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J-GLOBAL ID：202202238376940297   整理番号：22A1158660

癌蛋白質に対する液胞蛋白質選別関連蛋白質26BからのSA11,RF13およびDI14ペプチドの分子ドッキングおよびHep-2細胞における抗癌効力のin vitro研究【JST・京大機械翻訳】

Molecular Docking of SA11, RF13 and DI14 Peptides from Vacuolar Protein Sorting Associated Protein 26B Against Cancer Proteins and In vitro Investigation of its Anticancer Potency in Hep-2 Cells

著者 (6件)： Velayutham Manikandan (Department of Biotechnology, College of Science and Humanities, SRM Institute of Science and Technology, Chennai, Tamil Nadu, India) ,  Guru Ajay (Department of Biotechnology, College of Science and Humanities, SRM Institute of Science and Technology, Chennai, Tamil Nadu, India) ,  Gatasheh Mansour K. (Department of Biochemistry, College of Science, King Saud University, Riyadh, Saudi Arabia) ,  Hatamleh Ashraf Atef (Department of Botany and Microbiology, College of Science, King Saud University, Riyadh, Saudi Arabia) ,  Juliet Annie (Institute for Cellular and Molecular Biology, The University of Texas at Austin, Austin, Texas, USA) ,  Arockiaraj Jesu (Department of Biotechnology, College of Science and Humanities, SRM Institute of Science and Technology, Chennai, Tamil Nadu, India)
資料名： International Journal of Peptide Research and Therapeutics  (International Journal of Peptide Research and Therapeutics)
巻： 28  号： 3  ページ： 87  発行年： 2022年 
JST資料番号： W4483A  ISSN： 1573-3904  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究は,淡水硬骨魚類のトランスクリプトームデータから得られた,液胞蛋白質ソーティング関連蛋白質26B(VSP26B)に由来するRF13ペプチドの抗癌能を示し,それをストリップしたムレル(Channa striatus)のトランスクリプトームデータから得た。全体で,28の異なるペプチドセグメントを,VSP26Bからランダムに予測し,それらの抗癌特性を,mACPpredアルゴリズムを通して予測した。スコアリング値に基づき,28,3ペプチドのうち,SA11,RF13およびDI14は,一次物理化学的特性スクリーニングのために短かった。また,分子ドッキングを用いて抗癌蛋白質受容体について短いリストペプチドを検証した。全体的なバイオインフォマティクス分析に基づいて,RF13(1RRGKGGRRVTMSF13)ペプチドを選択し,分子生物学研究室における抗癌能をさらに調べた。in vitro実験は,RF13がヒト喉頭上皮細胞(HEp-2)の増殖を阻害することを示した。さらに,顕微鏡観察により,ヘキスト33342染色によるアポトーシスを示す細胞形態に及ぼすペプチドの影響を確認し,それは,調べたペプチド,RF13の抗癌効果を示した。ペプチド抗癌特性の分子機構を細胞周期分析で分析した。それは,ペプチドがHep-2細胞のSubG1とG1相を用量依存的に停止することを示した。qPCRアッセイは,カスパーゼ-3とカスパーゼ-9発現を含むアポトーシス遺伝子が非調節様式で有意に(p<0.05)ことを示した。得られた結果に基づいて,RF13が抗癌剤として十分に有望であることを提案した。しかしながら,更なる方向は,抗癌薬開発に対する可能な特異的な標的機構およびその治療方法に焦点を当てる必要がある。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature B.V. 2022 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  *ペプチド ,  遺伝子 ,  *液胞 ,  抗腫瘍作用 ,  抗腫瘍薬 ,  ヒト ,  スクリーニング ,  遺伝子発現 ,  上皮細胞 ,  アポトーシス ,  *癌タンパク質 ,  トランスクリプトーム ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 分子ドッキング ,  液胞蛋白質 ,  抗癌ペプチド ,  アポトーシス ,  遺伝子発現

分類 (4件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  抗腫よう薬の基礎研究  (GW16010A) ,  生物学的機能  (EB03040U) ,  腫ようの実験的治療  (GE02040Y)

タイトルに関連する用語 (9件)： 癌蛋白質 ,  液胞 ,  蛋白質選別 ,  蛋白質 ,  ペプチド ,  分子ドッキング ,  HEp-2細胞 ,  癌 ,  研究