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J-GLOBAL ID：202202237597564241   整理番号：22A0640253

適応分解能シミュレーション技術による水媒介分子間相互作用の研究【JST・京大機械翻訳】

Investigation of water-mediated intermolecular interactions with the adaptive resolution simulation technique

著者 (1件)： Delle Site Luigi (Freie Universitaet Berlin, Institute of Mathematics, Arnimallee 6, 14195 Berlin, Germany)
資料名： Journal of Physics. Condensed Matter  (Journal of Physics. Condensed Matter)
巻： 34  号： 11  ページ： 115101 (14pp)  発行年： 2022年 
JST資料番号： B0914B  ISSN： 0953-8984  CODEN： JCOMEL  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 適応分解能シミュレーション(AdResS)技術を用いて,分子-分子相互作用における水媒介効果が関連する空間中の領域を推定した。AdResSを用いて,水素結合ネットワークの原子論的詳細が関連する溶質(溶媒和殻)周辺の領域を同定し,一方,外部水は,単純化された巨視的レベルで記述できる熱力学的浴の役割を演ずる。その結果,2つの溶質の相互作用に対して,水媒介効果が関連する分子間距離は,AdResSによって同定された2つのそれぞれの溶媒和殻の半径の和によって表される。上記の仮説は,異なる溶質に対する平均力の溶質-溶質ポテンシャルを計算することによって証明された。試験分子として,FCHo2-F-BARドメイン蛋白質の断片に由来するアミノ酸を用いた。この選択は,現在の結果が,この状況におけるAdResSの技術的能力を証明しているという事実から,将来の実際の粗粒モデルに対するデータを提供するかもしれない。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *シミュレーション ,  *相互作用 ,  熱力学 ,  *分子間相互作用 ,  簡素化 ,  溶媒和 ,  アミノ酸 ,  タンパク質 ,  ポテンシャル ,  溶質 ,  効果
準シソーラス用語： ドメイン構造 ,  粗粒モデル ,  分子間距離 ,  水素結合ネットワーク , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 電子輸送の一般理論  (BM03020C)

タイトルに関連する用語 (6件)： 適応 ,  分解能 ,  シミュレーション技術 ,  水 ,  分子間相互作用 ,  研究