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J-GLOBAL ID：202202233649326822   整理番号：22A0313043

Rhizophagus proliferusゲノム配列はAM菌類の遺伝的形質の保存を反復するが,より高い腐生活性を予測する【JST・京大機械翻訳】

Rhizophagus proliferus genome sequence reiterates conservation of genetic traits in AM fungi, but predicts higher saprotrophic activity

著者 (4件)： Singh Pushplata Prasad (TERI-Deakin Nanobiotechnology Centre, TERI Gram, The Energy and Resources Institute, Gurgaon, Haryana, India) ,  Srivastava Divya (TERI-Deakin Nanobiotechnology Centre, TERI Gram, The Energy and Resources Institute, Gurgaon, Haryana, India) ,  Shukla Sadhana (TERI-Deakin Nanobiotechnology Centre, TERI Gram, The Energy and Resources Institute, Gurgaon, Haryana, India) ,  Varsha (TERI-Deakin Nanobiotechnology Centre, TERI Gram, The Energy and Resources Institute, Gurgaon, Haryana, India)
資料名： Archives of Microbiology  (Archives of Microbiology)
巻： 204  号： 1  ページ： 105  発行年： 2022年 
JST資料番号： A0450A  ISSN： 0302-8933  CODEN： AMICCW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： アーバスキュラー菌根(AM)菌類は陸生植物の遍在性内部共生である。それは,植物が土壌からより多くの栄養分を抽出して,種々の生態学的ストレス因子に対する植物耐性を強化するのを助ける。AM菌類ゲノム配列は,宿主植物との相互作用に対する異なる生息場所と機構への適応に重要である遺伝子レパートリーの同定を助ける。本研究は,農業目的のための生物肥料コンソーシアムに存在する重要なAM種であるRhizophagusプロライフラスのゲノム配列の最初のドラフトから成る。R.prolifeusの推定ゲノムサイズは,ΔΨ110Mbpsであり,そのゲノム集合は94.35%完全であった。ゲノムマイニングを行い,生物学的機能に重要な推定遺伝子ファミリーを同定した。全部で22,526の蛋白質コード遺伝子をゲノムで推定し,他の真菌クラスと比較して,キナーゼの豊度とグリコシドヒドロラーゼの数の減少があった。R.prolifeusゲノムにおける顕著な知見は,炭水化物エステラーゼ(CE)の数が多く,これは以前に報告されたAM菌と比較して,この種におけるより高いサプロトローフ活性の存在を示唆する可能性があり,これは植物と土壌無機栄養素の間のリンクとしての役割を示すかもしれない。ここで提示したR.prolifurusのゲノム配列とアノテーションは,将来のバイオ肥料製剤の開発に必要な機能的ゲノミクス研究のための重要な参照として役立つであろう。さらに,本研究からの知見は,宿主特異的相互作用および関連する農業利益を支配するAM菌類における分子機構の解読においても重要であるかもしれない。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *遺伝 ,  遺伝子 ,  栄養素 ,  グリコシド結合ヒドロラーゼ ,  独立栄養 ,  宿主 ,  タンパク質 ,  *ヌクレオチド配列 ,  *ゲノム ,  真菌類 ,  土壌 ,  アノテーション
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  *アーバスキュラー菌根菌 ,  *ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Rhizophagus proliferus ,  全ゲノム配列 ,  比較ゲノミクス ,  遺伝子レパートリー

分類 (4件)： 微生物生理一般  (EG03051L) ,  代謝と栄養  (EG03054K) ,  酵素生理  (EG03052C) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (9件)： Rhizophagus ,  ゲノム配列 ,  AM菌 ,  遺伝 ,  形質 ,  保存 ,  反復 ,  活性 ,  予測