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J-GLOBAL ID：202202237468637460   整理番号：22A1136318

TCGAデータベースに基づくバイオインフォマティクス方法の分析と肺腺癌の予後と診断miRNA研究【JST・京大機械翻訳】

Analysis and mining of bioinformatics based on TCGA database miRNA study on prognosis and diagnosis of lung adenocarcinoma

著者 (8件)： Zhao Dan (斉斉哈爾医学院医学技術系,黒竜江 斉斉哈爾 161005) ,  Mou Haijun (斉斉哈爾医学院附属第三医院呼吸与危重症医学科,黒竜江 斉斉哈爾 161005) ,  Shi Hanbing (斉斉哈爾医学院附属第三医院呼吸与危重症医学科,黒竜江 斉斉哈爾 161005) ,  Bi Hongxia (斉斉哈爾医学院医学技術系,黒竜江 斉斉哈爾 161005) ,  Jiang Yunfei (斉斉哈爾医学院附属第三医院呼吸与危重症医学科,黒竜江 斉斉哈爾 161005) ,  Liu Guohua (斉斉哈爾医学院附属第三医院呼吸与危重症医学科,黒竜江 斉斉哈爾 161005) ,  Zheng Hongyan (斉斉哈爾医学院附属第三医院呼吸与危重症医学科,黒竜江 斉斉哈爾 161005) ,  Liu Bo (斉斉哈爾医学院附属第三医院呼吸与危重症医学科,黒竜江 斉斉哈爾 161005)
資料名： Dangdai Yixue  (Dangdai Yixue)
巻： 28  号： 4  ページ： 33-36  発行年： 2022年 
JST資料番号： C3664A  ISSN： 1009-4393  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:TCGAデータベースに基づき、バイオインフォマティクス方法を用い、肺腺癌の予後を分析し、miRNAの生物学的マーカーを診断する。方法:データダウンロード:TCGAダウンロードから肺腺癌miRNA発現スペクトルデータを取得し、miRNAseqと臨床データを含む。差次的発現miRNAsを選別し、R-version3.6.2ソフトウェア中のedgeRパッケージを用い、肺腺癌組織と正常肺組織の差異遺伝子を選別し、|logFC|>2、P<0.05をスクリーニング条件とした。予後に関連するmiRNAsを選別し、R-version3.6.2ソフトウェア中のsurvivalパッケージを用いてKM生存曲線を描き、予後に関連するmiRNAsをスクリーニングした。肺腺癌診断のmiRNAsとしてスクリーニングし、R-version3.6.2ソフトウェア中のpROCパッケージを用いて、受信者動作特性曲線(ROC)を作成し、予後関連miRNAsによる肺腺癌の診断特異性と敏感性を評価した。【結果】肺腺癌と正常な肺組織の間の差次的発現のmiRNA144は,119の上方制御と25のダウンレギュレーションによって下方制御された。K-M生存曲線により、予後と有意な相関(P<0.05)のmiRNAは13個で,それぞれhsa-miR-139-3p,hsa-miR-328-3p,hsa-let-7g-3p,hsa-miR-142-3p,hsa-miR-147b,およびhsa-miR-147bであった。hsa-miR-31-5p,hsa-miR-548v,hsa-miR-188-3p,hsa-miR-31-3p,hsa-miR-490-3p,hsa-miR-4664-3p,hsa-miR-1293,およびhsa-miR-1293。hsa-miR-615-3pは,その中のhsa-miR-147b,hsa-miR-4664-3p,hsa-miR-1293,hsa-miR-615-3pが予後と負に相関し,他の正の相関を示した。ROCを用いて,肺腺癌の特異性と感受性を診断し,hsa-miR-147b,hsa-miR-142-3p,hsa-let-7g-3p,およびhsa-let-7g-3pの感受性を評価した。hsa-miR-139-3pの4つのmiRNAのAUC曲線>0.9、それぞれ0.904、0.927、0.945、0.965であり、高い診断価値と正確性を有する。結論:hsa-miR-147b、hsa-miR-142-3p、hsa-let-7g-3p、hsa-miR-139-3pは、肺腺癌の予後評価とmiRNAの生物学的マーカーとして、重要な臨床価値を有する。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *情報科学 ,  *データベース ,  *生物学 ,  遺伝子 ,  ソフトウェア ,  *予後 ,  スクリーニング ,  *肺腫瘍 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  ダウンロード ,  バイオマーカー
準シソーラス用語： *マイクロRNA ,  ROC曲線 ,  *肺腺癌 ,  生存曲線 ,  *バイオインフォマティクス ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (8件)： データベース ,  バイオインフォマティクス ,  分析 ,  肺腺癌 ,  予後 ,  診断 ,  miRNA ,  研究