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J-GLOBAL ID：202202233176094399   整理番号：22A0688398

バングラデシュ南西部のChAdOx1 nCoV-19免疫患者から同定される懸念のSARS-CoV-2変異体のゲノム解析【JST・京大機械翻訳】

Genomic analysis of SARS-CoV-2 variants of concern identified from the ChAdOx1 nCoV-19 immunized patients from Southwest part of Bangladesh

著者 (21件)： Al-Emran Hassan M. (Department of Biomedical Engineering, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Al-Emran Hassan M. (Genome Centre, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Hasan Md. Shazid (Genome Centre, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Hasan Md. Shazid (Department of Microbiology, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Ahasan Setu Md. Ali (Genome Centre, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Rahman M. Shaminur (Department of Microbiology, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Alam ASM Rubayet Ul (Genome Centre, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Alam ASM Rubayet Ul (Department of Microbiology, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Sarkar Shovon Lal (Genome Centre, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Sarkar Shovon Lal (Department of Microbiology, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Islam Md. Tanvir (Genome Centre, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Islam Md. Tanvir (Department of Microbiology, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Islam Mir Raihanul (Poverty, Health, and Nutrition Division, International Food Policy Research Institute, Dhaka, Bangladesh) ,  Rahman Mohammad Mahfuzur (Department of Environmental Science and Technology, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Islam Ovinu Kibria (Genome Centre, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Islam Ovinu Kibria (Department of Microbiology, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Jahid Iqbal Kabir (Genome Centre, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Jahid Iqbal Kabir (Department of Microbiology, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Hossain M. Anwar (Genome Centre, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh) ,  Hossain M. Anwar (Department of Microbiology, University of Dhaka, Dhaka 1000, Bangladesh) ,  Hossain M. Anwar (Vice-Chancellor, Jashore University of Science and Technology, Jashore 7408, Bangladesh)
資料名： Journal of Infection and Public Health  (Journal of Infection and Public Health)
巻： 15  号： 2  ページ： 156-163  発行年： 2022年 
JST資料番号： W3388A  ISSN： 1876-0341  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： バングラデシュは,2月,2021年および6か月以降,ChAdOx1 nCoV-19を導入し,他の低所得国のようなワクチン接種の1回または2回の接種を受けた。COVID-19感染は,免疫群と非免疫化群の間のSARS-CoV-2のゲノム変異に関する情報が利用できないにもかかわらず,場所全体にわたってロールを続けた。本研究の目的は,それらの群間の免疫逃避変異体の割合を比較することであった。全部で4718の鼻咽頭試料を3月1日から4月15日まで採取し,834(18%)はSARS-CoV-2陽性であった。最小サンプルサイズは,電話インタビューのためにランダムに選択され,同意を提供する108として計算された。SARS-CoV-2変異体の有病率と免疫化群の間の疾患重症度を測定した。全部で63のスパイク蛋白質配列と14の全ゲノム配列を両群から実施し,系統発生再構成と突然変異分析を比較した。全部で40人の回答者(37%,N=108)は単回投与と2人(2%)で,両用量のChAdOx1 nCoV-19ワクチンを投与し,乾燥咳,食欲の消失および呼吸の困難を,どれも有意に低下させた。入院,入院の期間,または,ランニング鼻,筋肉痛,呼吸の短さ,または免疫化と非免疫化群の間の全身衰弱のような他の症状の減少には,有意差が全くなかった。スパイク蛋白質配列は,免疫群における21(87.5%)B.1.351,1つのB.1.526および2つの20B変異体を,27(69%)B.1.351,5(13%)B.1.1.7,4(10%)20B,2B.1.526および1つのB.1.427変異体を単一免疫群と比較した。14症例の全ゲノム配列分析は,7つのB.1.351ベータV2,3つのB.11.7αV1,1つのB.1.526Etaおよび残りの3つの20B変異体を同定した。本研究は,ChAdOx1が単一用量で新しい感染または重度のCOVID-19疾患転帰を予防できず,一方,感染はバングラデシュにおけるB.1.351変異体によって主に引き起こされることを観察した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 電話 ,  *突然変異体 ,  *免疫 ,  ワクチン ,  系統発生 ,  *ゲノム ,  罹患率 ,  ウイルスタンパク質 ,  食欲 ,  予防接種 ,  単回投与
準シソーラス用語： *ゲノミクス ,  スパイク蛋白質 ,  ゲノム配列 ,  免疫回避 ,  重症度 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ChAdO_x1 nCoV-19 ,  COVID-19 ,  南アフリカの変異体 ,  B.1.351 ,  オックスフォード-アストラゼネカ

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  免疫療法薬・血液製剤の臨床への応用  (GW22020O)

タイトルに関連する用語 (7件)： バングラデシュ ,  免疫 ,  患者 ,  同定 ,  懸念 ,  変異体 ,  ゲノム解析