文献

J-GLOBAL ID：202202233544208756   整理番号：22A1024584

Aralia elataの高品質参照ゲノム配列と遺伝的形質転換システム【JST・京大機械翻訳】

A High-Quality Reference Genome Sequence and Genetic Transformation System of Aralia elata

著者 (7件)： Liu Wenxuan (State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, Northeast Forestry University, Harbin, China) ,  Guo Wenhua (Key Laboratory of Saline-Alkali Vegetation Ecology Restoration, Ministry of Education, Northeast Forestry University, Harbin, China) ,  Chen Song (State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, Northeast Forestry University, Harbin, China) ,  Xu Honghao (Key Laboratory of Saline-Alkali Vegetation Ecology Restoration, Ministry of Education, Northeast Forestry University, Harbin, China) ,  Zhao Yue (Key Laboratory of Saline-Alkali Vegetation Ecology Restoration, Ministry of Education, Northeast Forestry University, Harbin, China) ,  Chen Su (State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, Northeast Forestry University, Harbin, China) ,  You Xiangling (Key Laboratory of Saline-Alkali Vegetation Ecology Restoration, Ministry of Education, Northeast Forestry University, Harbin, China)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 13  ページ： 822942  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Aralia elataはAraliaceae科のAralia属の多年生木質植物である。サポニンは豊富であり,従って広範囲の薬理効果を有している。ここでは,PacBio HiFi配列決定技術により生産された,1.21Gbのゲノムサイズと51.34MbのコンティグN50を有するA.elataの高品質参照ゲノムを報告する。これはAralia属の最初のゲノム集合である。ゲノム進化解析により,A.elataゲノムにおける系統発生と全ゲノム重複(WGD)事象を調べた。結果は,最近のWGD事象がA.elataゲノムにおいて起こったことを示した。発散時間の推定は,WGDがAraliaceaeによって共有されるかもしれないことを示した。A.elataのゲノム配列を分析し,3つの組織からトランスクリプトームデータを結合することにより,トリテルペンサポニン生合成に関連する重要な遺伝子を発見した。さらに,著者らの研究室で確立されたA.elataの胚カルス誘導システムに基づいて,著者らはこの植物の形質転換システムを構築した。本研究で得られたゲノム資源と遺伝的形質転換システムは,A.elataへの洞察を提供し,A.elata調節機構の更なる探索の基礎を築く。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： リグニン ,  生合成 ,  遺伝子 ,  *ヌクレオチド配列 ,  薬理作用 ,  系統発生 ,  *ゲノム ,  サポニン ,  代謝経路 ,  分子進化 ,  *タラノキ属 ,  遺伝子重複 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *Aralia elata ,  *ゲノム配列 ,  コンティグ ,  生合成経路 ,  ゲノム進化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Aralia elata ,  ゲノムアセンブリ ,  進化解析 ,  テルペノイド生合成経路 ,  トランスジェニックシステム

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (48件)：

• Ahn D. (1998). Illustrated Book of Korean Medicinal Herbs. Seoul (Korea): Kyo-hak Publishing Co., 107.
• Blanc G., Wolfe K. H. (2004). Widespread paleopolyploidy in model plant species inferred from age distributions of duplicate genes. Plant Cell 16, 1667-1678. doi: , PMID: doi: 10.1105/tpc.021345
• Camacho C., Coulouris G., Avagyan V., Ma N., Papadopoulos J., Bealer K., et al. (2009). BLAST+: architecture and applications. BMC Bioinformatics 10:421. doi: , PMID: doi: 10.1186/1471-2105-10-421
• Carelli M., Biazzi E., Panara F., Tava A., Scaramelli L., Porceddu A., et al. (2011). Medicago truncatula CYP716A12 is a multifunctional oxidase involved in the biosynthesis of hemolytic saponins. Plant Cell 23, 3070-3081. doi: , PMID: doi: 10.1105/tpc.111.087312
• Chen C., Chen H., Zhang Y., Thomas H. R., Frank M. H., He Y., et al. (2020). TBtools: an integrative toolkit developed for interactive analyses of big biological data. Mol. Plant 13, 1194-1202. doi: , PMID: doi: 10.1016/j.molp.2020.06.009

タイトルに関連する用語 (4件)： Aralia ,  高品質 ,  参照ゲノム ,  遺伝的形質転換