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J-GLOBAL ID：202202233319118083   整理番号：22A1027842

食道扁平上皮癌患者における免疫微小環境,予後および治療効果を推定するためのTRPチャネル関連遺伝子の包括的解析【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive Analysis of TRP Channel-Related Genes for Estimating the Immune Microenvironment, Prognosis, and Therapeutic Effect in Patients With Esophageal Squamous Cell Carcinoma

著者 (7件)： Zhao Fangchao (1Department of Thoracic Surgery, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, China) ,  Gao Shaolin (1Department of Thoracic Surgery, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, China) ,  Qin Xuebo (2Department of Thoracic Surgery, Hebei Chest Hospital, Shijiazhuang, China) ,  Niu Ren (3Department of Oncology, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, China) ,  Li Zhirong (4Clinical Laboratory Center, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, China) ,  Wang Chuan (5The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, China) ,  Li Shujun (1Department of Thoracic Surgery, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, China)
資料名： Frontiers in Cell and Developmental Biology (Web)  (Frontiers in Cell and Developmental Biology (Web))
巻： 10  ページ： 820870  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7062A  ISSN： 2296-634X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 2021年の生理学または医学におけるNobel Prizedは,温度感受性受容体(TRPチャンネル)および触覚受容体(Piezoチャンネル)の発見のためにArdem PatapoutianおよびDavid Juliusに向かい,両者は以前に未知であった。TRPチャンネルは温度を検出するヒト能力の心臓にあり,それらは癌の発生と進行で重要な調節機能も果たす。これにもかかわらず,食道扁平上皮癌(ESCC)の個人におけるTRPチャンネルの予後的意義に関する研究はない。GEOおよびTCGAコホートにおいて,MSigDBデータベースおよびKEGGデータベースから抽出した18のTRPチャンネル関連差次的発現遺伝子(DEG)に基づいて,教師なしクラスタリングを最初に行った。2つのTRPサブタイプを同定し,サブタイプBの患者は2つのサブタイプの中で最良の予後を有した。病期分類と等級づけにおける有意差は,異なるサブタイプの間に存在した。GEOコホートにおいて,単変量Cox分析を行って,予後関連遺伝子をスクリーニングした。7つの署名関連遺伝子を含むTRPチャンネル関連予後シグネチャを,最小絶対収縮と選択オペレータ(LASSO)Cox回帰により構築した。患者はリスクスコア中央値により高リスク群と低リスク群に分けられた。GEOおよびTCGAコホートにおいて,受信者動作特性(ROC)曲線,主成分分析(PCA)および単変量および多変量Cox回帰を行い,署名の妥当性を確認した。リスク署名に基づくTMEのより詳細な研究に続いて,高リスク群はより高い免疫細胞浸潤とより低い腫瘍純度を有し,悪い予後を示した。リスクスコアが高い患者は免疫チェックポイント発現も増加し,これらの患者は他の患者よりも免疫療法から恩恵を受ける可能性が高いことを示した。また,パクリタキセル,シスプラチンおよび5-フルオロウラシルは,低リスクスコアESCC患者の治療において,より良好な反応を示した。また,本研究はGTExとqRT-PCRを採用して実験的検証プロセスを実施した。要約すると,TRPチャンネル関連予後シグネチャを同定した。このシグネチャはESCCの予後と免疫微小環境を予測することができる。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 触覚 ,  データベース ,  心臓 ,  *遺伝子 ,  腫瘍 ,  受容体 ,  ヒト ,  免疫療法 ,  シスプラチン ,  *予後 ,  母集団 ,  主成分分析 ,  脂環式化合物 ,  脂肪酸 ,  芳香族カルボン酸 ,  酸素複素環化合物 ,  オレフィン化合物 ,  架橋化合物 ,  カルボン酸エステル ,  アミノアルコール ,  アミノカルボン酸 ,  第二アルコール ,  ヒドロキシ酸 ,  ヒドロキシケトン ,  ポリオール ,  窒素複素環化合物 ,  有機フッ素化合物 ,  ウレア化合物 ,  ヒドロキシ化合物
準シソーラス用語： *微小環境 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 食道扁平上皮癌 ,  TRPチャネル関連遺伝子 ,  予後シグネチャ ,  免疫微小環境 ,  TCGA

分類 (1件)： 細胞膜の輸送  (EF04020R)

物質索引 (2件)： パクリタキセル ,  フルオロウラシル

引用文献 (29件)：

• AbnetC. C., ArnoldM., WeiW.-Q. (2018). Epidemiology of Esophageal Squamous Cell Carcinoma. Gastroenterology 154 (2), 360-373. doi: 10.1053/j.gastro.2017.08.023
• AdamsB. D., WaliV. B., ChengC. J., InukaiS., BoothC. J., AgarwalS., et al (2016). miR-34a Silences C-SRC to Attenuate Tumor Growth in Triple-Negative Breast Cancer. Cancer Res. 76 (4), 927-939. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-15-2321
• AnandavadivelanP., LagergrenP. (2016). Cachexia in Patients with Oesophageal Cancer. Nat. Rev. Clin. Oncol. 13 (3), 185-198. doi: 10.1038/nrclinonc.2015.200
• AndersonK. J., CormierR. T., ScottP. M. (2019). Role of Ion Channels in Gastrointestinal Cancer. World J. Gastroenterol. 25 (38), 5732-5772. doi: 10.3748/wjg.v25.i38.5732
• BingZ., ChengZ., ShiD., LiuX., TianJ., YaoX., et al (2018). Investigate the Mechanisms of Chinese Medicine Fuzhengkangai towards EGFR Mutation-Positive Lung Adenocarcinomas by Network Pharmacology. BMC Complement. Altern. Med. 18 (1), 293. doi: 10.1186/s12906-018-2347-x

タイトルに関連する用語 (9件)： 食道扁平上皮癌 ,  患者 ,  免疫微小環境 ,  予後 ,  治療効果 ,  推定 ,  TRPチャネル ,  遺伝子 ,  解析