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J-GLOBAL ID：202202234595767485   整理番号：22A1025785

皮膚黒色腫における細胞溶解活性に基づく新規分子治療標的の同定とそれらの潜在的予後バイオマーカー【JST・京大機械翻訳】

Identification of Novel Molecular Therapeutic Targets and Their Potential Prognostic Biomarkers Based on Cytolytic Activity in Skin Cutaneous Melanoma

著者 (8件)： Zhang Haoxue (1Department of Dermatovenerology, The First Affiliated Hospital of Anhui Medical University, Hefei, China) ,  Zhang Haoxue (2Key Laboratory of Dermatology, Ministry of Education, Hefei, China) ,  Zhang Haoxue (3Inflammation and Immune Mediated Diseases Laboratory of Anhui Province, Anhui Medical University, Hefei, China) ,  Liu Yuyao (4Department of Burns, The First Affiliated Hospital of Anhui Medical University, Hefei, China) ,  Hu Delin (4Department of Burns, The First Affiliated Hospital of Anhui Medical University, Hefei, China) ,  Liu Shengxiu (1Department of Dermatovenerology, The First Affiliated Hospital of Anhui Medical University, Hefei, China) ,  Liu Shengxiu (2Key Laboratory of Dermatology, Ministry of Education, Hefei, China) ,  Liu Shengxiu (3Inflammation and Immune Mediated Diseases Laboratory of Anhui Province, Anhui Medical University, Hefei, China)
資料名： Frontiers in Oncology (Web)  (Frontiers in Oncology (Web))
巻： 12  ページ： 844666  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7089A  ISSN： 2234-943X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 皮膚黒色腫(SKCM)は,その非常に高い悪性度のために世界中で注目を集めている。新規用語細胞溶解活性(CYT)は,腫瘍における対調節免疫応答および予後増強に関連する潜在的免疫療法バイオマーカーとして導入されている。本研究では,SKCM患者のすべてのデータセット,すなわち,癌ゲノムアトラス(TCGA)データベースおよび遺伝子発現Omnibus(GEO)データベースからのRNA配列決定データおよび臨床情報を抽出し,CYTの864の差次的発現遺伝子(DEG)特性を得て,SKCM患者の分子サブタイプを分類するために非陰性マトリックス因子分解(NMF)法を使用した。すべての遺伝子の中で,SKCMの予後に密接に関連する14のハブ遺伝子を最終的にスクリーニングした。これらの遺伝子に基づいて,14遺伝子予後リスクモデルを構築し,そのロバスト性と強い予測性能をさらに検証した。続いて,腫瘍病因と予後の根底にある機構は,多くの展望,すなわち,腫瘍変異負荷(TMB),コピー数変化(CNV),腫瘍微小環境(TME),浸潤免疫細胞,遺伝子セット濃縮分析(GSEA)および免疫チェックポイント阻害剤(ICIs)から定義されている。さらに,GTExデータベースとHPAデータベースと組み合わせて,モデルにおける遺伝子の発現を転写レベルと蛋白質レベルで確認し,モデルにおける遺伝子の相対的重要性をランダムフォレストアルゴリズムによって記述した。さらに,モデルを用い,化学療法および免疫療法に対するSKCM患者の感受性の違いを予測した。最後に,ノモグラムを構築し,臨床診断をよりよく支援した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  データベース ,  浸潤 ,  RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  腫瘍 ,  免疫反応 ,  薬物療法 ,  免疫療法 ,  *予後 ,  遺伝子発現 ,  *バイオマーカー ,  病因
準シソーラス用語： ランダムフォレスト ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 皮膚黒色腫 ,  細胞溶解活性 ,  遺伝子 ,  予後 ,  治療 ,  臨床指針

分類 (4件)： 皮膚の腫よう  (GF04000X) ,  腫よう免疫  (ED03040A) ,  腫ようの診断  (GE03020J) ,  発癌機序・因子  (GE02020C)

引用文献 (88件)：

• Rebecca VW, Somasundaram R, Herlyn M. Pre-Clinical Modeling of Cutaneous Melanoma. Nat Commun (2020) 11(1):2858. doi: doi: 10.1038/s41467-020-15546-9
• Ellison PM, Zitelli JA, Brodland DG. Mohs Micrographic Surgery for Melanoma: A Prospective Multicenter Study. J Am Acad Dermatol (2019) 81(3):767-74. doi: doi: 10.1016/j.jaad.2019.05.057
• Raigani S, Cohen S, Boland GM. The Role of Surgery for Melanoma in an Era of Effective Systemic Therapy. Curr Oncol Rep (2017) 19(3):17. doi: doi: 10.1007/s11912-017-0575-8
• Wada-Ohno M, Ito T, Furue M. Adjuvant Therapy for Melanoma. Curr Treat Options Oncol (2019) 20(8):63. doi: doi: 10.1007/s11864-019-0666-x
• Mishra H, Mishra PK, Ekielski A, Jaggi M, Iqbal Z, Talegaonkar S. Melanoma Treatment: From Conventional to Nanotechnology. J Cancer Res Clin Oncol (2018) 144(12):2283-302. doi: doi: 10.1007/s00432-018-2726-1

タイトルに関連する用語 (8件)： 皮膚黒色腫 ,  細胞溶解 ,  活性 ,  分子治療 ,  標的 ,  同定 ,  予後 ,  バイオマーカー