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J-GLOBAL ID：202202237472772378   整理番号：22A1158316

栽培オリーブ品種(Olea europaea)における油生合成遺伝子の全ゲノム探索:油生合成の調節への洞察【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide exploration of oil biosynthesis genes in cultivated olive tree varieties (Olea europaea): insights into regulation of oil biosynthesis

著者 (5件)： Vatansever Recep (Ficus Biotechnology, Ostim OSB Mah, Yenimahalle, Ankara, Turkey) ,  Hernandez Pilar (Consejo Superior de Investigaciones Cientificas (CSIC), Instituto de Agricultura Sostenible (IAS-CSIC), Cordoba, Spain) ,  Escalante Francisco Javier (Plataforma de Genomica y Bioinformatica de Andalucia, Sevilla, Spain) ,  Dorado Gabriel (Dep. Bioquimica y Biologia Molecular, Campus Rabanales C6-1-E17, Campus de Excelencia Internacional Agroalimentario (ceiA3), Universidad de Cordoba, Cordoba, Spain) ,  Unver Turgay (Ficus Biotechnology, Ostim OSB Mah, Yenimahalle, Ankara, Turkey)
資料名： Functional & Integrative Genomics  (Functional & Integrative Genomics)
巻： 22  号： 2  ページ： 171-178  発行年： 2022年 
JST資料番号： W4378A  ISSN： 1438-7948  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ゲノムワイド油生合成を,2つの栽培オリーブ木(Olea europaea)品種(cv.AyvalikとPicual)のde novo配列決定により調査した。これは,以前の品種配列決定の最初の報告である。外群として,cv.Leccinoの生読取とcv.Fargaの足場レベル集合も検索した。これらの4つの栽培品種の各々は,1.31Gbp(Farga),0.93Gbp(Ayvalik),0.7Gbp(Picual),および0.54Gbp(Leccino)のサイズで23の偽染色体に集合した染色体スケールであった。。また,これらの4つの栽培品種の各々は,1.31Gbp(Farga),0.93Gbp(Ayvalik),0.7Gbp(Picual),および0.54Gbp(Leccino)であった。Ab initio遺伝子所見を,野生オリーブ樹(oleaster)訓練パラメータを用いて,これらのアセンブリで行った。多数の遺伝子モデルを予測し,偽染色体に固定し,69,028(Ayvalik),55,073(Picual),63,785(Farga)および40,449(Leccino)であった。野生オリーブ樹ゲノムプロジェクトからの以前に報告された油生合成遺伝子を用いて,以下の相同配列を同定した:1,355(Ayvalik),1,269(Farga),812(Leccino),および774(Picual)。これらのうち,358の配列は,すべての品種によって一般に共有された。さらに,いくつかの配列は品種特有であった:Ayvalik(126),Farga(118),Leccino(46),およびPicual(52)。これらの推定配列は,脂質代謝からストレス耐性までの様々なGO項に割り当てられ,シグナルトランザクションから発生まで,また,多くの他者に対して,油生合成は,種々の他の経路の関与で相乗的に調節されることを暗示する。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *生合成 ,  *遺伝子 ,  *オリーブ ,  染色体 ,  脂質代謝 ,  *ゲノム ,  *栽培 ,  *品種 ,  栽培品種
準シソーラス用語： ゲノムプロジェクト ,  ストレス耐性 ,  相同配列 ,  *生合成遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Oil biosynthesis ,  De novo assembly ,  Contigs ,  Olive ,  Ab initio gene prediction

分類 (2件)： 食用油脂,マーガリン  (FJ09010C) ,  油料作物  (FC03074V)

タイトルに関連する用語 (11件)： 栽培 ,  オリーブ ,  品種 ,  Olea ,  油 ,  生合成遺伝子 ,  ゲノム ,  探索 ,  生合成 ,  調節 ,  洞察