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J-GLOBAL ID：202202238288891801   整理番号：22A0415135

ハイスループットアンプリコン配列決定を用いた巻貝と侵入吸虫類の同時遺伝子型決定【JST・京大機械翻訳】

Simultaneous genotyping of snails and infecting trematode parasites using high-throughput amplicon sequencing

著者 (10件)： Hammoud Cyril (Limnology Unit, Department of Biology, Ghent University, Gent, Belgium) ,  Hammoud Cyril (Department of Biology, Royal Museum for Central Africa, Tervuren, Belgium) ,  Mulero Stephen (IHPE, Univ. Montpellier, CNRS, Univ. Perpignan Via Domitia, IFREMER, Perpignan, France) ,  Van Bocxlaer Bert (Limnology Unit, Department of Biology, Ghent University, Gent, Belgium) ,  Van Bocxlaer Bert (Univ. Lille, UMR 8198 Evo-Eco-Paleo, CNRS, Lille, France) ,  Boissier Jerome (IHPE, Univ. Montpellier, CNRS, Univ. Perpignan Via Domitia, IFREMER, Perpignan, France) ,  Verschuren Dirk (Limnology Unit, Department of Biology, Ghent University, Gent, Belgium) ,  Albrecht Christian (Systematics & Biodiversity Lab, Department of Animal Ecology & Systematics, Justus Liebig University, Giessen, Germany) ,  Huyse Tine (Department of Biology, Royal Museum for Central Africa, Tervuren, Belgium) ,  Huyse Tine (Laboratory of Biodiversity and Evolutionary Genomics, University of Leuven, Leuven, Belgium)
資料名： Molecular Ecology Resources  (Molecular Ecology Resources)
巻： 22  号： 2  ページ： 567-586  発行年： 2022年 
JST資料番号： W2685A  ISSN： 1755-098X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 現在,いくつかの方法論的問題は,それらの中間カタツムリ宿主の個体群内の全吸虫群集の研究を妨げている。ここでは,ハイスループットアンプリコン配列決定を用いた新しいワークフローを開発し,カタツムリ宿主とそれらの感染吸虫寄生虫を同時に遺伝子型化した。単一多重PCRで4つのカタツムリと5つの吸虫マーカーを増幅するプライマーを設計した。また,他の属にも適用可能であるが,著者らは,スーパーオーダーHygrophila内の医学的および経済的に重要なカタツムリ属に焦点を当て,クラストレマトダ内の寄生虫の広範な分類学的範囲を目標にした。著者らは,Schistosomaロッドハニ,Schistosomaマンソンの2つの菌株,およびそれらの組合せで実験的に感染した417のBiomphalaria glabrata標本を用いて,ワークフローをテストした。感染診断の信頼性,ワークフローのロバスト性,宿主および寄生虫同定に関連する特異性,および感染過程中の寄生虫バイオマスの変化,未成熟感染および感染を検出する感受性を評価した。最後に,様々な範囲の吸虫で自然に感染する他の属の野生カワガイにおけるその適用性を調べた。厳しい品質管理の後,ワークフローは,カタツムリを種レベルまで同定することを可能にし,また,系統から系統までの分類学的レベルまで吸虫する。未成熟感染の検出と以前の実験研究で記述された寄生虫バイオマスの変化に敏感である。Co感染を成功裏に同定し,種間競争のような寄生虫-寄生虫相互作用を調べる可能性を開いた。まとめると,これらの結果は,著者らのワークフローが,自然カタツムリ個体群内の吸虫群集を形成するプロセスを分析するための強力なツールを提供することを示す。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 品質管理 ,  信頼性 ,  *遺伝子型 ,  寄生虫 ,  *吸虫類 ,  多重化 ,  バイオマス ,  個体群 ,  種間競争 ,  ロバスト性 ,  ワークフロー
準シソーラス用語： Schistosoma ,  *マキガイ ,  未成熟 ,  分類学 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 共感染 ,  コミュニティ生態学 ,  診断 ,  腹足類 ,  ハイスループットアンプリコン配列決定 ,  住血吸虫症

分類 (4件)： 動物形態学・解剖学一般  (EJ01040E) ,  有害動物による植物被害一般  (FC04071D) ,  動物に対する影響  (EE05040R) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 巻貝 ,  侵入 ,  吸虫類 ,  遺伝子型決定