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J-GLOBAL ID：202202236540063283   整理番号：22A0587796

共通特徴に基づくスクリーニングと分子動力学シミュレーションによるPlasmodium falciparumプラスメプシン-IIに対する天然化合物阻害剤の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of the natural compound inhibitors against Plasmodium falciparum plasmepsin-II via common feature based screening and molecular dynamics simulations

著者 (4件)： Manhas Anu (Department of Chemistry, Pandit Deendayal Petroleum University, Gujarat, India) ,  Manhas Anu (School of Applied Material Sciences, Central University of Gujarat, Gujarat, India) ,  Kumar Sujeet (School of Applied Material Sciences, Central University of Gujarat, Gujarat, India) ,  Jha Prakash C. (School of Applied Material Sciences, Central University of Gujarat, Gujarat, India)
資料名： Journal of Biomolecular Structure and Dynamics  (Journal of Biomolecular Structure and Dynamics)
巻： 40  号： 1  ページ： 31-43  発行年： 2022年 
JST資料番号： W5935A  ISSN： 0739-1102  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： マラリアは,Plasmodium falciparumによって引き起こされる死んだ病気の間で計数される。最近,プラスミン-II酵素は抗マラリア薬の探索のための魅力的な薬物標的として非常に重要になってきた。したがって,一般的な特徴ファーマコフォアモデルは,プラスミン-IIプロテオームの結晶化した複合体から発生した。これらのモデルを一連の検証手順,即ち,試験セットとGuenerHenry研究にかけ,代表的モデルをリストアップした。最も重要な化学特徴(一般的ZHHA)を組み込んだ選択した代表的仮説を,潜在的候補を検索するために,天然物データベースに対してスクリーニングした。スクリーニングの前に薬物様候補の選択を確実にするために,選択データベースにフィルタリング段階(Drug-likeとADMETフィルタ)を採用した。蛋白質内の候補の相互作用パターンを研究するために,これらの分子は分子ドッキング研究に進んだ。その後,参照(4Z22)の赤色化により得られた選択したカットオフ基準に基づいて,15の化合物はより高いドッキングスコア(>-16.05kcal/mol)を示し,重要なアミノ酸,すなわちAsp34とAsp214との水素結合の存在を示した。さらに,ドッキング分子の安定性を分子動力学シミュレーションにより精査し,結果を参照化合物4Z22と比較した。すべてのドッキング化合物は安定な動力学挙動を示した。したがって,この寄与において,スクリーニングと安定性手順の組合せは,新規抗マラリア剤の設計における新しい化学空間として役立つ15のヒットの同定をもたらした。Ramaswamy H.Sarmaによって共用した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 結晶化 ,  *計算機シミュレーション ,  データベース ,  ドッキング ,  アミノ酸 ,  抗マラリア薬 ,  プラスミン ,  マラリア ,  複合体 ,  *化合物 ,  *スクリーニング ,  *Plasmodium falciparum ,  分子認識 ,  プロテオーム
準シソーラス用語： *分子動力学シミュレーション ,  分子ドッキング ,  ファーマコホア , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： プラスメプシン-II ,  ファーマコフォア ,  分子ドッキング ,  分子動力学シミュレーション ,  薬物様性

分類 (3件)： 抗原虫薬・駆虫薬の基礎研究  (GW17080G) ,  薬物の構造活性相関  (GV01050B) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (7件)： スクリーニング ,  分子動力学シミュレーション ,  Plasmodium ,  プラスメプシン ,  天然化合物 ,  阻害剤 ,  同定