijing, China) ,  Zhang Biliang (MOA Key Laboratory of Soil Microbiology, and Rhizobium Research Center, China Agricultural University, Beijing, China) ,  Li Meng-Lin (State Key Laboratory of Agrobiotechnology, and College of Biological Sciences, China Agricultural University, Beijing, China) ,  Li Meng-Lin (MOA Key Laboratory of Soil Microbiology, and Rhizobium Research Center, China Agricultural University, Beijing, China) ,  Zhang Ziding (State Key Laboratory of Agrobiotechnology, and College of Biological Sciences, China Agricultural University, Beijing, China) ,  Tian Chang-Fu (State Key Laboratory of Agrobiotechnology, and College of Biological Sciences, China Agricultural University, Beijing, China) ,  Tian Chang-Fu (MOA Key Laboratory of Soil Microbiology, and Rhizobium Research Center, China Agricultural University, Beijing, China)
資料名： ISME Journal  (ISME Journal)
巻： 16  号： 3  ページ： 738-749  発行年： 2022年 
JST資料番号： W4507A  ISSN： 1751-7362  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 外国のATリッチ遺伝子は,既存の調節ネットワークに挑戦しながら,新しいニッチへの細菌適応を駆動する。ここでは,MucR,α-プロテオバクテリアの保存されたレギュレーター,Sinorhizobium frediiにおける適応と調節完全性,マメ科の通性マイクロ共生,のバランスをとっていることを報告する。トランスクリプトームデータと組み合わせたクロマチン免疫沈降配列決定は,自由生活および共生条件下で標的および非標的遺伝子の両方の平均転写レベルがそれらの保存レベルと共に増加することを明らかにした。環境適応および共生に関与する標的は,属または種コアに属し,MucRにより抑制または活性化され,調節統合を意味する。しかし,ほとんどの標的は,より低い発現レベルとより高いAT%の菌株特異的遺伝子に豊富である。各保存レベル内で,標的は非標的遺伝子よりも高いAT%と平均転写レベルを有し,mucR変異体でさらにアップレギュレートされる。これは,標的遺伝子に対するプロモーターの-35と-10要素の間のスペーサーの高いAT%と一致し,転写を増強する。MucR動員レベルはAT%と共に直線的に増加し,標的配列の柔軟性パターン(T_sの周期的反復)の数とともに直線的に増加した。まとめると,MucRは,その標的部位の進行性の浸食が外来遺伝子の調節統合を促進する一方で,高い転写能を持つATに富む外来遺伝子を直接抑制する。Copyright The Author(s) 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細菌 ,  遺伝子 ,  共生 ,  転写【遺伝】 ,  突然変異体 ,  マメ科 ,  プロモーター領域 ,  環境順応 ,  *サイレンサー領域 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *プロテオバクテリア ,  *亜鉛フィンガー ,  外来遺伝子 ,  標的遺伝子 ,  遺伝子調節ネットワーク , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： プロテオバクテリア ,  サイレンサー ,  ジンクフィンガー ,  適応 ,  調節 ,  完全性 ,  バランス