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J-GLOBAL ID：202202232295648405   整理番号：22A1055929

SWI/SNFサブユニットBRG1は新生RNAとRNA結合因子の相互作用を変えることにより選択的スプライシングに影響する【JST・京大機械翻訳】

The SWI/SNF subunit BRG1 affects alternative splicing by changing RNA binding factor interactions with nascent RNA

著者 (11件)： Ganez-Zapater Antoni (Department of Molecular Biosciences, The Wenner-Gren Institute, Stockholm University, Stockholm, Sweden) ,  Ganez-Zapater Antoni (Center for Genomic Regulation, Barcelona, Spain) ,  Mackowiak Sebastian D. (Science for Life Laboratory, Department of Molecular Biosciences, The Wenner-Gren Institute, Stockholm University, Stockholm, Sweden) ,  Mackowiak Sebastian D. (Max Planck Institute for Molecular Genetics, Berlin, Germany) ,  Guo Yuan (Department of Molecular Biosciences, The Wenner-Gren Institute, Stockholm University, Stockholm, Sweden) ,  Tarbier Marcel (Science for Life Laboratory, Department of Molecular Biosciences, The Wenner-Gren Institute, Stockholm University, Stockholm, Sweden) ,  Jordan-Pla Antonio (Department of Molecular Biosciences, The Wenner-Gren Institute, Stockholm University, Stockholm, Sweden) ,  Jordan-Pla Antonio (Departamento de Bioquimica y Biologia Molecular, Facultad de Ciencies Biologicas, Valencia University, Burjassot, Spain) ,  Friedlaender Marc R. (Science for Life Laboratory, Department of Molecular Biosciences, The Wenner-Gren Institute, Stockholm University, Stockholm, Sweden) ,  Visa Neus (Department of Molecular Biosciences, The Wenner-Gren Institute, Stockholm University, Stockholm, Sweden) ,  OEstlund Farrants Ann-Kristin (Department of Molecular Biosciences, The Wenner-Gren Institute, Stockholm University, Stockholm, Sweden)
資料名： Molecular Genetics and Genomics  (Molecular Genetics and Genomics)
巻： 297  号： 2  ページ： 463-484  発行年： 2022年 
JST資料番号： C0025C  ISSN： 1617-4615  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： BRG1とBRMは,主に転写開始と関連するヒトSWI/SNFクロマチンリモデリング複合体のATPアーゼコアサブユニットである。これらはまた,いくつかの遺伝子でBRM含有SWI/SNF複合体で示されている選択的スプライシングに役割を持つ。ここでは,C33A細胞,BRG1およびBRM欠損細胞系でATPアーゼBRG1およびBRMを発現することにより,SWI/SNF ATPアーゼにより影響を受ける,代替エクソンを有する遺伝子サブセットを同定し,RNA配列決定によりスプライシングに与える効果を分析した。BRG1およびBRMは,ATPアーゼ間のマイナーな重複のみを伴って,エキソン封入体およびエキソンスキッピングの両方を支持する遺伝子のサブセットに影響した。BRG1およびBRM発現により誘導される選択的スプライシングの変化のいくつかは,ATPアーゼ活性を必要としなかった。BRG1-ATPアーゼ非依存性のエキソンは,高いGC含有量のエキソンシグネチャを示した。BRG-ATPアーゼ欠損変異体により影響を受けたエキソンを有する3つの遺伝子を調べることにより,これらのエキソンがRNAポリメラーゼIIの濃縮なしにセリン2とセリン5リン酸化の両方のリン酸化RNApolII CTDを蓄積することを示した。ATPアーゼは,SWI/SNF複合体のコアとシグネチャサブユニットと共に代替エキソンに動員され,代替エキソンでクロマチンとRNAへのRNA結合因子の結合を促進した。しかし,新生RNPとの相互作用はクロマチンとの関連を反映しなかった。BRG1およびBRM野生型を発現する細胞におけるクロマチンと関連する,ΔΨL,ΔΨUおよびSAM68蛋白質は,新生RNPに対するHubbardUの結合は除外された。これは,SWI/SNFがスプライシング-RNA結合因子との相互作用により選択的スプライシングを調節し,新生前mRNA粒子への結合に影響することを示唆する。Copyright The Author(s) 2022 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *相互作用 ,  ATPアーゼ ,  *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  クロマチン ,  タンパク質 ,  突然変異体 ,  ヒト ,  リン酸化 ,  *サブユニット ,  *RNAスプライシング ,  エキソン ,  *選択的スプライシング
準シソーラス用語： クロマチンリモデリング ,  *BRG1 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： mRNA選択的スプライシング ,  エキソンGC含量 ,  クロマチンリモデリング ,  SWI/SNF ,  BRGG1 ,  hnRNPL ,  hnRNPU ,  SAM68

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (9件)： SWI ,  SNF ,  サブユニット ,  BRG1 ,  RNA ,  RNA結合 ,  因子 ,  相互作用 ,  選択的スプライシング