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J-GLOBAL ID：202202235712553651   整理番号：22A1023174

直腸スワブとColon含量の比較分析を用いた子豚の粘膜接着マイクロバイオームに及ぼす食餌の影響の評価【JST・京大機械翻訳】

Assessing the Impact of Diet on the Mucosa-Adhered Microbiome in Piglets Using Comparative Analysis of Rectal Swabs and Colon Content

著者 (2件)： Choudhury Raka (Host-Microbe Interactomics Group, Department of Animal Sciences, Wageningen University & Research, Wageningen, Netherlands) ,  Kleerebezem Michiel (Host-Microbe Interactomics Group, Department of Animal Sciences, Wageningen University & Research, Wageningen, Netherlands)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 13  ページ： 804986  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 以前に,直腸スワブは,若い子豚の腸微生物叢の評価に対し,糞便サンプリングに対する正当な代替法を提供することを示した。しかし,粘膜付着微生物集団は糞便試料に比べて直腸スワブで多く代表されるが,スワブ試料ごとに変化する程度であった。ここでは,離乳前の子豚における粘膜付着微生物叢に対する食事の影響を評価するため,直腸スワブにおける接着集団のこの可変濃縮を利用する可能性を検討した。直腸スワブと結腸内腔内容物のペアリングサンプルを,2つの独立した,しかし同様に設計された動物実験[n=28子ブタ(実験1),n=16子ブタ(実験2)],雌豚乳に加えてカスタマイズした繊維飼料にアクセスした早期給餌処理(EF)群,および雌豚の乳で排他的に飼育された対照(CON)群を含む,子ブタから採集した。”n=28子ブタ(実験1);n=16子ブタ(実験2)]。29日齢で採取した直腸スワブと結腸試料中の腸ミクロビオーム組成を,メタタキソノミー分析に供した。結果は,結腸と比較して直腸スワブで富化した識別分類群として,Escherichia-Shigella,Anaerococcus,Peptostrepococcus,Enterococcus,Trueperella,Actinomyces,およびPeptoniphilusを同定した。Escherichia-Shigella(10-11%平均相対豊度)とは別に,これらの粘膜付着微生物属のほとんどは比較的低い豊度を示した。直腸スワブ微生物叢は,より可変であり,これは粘膜付着微生物の多様な濃縮によると思われる。実験の1つによってほとんど独占的に駆動されたが,離乳後下痢関連分類群Escherichia-ShigellaはEF群に比べてCONに富んでおり,早期の摂食が子ブタにおける離乳後下痢関連問題を抑制することを示唆した。著者らの知見は,直腸スワブが子豚における食事療法の関数として粘膜付着微生物集団の調査を可能にすることを示す。これは,Escherichia-Shigellaのような付着微生物に関連する離乳後下痢の豊度を抑制する食事アプローチをさらに研究するための機会を提供する。さらに,対スワブコロニー微生物叢情報(動物サブセットから得た)は直腸スワブ試料中の粘膜付着集団または「粘膜因子」を予測でき,容易に得られる直腸スワブを用いた大型動物コホート研究における接着微生物叢の分析を促進することを示した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 飼料 ,  微生物 ,  結腸 ,  下痢 ,  *腸 ,  *直腸 ,  *粘膜 ,  ブタ ,  糞便 ,  摂食 ,  赤痢菌属 ,  Escherichia ,  ミクロフローラ ,  離乳
準シソーラス用語： *子豚 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 直腸スワブ ,  結腸 ,  粘膜性因子 ,  粘膜接着マイクロバイオーム ,  腸内微生物相 ,  ブタ ,  固体供給

分類 (2件)： 豚  (FD02040U) ,  特殊飼料  (FD07050O)

引用文献 (30件)：

• Burrough E. R., Arruda B. L., Plummer P. J. (2017). Comparison of the luminal and mucosa-associated microbiota in the colon of pigs with and without swine dysentery. Front. Vet. Sci. 4:139. doi: 10.3389/fvets.2017.00139
• Carroll I. M., Chang Y. H., Park J., Sartor R. B., Ringel Y. (2010). Luminal and mucosal-associated intestinal microbiota in patients with diarrhea-predominant irritable bowel syndrome. Gut. Pathog. 2 1-9. doi: 10.1186/1757-4749-2-19
• Choudhury R., Middelkoop A., Souza J. G., de, Veen L., van, Gerrits W. J., Kemp B., et al (2021b). Impact of early-life feeding on local intestinal microbiota and digestive system development in piglets. Sci. Rep. 11:4213. doi: 10.1038/s41598-021-83756-2
• Choudhury R., Middelkoop A., Boekhorst J., Gerrits W. J. J., Kemp B., Bolhuis J. E., et al (2021a). Early life feeding accelerates gut microbiome maturation and suppresses acute post-weaning stress in piglets. Environ. Microbiol. 23 7201-7213. doi: 10.1111/1462-2920.15791
• Choudhury R., Middelkoop A., Bolhuis J. E., Kleerebezem M. (2019). Legitimate and reliable determination of the age-related intestinal microbiome in young piglets; rectal swabs and fecal samples provide comparable insights. Front. Microbiol. 10:1886. doi: 10.3389/fmicb.2019.01886

タイトルに関連する用語 (9件)： 直腸 ,  スワブ ,  含量 ,  比較分析 ,  子豚 ,  粘膜接着 ,  マイクロバイオーム ,  食餌 ,  影響の評価