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J-GLOBAL ID：202202237894631856   整理番号：22A1058349

インポーチンα/βヘテロ二量体に結合したイベルメクチンの分子動力学研究【JST・京大機械翻訳】

Molecular dynamics investigation of ivermectin bound to importin alpha/beta heterodimer

著者 (8件)： Sultana Mossammad U. C. (Division of Infectious Diseases and Division of Computer-Aided Drug Design, The Red-Green Research Centre, BICCB, Dhaka, Bangladesh) ,  Uddin Md. Giash (Division of Infectious Diseases and Division of Computer-Aided Drug Design, The Red-Green Research Centre, BICCB, Dhaka, Bangladesh) ,  Uddin Md. Giash (Department of Pharmacy, University of Chittagong, Chittagong, Bangladesh) ,  Hossain Md. Billal (Division of Infectious Diseases and Division of Computer-Aided Drug Design, The Red-Green Research Centre, BICCB, Dhaka, Bangladesh) ,  Ali Md Ackas (Division of Infectious Diseases and Division of Computer-Aided Drug Design, The Red-Green Research Centre, BICCB, Dhaka, Bangladesh) ,  Sonia Zannatul Ferdous (Division of Infectious Diseases and Division of Computer-Aided Drug Design, The Red-Green Research Centre, BICCB, Dhaka, Bangladesh) ,  Kamal Suprio (Division of Infectious Diseases and Division of Computer-Aided Drug Design, The Red-Green Research Centre, BICCB, Dhaka, Bangladesh) ,  Halim Mohammad A. (Department of Chemistry and Biochemistry, Kennesaw State University, Kennesaw, GA, USA)
資料名： Molecular Simulation  (Molecular Simulation)
巻： 48  号： 4  ページ： 314-321  発行年： 2022年 
JST資料番号： T0744A  ISSN： 0892-7022  CODEN： MOSIEA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： FDA承認薬であるイベルメクチン(D1)は主に寄生虫感染の治療の阻害剤として使用されている。この薬剤は,COVID-19治療におけるその効果のために注目された。本研究では,イベルメクチンとその類似体が,分子ドッキング,去勢分子動力学(SMD),古典的分子動力学(MD),およびMM/PBSA結合自由エネルギー分析によって,Impα/β1ヘテロ二量体とどのように相互作用するかを調べた。ドッキング結果は,イベルメクチン二量体が単量体に比べて-12.2kcal/molの最も高い結合親和性を示した。SMDでは,D1-Impα/β1複合体が18.27から18.36Åの距離で,600pm/ps2の最高加速が注目された。1745.86pNの牽引力もD1-Impα/β1に対して検出された。ドッキングとSMD結果を検証するために,100ns分子動力学(MD)シミュレーションをD1-Impα/β1複合体で行った。平均RMSD値は,初めの顕著な変化にもかかわらず,錯体の良好な構造安定性を示した。大部分の残基は,2.65Å以下の平均RMSF値を有するシミュレーション時間にわたって安定である。イベルメクチンのMM/PBSA自由エネルギーも,Impα/β1との強い自発的結合を示した。GRAPHICAL。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 自由エネルギー ,  相互作用 ,  ドッキング ,  去勢 ,  単量体 ,  *二量体 ,  寄生虫症 ,  複合体 ,  親和性 ,  *分子動力学 ,  分子認識 ,  大環状化合物 ,  ラクトン ,  スピロ化合物 ,  オレフィン化合物 ,  デオキシ糖 ,  二糖類 ,  架橋化合物 ,  ピラノシド ,  糖エーテル ,  ジオール
準シソーラス用語： *ヘテロ二量体 ,  結合親和性 ,  分子ドッキング ,  結合自由エネルギー ,  残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 分子ドッキング ,  操縦分子動力学 ,  分子動力学シミュレーション ,  結合自由エネルギー ,  アベルメクチン

分類 (2件)： 分子化合物  (CE02000C) ,  酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W)

物質索引 (1件)： イベルメクチン

タイトルに関連する用語 (5件)： インポーチンα ,  ヘテロ二量体 ,  イベルメクチン ,  分子動力学 ,  研究