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J-GLOBAL ID：202202236678762571   整理番号：22A0769569

エクジソゾアにおけるDNAメチル化の進化【JST・京大機械翻訳】

Evolution of DNA Methylation Across Ecdysozoa

著者 (16件)： Engelhardt Jan (Bioinformatics Group, Department of Computer Science, University of Leipzig, Leipzig, Germany) ,  Engelhardt Jan (Computational EvoDevo Group, Department of Computer Science, University of Leipzig, Leipzig, Germany) ,  Engelhardt Jan (Interdisciplinary Centre for Bioinformatics, University of Leipzig, Leipzig, Germany) ,  Engelhardt Jan (Department of Evolutionary Biology, University of Vienna, Vienna, Austria) ,  Scheer Oliver (Computational EvoDevo Group, Department of Computer Science, University of Leipzig, Leipzig, Germany) ,  Scheer Oliver (Interdisciplinary Centre for Bioinformatics, University of Leipzig, Leipzig, Germany) ,  Stadler Peter F. (Bioinformatics Group, Department of Computer Science, University of Leipzig, Leipzig, Germany) ,  Stadler Peter F. (Interdisciplinary Centre for Bioinformatics, University of Leipzig, Leipzig, Germany) ,  Stadler Peter F. (The Santa Fe Institute, Santa Fe, NM, USA) ,  Stadler Peter F. (Max Planck Institute for Mathematics in the Sciences, Leipzig, Germany) ,  Stadler Peter F. (Institute for Theoretical Chemistry, University of Vienna, Vienna, Austria) ,  Stadler Peter F. (Facultad de Ciencias, Universidad National de Colombia, Sede Bogota, Colombia) ,  Prohaska Sonja J. (Computational EvoDevo Group, Department of Computer Science, University of Leipzig, Leipzig, Germany) ,  Prohaska Sonja J. (Interdisciplinary Centre for Bioinformatics, University of Leipzig, Leipzig, Germany) ,  Prohaska Sonja J. (The Santa Fe Institute, Santa Fe, NM, USA) ,  Prohaska Sonja J. (Complexity Science Hub Vienna, Vienna, Austria)
資料名： Journal of Molecular Evolution  (Journal of Molecular Evolution)
巻： 90  号： 1  ページ： 56-72  発行年： 2022年 
JST資料番号： B0464B  ISSN： 0022-2844  CODEN： JMEVAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNAメチル化は脊椎動物における遺伝子調節の重要な豊富な機構である。それは,多くの他の後生動物生物においてあまり一般的ではなく,Drosophila melanogasterおよびCaenorhabditis elegansのようないくつかの重要なモデル種に完全には存在しなかった。ここでは,Arthropoda,Nematoda,Priapulida,Onychophora,およびTardigradaをカバーする138のEcdyszoaにおけるDNAメチルトランスフェラーゼ(DNMT)の存在と不在の包括的な研究を報告する。これらの門の3つがDNAメチル化の存在に対して研究されていない。個々のDNMTの喪失は,エクジソゾアン門を横断して複数回発生することを観察した。Gauss混合モデリング,MethModの実装を用いて,コード配列におけるCpG速度に基づくDNAメチル化の存在を計算的に予測した。両分析を統合することにより,EcdyszoaにおけるDNAメチル化の2つの以前に未知の損失,Chelicerata(Mesostigta)内の1つおよびTardigradaにおける1つを予測した。初期分岐Ecdyszoa Priapulus caudatusにおいて,DNMTの完全なセットの存在とDNAメチル化の存在を予測した。したがって,700百万年以上の系統発生範囲にわたる異なるエクジソゾアン門におけるDNAメチル化の非常に多様で独立した進化を示した。Copyright The Author(s) 2022 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *メチル化 ,  脊椎動物 ,  ヌクレオチド配列 ,  系統発生 ,  遺伝的調節 ,  *クマムシ動物 ,  DNAメチルトランスフェラーゼ ,  Caenorhabditis elegans ,  エピジェネティクス
準シソーラス用語： キイロショウジョウバエ ,  *DNAメチル化 ,  後生動物 ,  CpG , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： DNAメチルトランスフェラーゼ ,  進化的エピジェネティクス ,  Gauss混合モデリング ,  観測/抽出CpG比

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (2件)： DNAメチル化 ,  進化