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J-GLOBAL ID：202202236341866944   整理番号：22A1181009

肺扁平上皮癌における2遺伝子免疫ゲノム関連予後シグネチャーの構築【JST・京大機械翻訳】

Construction of a Two-Gene Immunogenomic-Related Prognostic Signature in Lung Squamous Cell Carcinoma

著者 (7件)： Zhang Xiaoting (1Shenzhen Bao’an District Songgang People’s Hospital, Shenzhen, China) ,  Xiao Jing (1Shenzhen Bao’an District Songgang People’s Hospital, Shenzhen, China) ,  Fu Xian (1Shenzhen Bao’an District Songgang People’s Hospital, Shenzhen, China) ,  Qin Guicheng (1Shenzhen Bao’an District Songgang People’s Hospital, Shenzhen, China) ,  Yu Mengli (1Shenzhen Bao’an District Songgang People’s Hospital, Shenzhen, China) ,  Chen Guihong (2School of Pharmaceutical Sciences, Guangzhou Medical University, Guangzhou, China) ,  Li Xiaofeng (3Department of Laboratory Medicine, Peking University Shenzhen Hospital, Shenzhen, China)
資料名： Frontiers in Molecular Biosciences (Web)  (Frontiers in Molecular Biosciences (Web))
巻： 9  ページ： 867494  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7081A  ISSN： 2296-889X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 肺癌は,中国で最も高い腫瘍発生率を有する。肺扁平上皮癌(LUSC)は,原発性肺癌の40~51%を占める最も一般的なタイプである。LUSCは成長が遅く,転移が遅い。免疫関連遺伝子(IRG)と免疫浸潤細胞は,LUSCの臨床転帰で重要な役割をする。癌患者の予後を助けるために,その免疫遺伝子マップを系統的に研究することが重要である。本研究では,TCGAとInnatedDBデータベースからダウンロードしたIRGの予後景観と発現状態を結合して,IRGを得るためにLUSC患者の予後情報を系統的に分析した。生存分析を系統的に探索した後,予後関連遺伝子が見出され,PPIネットワークが合計11の遺伝子がハブ遺伝子であることを明らかにした。多変量Cox分析により2遺伝子予後リスクモデルを確立した。2つのIRGはLUSCの予後と密接に相関した。これらの2つの遺伝子に基づいて,新しい独立予後リスクモデルを確立し,このモデルをGEOデータベースでさらに検証した。さらに,モデルのリスクスコアはLUSC患者における性,生存状態およびリンパ転移と相関し,予後リスクモデルの予測リスクは5種類の免疫細胞(CD4 T細胞,CD8 T細胞,好中球,マクロファージおよび樹状細胞)と有意に正相関した。本研究は,免疫原形質を包括的に分析し,LUSCに対する免疫関連予後バイオマーカーを提示した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  ネットワーク ,  リスク ,  *遺伝子 ,  T細胞 ,  マクロファージ ,  *予後 ,  樹状細胞 ,  好中球 ,  肺腫瘍 ,  *扁平上皮癌 ,  バイオマーカー ,  腫瘤形成
準シソーラス用語： *肺扁平上皮癌 ,  癌患者 ,  免疫細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 肺扁平上皮癌 ,  免疫関連遺伝子 ,  TCGA ,  予後リスクモデル ,  FGA ,  CSF2

分類 (1件)： 呼吸器の腫よう  (GI04000G)

引用文献 (48件)：

• BensonM. D. (2005). Ostertag Revisited: the Inherited Systemic Amyloidoses without Neuropathy. Amyloid 12, 75-87. doi: 10.1080/13506120500106925
• BeugS. T., CheungH. H., SandaT., St-JeanM., BeauregardC. E., MamadyH., et al (2019). The Transcription Factor SP3 Drives TNF-α Expression in Response to Smac Mimetics. Sci. Signal. 12, eaat9563. doi: 10.1126/scisignal.aat9563
• BhattacharyaS., AndorfS., GomesL., DunnP., SchaeferH., PontiusJ., et al (2014). ImmPort: Disseminating Data to the Public for the Future of Immunology. Immunol. Res. 58, 234-239. doi: 10.1007/s12026-014-8516-1
• CampbellJ. D., AlexandrovA., AlexandrovA., KimJ., WalaJ., BergerA. H., et al (2016). Distinct Patterns of Somatic Genome Alterations in Lung Adenocarcinomas and Squamous Cell Carcinomas. Nat. Genet. 48, 607-616. doi: 10.1038/ng.3564
• CastellanosE., FeldE., HornL. (2016). Driven by Mutations: The Predictive Value of Mutation Subtype in EGFR-Mutated Non-small Cell Lung Cancer. J. Thorac. Oncol. 12, 612-623. doi: 10.1016/j.jtho.2016.12.014

タイトルに関連する用語 (7件)： 肺扁平上皮癌 ,  遺伝子 ,  免疫 ,  ゲノム ,  予後 ,  シグネチャー ,  構築