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J-GLOBAL ID：202202237027317952   整理番号：22A1118062

砕氷器:不均一氷による高分解能単一粒子クライオEMのためのソフトウェア【JST・京大機械翻訳】

IceBreaker: Software for high-resolution single-particle cryo-EM with non-uniform ice

著者 (8件)： Olek Mateusz (Electron Bio-Imaging Centre, Diamond Light Source, Harwell Science and Innovation Campus, Didcot OX11 0DE, UK) ,  Olek Mateusz (Department of Chemistry, University of York, York, UK) ,  Cowtan Kevin (Department of Chemistry, University of York, York, UK) ,  Webb Donovan (Electron Bio-Imaging Centre, Diamond Light Source, Harwell Science and Innovation Campus, Didcot OX11 0DE, UK) ,  Chaban Yuriy (Electron Bio-Imaging Centre, Diamond Light Source, Harwell Science and Innovation Campus, Didcot OX11 0DE, UK) ,  Zhang Peijun (Electron Bio-Imaging Centre, Diamond Light Source, Harwell Science and Innovation Campus, Didcot OX11 0DE, UK) ,  Zhang Peijun (Division of Structural Biology, Wellcome Trust Centre for Human Genetics, University of Oxford, Oxford OX3 7BN, UK) ,  Zhang Peijun (Chinese Academy of Medical Sciences Oxford Institute, University of Oxford, Oxford OX3 7BN, UK)
資料名： Structure  (Structure)
巻： 30  号： 4  ページ： 522-531.e4  発行年： 2022年 
JST資料番号： A1212A  ISSN： 0969-2126  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 利用可能なソフトウェアツールの豊富さにもかかわらず,最適な粒子選択は,単一粒子クライオ電子顕微鏡(cryo-EM)においてまだ重要な問題である。用いた方法に関係なく,氷厚が顕微鏡写真で変化するとき,ほとんどのピッカーは strった。アイスブラーカーは,ユーザが相対的氷勾配を推定でき,局所コントラストを均等化することによってそれを平らにする。それはバックグラウンドからの粒子の分化を可能にし,全体的な粒子採取性能を改善した。さらに,各粒子に対する局所氷厚さに対応する付加的パラメータを導入した。定義された氷厚を有する粒子は,処理中のこのパラメータに基づいてグループ分けされ,ろ過される。これらの機能性は,各顕微鏡写真から可能な限り多くの粒子を自動的にピックアップし,データ収集のための最適な領域を選択するために,オンザフライ加工にとって特に価値がある。最後に,推定氷勾配分布を別々に保存し,調製した試料の品質を検査するのに用いた。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ガラス ,  コントラスト ,  顕微鏡写真 ,  *むら ,  *粒子 ,  氷厚 ,  等化 ,  砕氷 ,  *ソフトウェア ,  支援プログラム ,  データ収集 ,  優先配向 ,  *高分解能
準シソーラス用語： *低温電子顕微鏡 ,  単一粒子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： クライオ-EM ,  単一粒子 ,  ガラス状氷 ,  氷勾配 ,  氷厚 ,  粒子ピッキング ,  優先配向 ,  密度マップ

分類 (1件)： 生体の顕微鏡観察法  (EA03050C)

タイトルに関連する用語 (7件)： 砕氷 ,  不均一 ,  氷 ,  高分解能 ,  単一粒子 ,  クライオEM ,  ソフトウェア