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J-GLOBAL ID:202202234817184040   整理番号:22A1177475

肺腺癌の予後モデルとしての乳酸代謝関連lncRNAシグネチャの開発と検証【JST・京大機械翻訳】

Development and Validation of Lactate Metabolism-Related lncRNA Signature as a Prognostic Model for Lung Adenocarcinoma
著者 (7件):
資料名:
巻: 13  ページ: 829175  発行年: 2022年 
JST資料番号: U7068A  ISSN: 1664-2392  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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背景:肺癌は,世界的に癌関連死亡におけるその役割により,最近,最も優勢な組織学的形態である肺腺癌(LUAD)で,顕著な研究焦点である。それにもかかわらず,乳酸代謝関連長非コードRNA(LMR-lncRNA)の兆候は,LUAD患者のために開発されていない。従って,LUAD患者の予後を決定するユニークなLMR-lncRNAシグネチャを開発することを目的とした。方法:癌ゲノムアトラス(TCGA)と遺伝子発現Omnibus(GEO)データベースを用いてlncRNA発現パターンを誘導した。LMR-lncRNAの同定は,lncRNAとLMR遺伝子の間の共発現パターンを分析することによって達成された。続いて,lncRNAレベルと生存結果の間の関係を決定し,効果的なシグネチャを開発した。TCGAコホートにおいて,Cox回帰は,3つのLMR-lncRNAから成る革新的署名を構築するために登録され,GEO検証コホートにおいて検証された。GSEAと免疫浸潤分析を行い,各タイプの免疫細胞の機能と機能を調べた。結果:14の差次的発現LMR-lncRNAはLUAD患者の予後と強く相関し,新規LMR-lncRNAシグネチャを集合的に形成した。患者をLMR-lncRNAシグネチャに基づく2つのコホートに分類した:低リスクおよび高リスク群。高リスク群のLUAD患者の全生存率は,低リスク群より有意に低かった。Cox回帰を用いて,このシグネチャーは独立した予後因子として実質的な可能性を持ち,GEOコホートでさらに確認された。さらに,署名は,他の変数の間で,ステージ,年齢,および性別に基づいて,異なるグループにわたる生存を予想することができた。このシグネチャは免疫細胞浸潤(B細胞,好中球,CD4+T細胞,CD8+T細胞など)と免疫チェックポイント遮断標的CTLA-4とも相関した。結論:LUAD患者の生存を予想するのに有用な新しいLMR-lncRNAシグネチャを開発し,検証した。このシグネチャは,LUAD患者における免疫療法介入に対する潜在的に重要な洞察を提供する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
分類
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腫ようの化学・生化学・病理学  ,  遺伝子発現 
引用文献 (74件):
  • Bray F, Ferlay J, Soerjomataram I, Siegel RL, Torre LA, Jemal A. Global Cancer Statistics 2018: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries. CA Cancer J Clin (2018) 68:394-424. doi: doi: 10.3322/caac.21492
  • Relli V, Trerotola M, Guerra E, Alberti S. Abandoning the Notion of Non-Small Cell Lung Cancer. Trends Mol Med (2019) 25:585-94. doi: doi: 10.1016/j.molmed.2019.04.012
  • Spella M, Stathopoulos GT. Immune Resistance in Lung Adenocarcinoma. Cancers (Basel) (2021) 13:384. doi: doi: 10.3390/cancers13030384
  • Yang Z, Yin H, Shi L, Qian X. A Novel microRNA Signature for Pathological Grading in Lung Adenocarcinoma Based On TCGA and GEO Data. Int J Mol Med (2020) 45:1397-408. doi: doi: 10.3892/ijmm.2020.4526
  • Hirsch FR, Scagliotti GV, Mulshine JL, Kwon R, Curran WJ, Wu YL, et al. Lung Cancer: Current Therapies and New Targeted Treatments. Lancet (2017) 389:299-311. doi: doi: 10.1016/S0140-6736(16)30958-8
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