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J-GLOBAL ID：202202235726368479   整理番号：22A1024962

トリプルネガティブ乳癌における化学免疫療法応答を予測するためのRNA-SeqおよびScRNA-Seqを介したピロトーシス関連サブタイプの特性評価【JST・京大機械翻訳】

Characterization of Pyroptosis-Related Subtypes via RNA-Seq and ScRNA-Seq to Predict Chemo-Immunotherapy Response in Triple-Negative Breast Cancer

著者 (6件)： Li Chenlu (1Department of Gastroenterology, Affiliated Yueqing Hospital, Wenzhou Medical University, Wenzhou, China) ,  Pan Jingjing (2Department of Laboratory Medicine, The First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou, China) ,  Jiang Yinyan (3Department of Hematopathology, The First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou, China) ,  Wu Yanzhi (4Department of Rheumatology, The First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou, China) ,  Jin Zhenlin (3Department of Hematopathology, The First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou, China) ,  Chen Xupeng (1Department of Gastroenterology, Affiliated Yueqing Hospital, Wenzhou Medical University, Wenzhou, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 788670  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： トリプルネガティブ乳癌(TNBC)は,生物学的不均一性による免疫療法に対する予後不良および無効な治療反応と関連する。信頼できる指標,特に患者転帰を予測できる免疫療法関連バイオマーカーをスクリーニングする緊急の必要性がある。プログラム細胞死の炎症誘導型としてのピロプトーシスは,腫瘍抑制環境を創り,多発性腫瘍における化学療法応答を改善することが示されている。しかし,TNBCにおけるピロプトーシスの特異的治療効果は不明である。本研究では,異なる免疫学的および予後的特徴を有する2つのサブタイプ(クラスターAおよびクラスターB)にTNBCを有する119人の患者のピロプトーシス関連シグネチャによるコンセンサスクラスタ化を提示する。第1に,より良い転帰と関連するクラスタBは,有意に高いピロプトーシス関連シグネチャ発現,腫瘍微小環境予後スコア,および免疫療法チェックポイントのアップレギュレーションによって特徴付けられた。サブタイプ間の合計262の差次的発現遺伝子をさらに同定し,PsスコアをLASSOとCox回帰分析を用いて構築した。外部GEOデータセットは,低Psスコアのコホートが一貫して,ピロプトーシス関連シグネチャ,免疫細胞浸潤レベル,およびより良好な予後のより高い発現を有することを示した。加えて,外部免疫療法および化学療法コホートは,より低いPsスコアを有する患者が有意な治療反応および臨床的利点を示すことを明らかにした。他の臨床的特徴と組み合わせて,著者らはTNBC患者の生存率を効果的に予測するためにノモグラムを構築した。最後に,scRNA-seqデータセットを用いて,TNBCの細胞サブタイプの景観を検証し,miRNA-Psスコア遺伝子相互作用ネットワークを成功裏に構築した。これらの知見は,腫瘍ピロプトーシスの系統的評価とPsスコアの同定が潜在的臨床的意味を有し,TNBCのための最適な免疫療法戦略の調整を促進することを示した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 回帰分析 ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  炎症 ,  腫瘍 ,  薬物療法 ,  クラスタ ,  生存率 ,  *免疫療法 ,  予後 ,  母集団 ,  *乳房腫瘍 ,  アップレギュレーション ,  バイオマーカー
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  *トリプルネガティブ乳癌 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ピロトーシス ,  トリプルネガティブ乳癌 ,  分子サブタイプ ,  腫瘍微小環境 ,  予後 ,  単一細胞RNA配列決定

分類 (1件)： 腫ようの診断  (GE03020J)

引用文献 (54件)：

• AranD., LooneyA. P., LiuL., WuE., FongV., HsuA., et al (2019). Reference-Based Analysis of Lung Single-Cell Sequencing Reveals a Transitional Profibrotic Macrophage. Nat. Immunol. 20, 163-172. doi: 10.1038/s41590-018-0276-y
• BedouiS., HeroldM. J., StrasserA. (2020). Emerging Connectivity of Programmed Cell Death Pathways and its Physiological Implications. Nat. Rev. Mol. Cel. Biol. 21, 678-695. doi: 10.1038/s41580-020-0270-8
• BerginA. R. T., LoiS. (2019). Triple-negative Breast Cancer: Recent Treatment Advances. F1000Res 8, F1000 Faculty Rev-1342. doi: 10.12688/f1000research.18888.1
• BindeaG., MlecnikB., HacklH., CharoentongP., TosoliniM., KirilovskyA., et al (2009). ClueGO: a Cytoscape Plug-In to Decipher Functionally Grouped Gene Ontology and Pathway Annotation Networks. Bioinformatics 25, 1091-1093. doi: 10.1093/bioinformatics/btp101
• BockmeyerC. L., ChristgenM., MüllerM., FischerS., AhrensP., LängerF., et al (2011). MicroRNA Profiles of Healthy Basal and Luminal Mammary Epithelial Cells Are Distinct and Reflected in Different Breast Cancer Subtypes. Breast Cancer Res. Treat. 130, 735-745. doi: 10.1007/s10549-010-1303-3

タイトルに関連する用語 (9件)： トリプルネガティブ乳癌 ,  化学 ,  免疫療法 ,  応答 ,  予測 ,  ピロトーシス ,  サブ ,  タイプ ,  特性評価