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J-GLOBAL ID：202202233305965612   整理番号：22A1177709

遺伝的多様性と個体群構造はインド亜大陸におけるPuccinia graminis f.sp.triticiの潜在遺伝的変異と長距離移動を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Genetic Diversity and Population Structure Reveal Cryptic Genetic Variation and Long Distance Migration of Puccinia graminis f. sp. tritici in the Indian Subcontinent

著者 (8件)： Prasad Pramod (ICAR-Indian Institute of Wheat and Barley Research, Regional Station, Shimla, India) ,  Thakur Rajni Kant (ICAR-Indian Institute of Wheat and Barley Research, Regional Station, Shimla, India) ,  Savadi Siddanna (ICAR-Directorate of Cashew Research, Puttur, India) ,  Bhardwaj Subhash Chander (ICAR-Indian Institute of Wheat and Barley Research, Regional Station, Shimla, India) ,  Gangwar Om Prakash (ICAR-Indian Institute of Wheat and Barley Research, Regional Station, Shimla, India) ,  Lata Charu (ICAR-Indian Institute of Wheat and Barley Research, Regional Station, Shimla, India) ,  Adhikari Sneha (ICAR-Indian Institute of Wheat and Barley Research, Regional Station, Shimla, India) ,  Kumar Subodh (ICAR-Indian Institute of Wheat and Barley Research, Regional Station, Shimla, India)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 13  ページ： 842106  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Puccinia graminis f.sp.tritici(Pgt)によって引き起こされる茎さび病は,タイムイマリーの時期から世界的にコムギの壊滅的な病気である。いくつかのコムギ茎さび病発生がインドを含む世界中で報告されている。中央および半島のインドのおよそ7mhaのコムギ地域は,茎さび病の流行に高度に脆弱である。本研究では,37の再現可能な多型SSRマーカーを用いて,それらの病原性表現型および単純配列反復(SSR)遺伝子型を調査することによって,2つの地理的領域を代表する29の単遺伝子型のウエドスポラ病原型のリポジトリを特徴づけ,その内の32は≧0.50の多型情報量(PIC)値を有した。病原性表現型を用いて病原性頻度(VF)を評価し,これらの病原型の仮想進化階層を構築した。Pgt個体群の進化パターンを説明するために7つの系統を投影した。これらの病原型のVFは0%と100%の間であった。病原性に基づく隣接結合(NJ)クラスター分析は,Pgt病原型を5つの病原性群に分類した。同様に,5つの分子群を分子遺伝子型を用いて分類した。分子グルーピングは主座標分析(PCoA)によって支持され,最初の2軸が寄与した累積分散の25%を明らかにした。分子変動(AMOVA)の解析は,個体群内および個体群内の変動のそれぞれ8および92%を明らかにした。Mantel試験は,病原性表現型とSSR遺伝子型の間で,陽性だが弱い相関(R2=0.15)を確認した。異なる遺伝的多様性パラメータ(Na,Ne,I,He,uHeおよび%P)の最高値および最低値は,MaharashtraおよびUttar PradeshからのPgt個体群における最大および最小変動性を明らかにした。個体群構造解析は29のPgt病原型を2つの亜集団と混和物にクラスタ化した。著者らの結果は,遺伝子流動によって補完された長距離分散能力から生じるPgt病原型の間に著しい遺伝的多様性があることを示した。これらの知見から,病原性パターン,遺伝的変異,およびPgt病原型の進化の可能性への洞察が得られ,これは戦略的茎さび病耐性育種を支援するであろう。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子型 ,  コムギ ,  表現型 ,  *変異 ,  クラスタ化 ,  育種 ,  病原性 ,  クラスタ分析 ,  さび病 ,  *個体群 ,  半島
準シソーラス用語： *個体群構造 ,  マイクロサテライトマーカー ,  病原型 ,  *遺伝的変異 ,  主座標分析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： コムギ ,  茎さび病 ,  病原性表現型 ,  SSR遺伝子型 ,  遺伝的多様性 ,  進化

分類 (2件)： 麦  (FC03033M) ,  菌類による植物病害  (FC04052Y)

引用文献 (75件)：

• Abebe T., Woldeab G., Dawit W. (2012). Distribution and physiologic races of wheat stem rust in Tigray, Ethiopia. J. Plant Pathol. Microbiol. 3 1-6.
• Anderson J., Lubberstedt T. (2003). Functional markers in plants. Trends Plant Sci. 8 554-560. doi: 10.1016/j.tplants.2003.09.010
• Anderson J. A., Churchil G. A., Autrique J. E., Tanksley S. O., Sorrels M. E. (1993). Optimizing parent selection for genetic linkage maps. Genome 36 181-186. doi: 10.1139/g93-024
• Anonymous (1982). “Annual Report” Plant Breeding Institute. Sydney: University of Sydney. doi: 10.1139/g93-024
• Bahadur P., Nagarajan S., Nayar S. K. (1985a). A proposed system for virulence designation in India to Puccinia graminis f. sp. tritici. Proc. Indian Acad. Sci. 95 29-33. doi: 10.1139/g93-024

タイトルに関連する用語 (7件)： 遺伝的多様性 ,  個体群構造 ,  インド ,  大陸 ,  Puccinia ,  遺伝的変異 ,  長距離