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J-GLOBAL ID：202202234148634900   整理番号：22A1028514

収穫前環境サンプルにおける多剤耐性Escherichia coli病原型の高レベル:新鮮生産関連疾病発生のためのダニ化時間爆弾【JST・京大機械翻訳】

High Levels of Multi Drug Resistant Escherichia coli Pathovars in Preharvest Environmental Samples: A Ticking Time Bomb for Fresh Produce Related Disease Outbreak

著者 (9件)： Iwu Chidozie Declan (1SAMRC Microbial Water Quality Monitoring Centre, University of Fort Hare, Alice, South Africa) ,  Iwu Chidozie Declan (2Applied and Environmental Microbiology Research Group, Department of Biochemistry and Microbiology, University of Fort Hare, Alice, South Africa) ,  Kayode Adeoye John (1SAMRC Microbial Water Quality Monitoring Centre, University of Fort Hare, Alice, South Africa) ,  Kayode Adeoye John (2Applied and Environmental Microbiology Research Group, Department of Biochemistry and Microbiology, University of Fort Hare, Alice, South Africa) ,  Igere Bright Esegbuyota (2Applied and Environmental Microbiology Research Group, Department of Biochemistry and Microbiology, University of Fort Hare, Alice, South Africa) ,  Igere Bright Esegbuyota (3Department of Microbiology and Biotechnology, Western Delta University, Oghara, Nigeria) ,  Okoh Anthony Ifeanyin (1SAMRC Microbial Water Quality Monitoring Centre, University of Fort Hare, Alice, South Africa) ,  Okoh Anthony Ifeanyin (2Applied and Environmental Microbiology Research Group, Department of Biochemistry and Microbiology, University of Fort Hare, Alice, South Africa) ,  Okoh Anthony Ifeanyin (4Department of Environmental Health Sciences, University of Sharjah, Sharjah, United Arab Emirates)
資料名： Frontiers in Environmental Science (Web)  (Frontiers in Environmental Science (Web))
巻： 10  ページ： 858964  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7070A  ISSN： 2296-665X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 収穫前環境は多剤耐性病原性細菌の出現と普及のための適切なプラットフォームを提供する。これは公衆衛生に有害であり,食物網へ移行した場合,生鮮食品関連疾病発生につながる可能性がある。本研究では,南アフリカの東部カペ州における生鮮生産農場における灌漑用水および農業土壌サンプルから回収した大腸菌(E.coli)の病原性菌株の発生およびアンチビグラムフィンガープリントを評価した。E.coliを分離し,病原型で,標準培養および分子法を用いて抗ビオグラムフィンガープリントをスクリーニングした。アンチビグラムに基づくK-平均クラスター分析と隣接結合系統樹を用いて,分離株の関連性を解明した。確認された分離菌のうち,37%は,腸および腸外E.coliの病原体をコードするスクリーニングされた病原性遺伝子(VG)の少なくとも1つを所有した。すべてのサンプルにおける最も一般的な病原型/関連VGは,腸管出血性大腸菌/stx2であった。試験したすべての抗菌剤の中で,E.coliの病原性は,農業土壌から,灌漑用水からの病原菌の中央値単一抗菌剤耐性(AMR)指数0.23(IQR:0.10-0.38,95%CI:0.16-0.27),および病原菌の0.01(IQR:0.01-0.03,95%CI:0.01-0.03)のアンピシリンに対して最も高い耐性を与えた。灌漑用水および農業土壌からの病原菌の約60および20%は,それぞれ0.41(IQR:0.25~0.52,95%CI:0.31~0.47)および0.38(IQR:0.23~0.66,95%CI:0.19~0.69)の中央値多重AMR指数で多剤耐性であった。検出された最も一般的な耐性遺伝子は,すべてのサンプルタイプにわたってsulI,catII,tetAおよびAmpCであった。bla_TEMは,検出された最も一般的な拡張スペクトルβ-ラクタマーゼ耐性遺伝子であった。灌漑用水サンプル,r=0.6,p≦0.01および農業土壌サンプル,r=0.8,p≦0.01における病原性の表現型と遺伝子型AMRプロファイルの間の正相関を記録した。アンチビグラムベースの系統樹は,それぞれ灌漑水および農業土壌サンプルから11および7クレードを生成し,分離株が高度に多様化していることを示した。この知見は,収穫前環境における高度に多様化した多剤耐性E.coli pathvarsの発生を明らかにし,潜在的な公衆衛生上の脅威を示した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子型 ,  抗細菌薬 ,  表現型 ,  系統樹 ,  病原性 ,  農場 ,  公衆衛生 ,  クラスタ分析 ,  *収穫 ,  病原体 ,  生鮮食品 ,  β-ラクタマーゼ ,  *多剤耐性 ,  アミノ酸 ,  芳香族化合物 ,  ラクタム ,  硫黄複素環化合物 ,  第一アミン
準シソーラス用語： 分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 環境 ,  抗生物質耐性 ,  公衆衛生 ,  病気の発生 ,  微生物疾患

分類 (3件)： 食品の汚染  (FJ01053P) ,  野菜とその加工品  (FJ11020O) ,  微生物検査法  (EG02020G)

物質索引 (1件)： アンピシリン

引用文献 (54件)：

• AhadN. A., YinT. S., AbdulR. O., YaacobC. R. (2011). Sensitivity of Normality Tests to Non-normal Data (Kepekaan Ujian Kenormalan Terhadap Data Tidak Normal). Sains Malaysiana. 40, 637-641.
• AijukaM., SantiagoA. E., GirónJ. A., NataroJ. P., BuysE. M. (2018). Enteroaggregative Escherichia coli Is the Predominant Diarrheagenic E. coli Pathotype Among Irrigation Water and Food Sources in South Africa. Int. J. Food Microbiol. 278, 44-51. doi: 10.1016/J.IJFOODMICRO.2018.04.018
• AmatoM., DasíD., GonzálezA., FerrúsM. A., CastilloM. Á. (2021). Occurrence of Antibiotic Resistant Bacteria and Resistance Genes in Agricultural Irrigation Waters from Valencia City (Spain). Agric. Water Management. 256, 107097. doi: 10.1016/J.AGWAT.2021.107097
• AraújoS., A.T. SilvaI. I., TacãoM., PatinhaC., AlvesA., HenriquesI. (2017). Characterization of Antibiotic Resistant and Pathogenic Escherichia coli in Irrigation Water and Vegetables in Household Farms. Int. J. Food Microbiol. 257, 192-200. doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2017.06.020
• BolukaotoJ. Y., SinghA., AlfineteN., BarnardT. G. (2021). Occurrence of Hybrid Diarrhoeagenic Escherichia coli Associated with Multidrug Resistance in Environmental Water, Johannesburg, South Africa. Microorganisms. 9, 2163. doi: 10.3390/MICROORGANISMS9102163

タイトルに関連する用語 (8件)： 収穫 ,  環境サンプル ,  多剤耐性 ,  Escherichia ,  病原型 ,  高レベル ,  疾病 ,  爆弾