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J-GLOBAL ID：202202235974830713   整理番号：22A1021030

異なる条件下でのAthetis dissimilis(鱗翅目:ヤガ科)における定量的リアルタイムPCR正規化のための参照遺伝子の選択と検証【JST・京大機械翻訳】

Selection and Validation of Reference Genes for Quantitative Real-Time PCR Normalization in Athetis dissimilis (Lepidoptera: Noctuidae) Under Different Conditions

著者 (7件)： Tang Jinrong (Henan International Laboratory for Green Pest Control/College of Plant Protection, Henan Agricultural University, Zhengzhou, China) ,  Tang Jinrong (State Key Laboratory for Biology of Plant Diseases and Insect Pests, Institute of Plant Protection, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Liang Gemei (State Key Laboratory for Biology of Plant Diseases and Insect Pests, Institute of Plant Protection, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Dong Shaoqi (Henan International Laboratory for Green Pest Control/College of Plant Protection, Henan Agricultural University, Zhengzhou, China) ,  Shan Shuang (State Key Laboratory for Biology of Plant Diseases and Insect Pests, Institute of Plant Protection, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Zhao Man (Henan International Laboratory for Green Pest Control/College of Plant Protection, Henan Agricultural University, Zhengzhou, China) ,  Guo Xianru (Henan International Laboratory for Green Pest Control/College of Plant Protection, Henan Agricultural University, Zhengzhou, China)
資料名： Frontiers in Physiology (Web)  (Frontiers in Physiology (Web))
巻： 13  ページ： 842195  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7093A  ISSN： 1664-042X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 参照遺伝子は,定量的リアルタイムPCR(qRT-PCR)を用いて遺伝子発現パターンを研究するための鍵である。重要な農業害虫であるAthetis異化の参照遺伝子に関する研究は報告されていない。異なる条件下でのA.dissimilisにおけるqRT-PCR正規化のための参照遺伝子を決定するために,10の候補遺伝子[18Sリボソーム蛋白質(18S),28Sリボソーム蛋白質(28S),アルギニンキナーゼ(AK),伸長因子1α(EF1-α),グリセルアルデヒド-3-ホスファートデヒドロゲナーゼ(GAPDH),リボソーム蛋白質L32(RPL32),リボソーム蛋白質L40(RPL40),α-チューブリン(α-TUB),β-アクチン(β-ACT),およびβ-チューブリン(β-TUB)]を5つのツール,geNorm,NormFinder,BestKeeper,ΔCt,およびRefFinderを用いて,種々の生物的および非生物的条件下でそれらの安定性を評価するために選択した。さらに,CSP1とスーパーオキシドジスムターゼ(SOD)を標的遺伝子として用いて,候補参照遺伝子を検証した。結果は,異なる参照遺伝子が,異なる実験条件下で必要であり,その中で,EF-1α,RPL40,および18Sが,幼虫組織のためのA.dissimilis,RPL40,およびα-TUBの遺伝子関連発育段階,および殺虫処理のためのα-TUBと28S,食餌処理のためのEF-1αと28S,および食餌処理のためのEF-1αとβ-ACT,および,すべてのサンプルのための18S,28S,およびα-TUBの遺伝子関連の遺伝子を研究するのに最も好適な参照遺伝子であったことを示した。”その間,EF-1α,およびβ-ACTは,すべてのサンプルで,幼虫組織,EF-1αとβ-ACT,および,食餌処理のためのEF-1αとβ-ACT,および,すべてのサンプルのための18S,28S,およびα-TUBの遺伝子関連発生段階を研究するのに,最も好適な参照遺伝子であった,という事を示していた。”それらの結果],異なる参照遺伝子,は,幼虫組織のためのA.dissimilis,RPL40,および28Sの遺伝子関連の発育段階を研究するのに,最も好適な参照遺伝子であった。これらの結果は,異なる実験条件下でA.dissimilisにおける遺伝子発現を研究するための適切な参照遺伝子を提供し,また,A.dissimilisにおける関連遺伝子の機能への更なる研究のための基礎を築く。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 害虫 ,  アクチン ,  異化 ,  *遺伝子 ,  幼虫 ,  グリセルアルデヒドリン酸デヒドロゲナーゼ ,  スーパーオキシドジスムターゼ ,  チューブリン ,  *ヤガ科 ,  *正規化 ,  遺伝子発現 ,  リボソームタンパク質
準シソーラス用語： αチューブリン ,  候補遺伝子 ,  *参照遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 参照遺伝子 ,  Athetis dissimilis ,  定量的RT-PCR ,  遺伝子発現安定性 ,  生物的および非生物的条件

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物の生化学  (EH01050J)

引用文献 (55件)：

• An X. K., Hou M. L., Liu Y. D. (2016). Reference gene selection and evaluation for gene expression studies using qRT-PCR in the white-backed planthopper, Sogatella furcifera (Hemiptera: Delphacidae). J. Econ. Entomol. 109, 879-886. doi: , PMID: doi: 10.1093/jee/tov333
• Andersen C. L., Jensen J. L., Ørntoft T. F. (2004). Normalization of real-time quantitative reverse transcription-PCR data: a model-based variance estimation approach to identify genes suited for normalization, applied to bladder and colon cancer data sets. Cancer Res. 64, 5245-5250. doi: , PMID: doi: 10.1158/0008-5472.CAN-04-0496
• Brym P., Rusc A., Kaminski S. (2013). Evaluation of reference genes for qRT-PCR gene expression studies in whole blood samples from healthy and leukemia-virus infected cattle. Vet. Immunol. Immunopathol. 153, 302-307. doi: , PMID: doi: 10.1016/j.vetimm.2013.03.004
• Bustin S. (2000). Absolute quantification of mRNA using real-time reverse transcription polymerase chain reaction assays. J. Mol. Endocrinol. 25, 169-193. doi: , PMID: doi: 10.1677/jme.0.0250169
• Bustin S., Benes V., Nolan T., Pfaffl M. W. (2005). Quantitative real-time RT-PCR--a perspective. J. Mol. Endocrinol. 34, 597-601. doi: , PMID: doi: 10.1677/jme.1.01755

タイトルに関連する用語 (6件)： 鱗翅目 ,  ヤガ科 ,  定量的リアルタイムPCR ,  正規化 ,  参照遺伝子 ,  検証