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J-GLOBAL ID：202202233260654561   整理番号：22A1178671

バイオインフォマティクス解析による頭蓋内動脈瘤破裂に対する潜在的コア遺伝子の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of Potential Core Genes for the Rupture of Intracranial Aneurysms by a Bioinformatics Analysis

著者 (5件)： Lin Yuan (Changzhou Hospital of Traditional Chinese Medicine, Changzhou, China) ,  Ma Hai-Ying (Changzhou Hospital of Traditional Chinese Medicine, Changzhou, China) ,  Wang Yi (Changzhou Hospital of Traditional Chinese Medicine, Changzhou, China) ,  He Jiang (Changzhou Hospital of Traditional Chinese Medicine, Changzhou, China) ,  Liu Heng-Jian (Changzhou Hospital of Traditional Chinese Medicine, Changzhou, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 875007  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:剖検および血管造影を用いた以前の研究は,ポピュレーションの3.6~6%が頭蓋内動脈瘤を有し,動脈瘤破裂が患者の脳機能不全または死亡を生じることを示す。【方法】動脈瘤破裂のための潜在的予防標的遺伝子を探究するために,GEOデータベースに由来する3つの遺伝子発現データセット(GSE13353,GSE15629およびGSE54083)を分析した。Rパッケージによる動脈瘤の非破裂と関連するDEGを確認した。DAVIDバージョンは,GOとKEGG経路を含む関連遺伝子の機能的分類と注釈分析を提供する。これらのDEGのPPIをストリングデータベースに基づいて分析し,Cytoscopeソフトウェアにより可視化した。DEGは,患者から分離した試料を用いたqRT-PCRにより検証された。【結果】96の上方制御された遺伝子と153の下方制御された遺伝子を含む249の重複DEGを,Vennダイアグラムウェブトオールを用いてスクリーニングした。GO項とKEGG経路分析結果は,これらのDEGが主に蛋白質リン酸化,アポトーシス過程,およびBP項と焦点接着,甲状腺ホルモンシグナル伝達経路,ErbBシグナル伝達経路,サイトカイン-サイトカイン受容体相互作用,およびKEGG経路におけるいくつかの疾患過程における炎症応答に富んでいることを示す。6つの候補は,APP,JUN,GSK3B,ErbB2,PPBPおよびTHBS1を含むCytoscapeソフトウェアおよびqRT-PCRによって確認し,著者らのデータおよび以前の研究は,ErbB2およびTHBS1が動脈瘤破裂を予防するために重要であることを示し,一方,APP,JUN,GSK3BおよびPPBPは反対の役割を果たし,そして,これらの知見を検証するために,更なる実験が必要である。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  データベース ,  *遺伝子 ,  可視化 ,  ソフトウェア ,  患者 ,  *動脈瘤 ,  剖検 ,  遺伝子発現 ,  *脳動脈瘤 ,  サイトカイン ,  アポトーシス ,  アノテーション
準シソーラス用語： KEGG ,  Rパッケージ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： バイオインフォマティクス解析 ,  破裂 ,  未破裂動脈瘤 ,  差次的発現遺伝子 ,  遺伝子発現オムニバス

分類 (5件)： 循環系疾患の外科療法  (GJ05030X) ,  神経系の疾患  (GN03000O) ,  術後処置・予後  (GC07050M) ,  循環系疾患の治療一般  (GJ05010B) ,  神経系疾患の外科療法  (GN05030J)

引用文献 (49件)：

• AdamsJ. C., LawlerJ. (2011). The Thrombospondins. Cold Spring Harbor Perspect. Biol. 3, a009712. doi: 10.1101/cshperspect.a009712
• ApostolakisS., SpandidosD. (2013). Chemokines and Atherosclerosis: Focus on the CX3CL1/CX3CR1 Pathway. Acta Pharmacol. Sin 34, 1251-1256. doi: 10.1038/aps.2013.92
• BeurelE., GriecoS. F., JopeR. S. (2015). Glycogen Synthase Kinase-3 (GSK3): Regulation, Actions, and Diseases. Pharmacol. Ther. 148, 114-131. doi: 10.1016/j.pharmthera.2014.11.016
• ChenZ., SongS., ZhuJ., LaiX. (2020). Regulatory Mechanism of MiR-21 in Formation and Rupture of Intracranial Aneurysm through JNK Signaling Pathway-Mediated Inflammatory Response. Int. J. Clin. Exp. Pathol. 13, 1834-1841. doi: 10.1016/j.pharmthera.2014.11.016
• CuiY., ZhangY., ZhaoX., ShaoL., LiuG., SunC., et al (2021). ACSL4 Exacerbates Ischemic Stroke by Promoting Ferroptosis-Induced Brain Injury and Neuroinflammation. Brain Behav. Immun. 93, 312-321. doi: 10.1016/j.bbi.2021.01.003

タイトルに関連する用語 (6件)： バイオインフォマティクス解析 ,  頭蓋内動脈瘤 ,  破裂 ,  コア ,  遺伝子 ,  同定