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J-GLOBAL ID：202202239425543434   整理番号：22A1112168

大腸菌の熱不安定性ウラシル-DNAグリコシラーゼの計算設計【JST・京大機械翻訳】

Computational design of a thermolabile uracil-DNA glycosylase of Escherichia coli

著者 (15件)： Park Seongjun (Department of Emerging Materials Science, Daegu Gyeongbuk Institute of Science and Technology (DGIST), Daegu, Korea) ,  Shin Yong-Keol (Enzynomics, Inc., Daejeon, Korea) ,  Yoon Jeong-Yeon (Enzynomics, Inc., Daejeon, Korea) ,  Nam Ki-Hoon (Enzynomics, Inc., Daejeon, Korea) ,  Munashingha Palinda Ruvan (Enzynomics, Inc., Daejeon, Korea) ,  Park Soyeong (Enzynomics, Inc., Daejeon, Korea) ,  Park So-Yeon (Enzynomics, Inc., Daejeon, Korea) ,  Kim Sangyeol (Department of Brain and Cognitive Sciences, Daegu Gyeongbuk Institute of Science and Technology (DGIST), Daegu, Korea) ,  Lee Juhwan (Supercomputing Bigdata Center and Core Protein Resources Center, Daegu Gyeongbuk Institute of Science and Technology (DGIST), Daegu, Korea) ,  Seo Min Jae (Department of Brain and Cognitive Sciences, Daegu Gyeongbuk Institute of Science and Technology (DGIST), Daegu, Korea) ,  Yu Wookyung (Department of Brain and Cognitive Sciences, Daegu Gyeongbuk Institute of Science and Technology (DGIST), Daegu, Korea) ,  Yu Wookyung (Supercomputing Bigdata Center and Core Protein Resources Center, Daegu Gyeongbuk Institute of Science and Technology (DGIST), Daegu, Korea) ,  Seo Yeon-soo (Department of Biological Sciences, Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST), Daejeon, Korea) ,  Chang Iksoo (Department of Brain and Cognitive Sciences, Daegu Gyeongbuk Institute of Science and Technology (DGIST), Daegu, Korea) ,  Chang Iksoo (Supercomputing Bigdata Center and Core Protein Resources Center, Daegu Gyeongbuk Institute of Science and Technology (DGIST), Daegu, Korea)
資料名： Biophysical Journal  (Biophysical Journal)
巻： 121  号： 7  ページ： 1276-1288  発行年： 2022年 
JST資料番号： B0298A  ISSN： 0006-3495  CODEN： BIOJAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)は感染症を診断するための強力なツールである。Uracil DNAグリコシラーゼ(UDG)は,PCRにおけるキャリーオーバー汚染の除去に広く使用されている。しかし,UDGは,完全に不活性化されないとき,偽陰性結果に寄与し,増幅段階の間にDNA分解をもたらす。本研究では,分子動力学シミュレーションと残留ネットワーク解析により,新しい熱不安定性UDG誘導体を設計した。大腸菌由来UDGおよび22誘導体の酵素活性分析,熱耐性,熱安定性および生化学実験に基づき,UDG D43A変異体が偽陰性問題を除去し,高効率を示し,PCR診断での使用に大きな利点を提供することを明らかにした。さらに,D43A変異の役割に関する構造的および熱力学的洞察を得て,D43近くの摂動蛋白質構造を含む;D43とK42,N46,およびR80とのペアワイズ相互作用を弱めた。そして,野生型UDGと比較して,UDG D43A変異体の融解温度と天然画分を減少させた。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  熱力学 ,  分子構造 ,  計算機シミュレーション ,  *大腸菌 ,  融点 ,  *DNA【核酸】 ,  酵素活性度 ,  突然変異体 ,  キャリオーバ ,  感染症 ,  摂動 ,  野生型 ,  PCR法
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  偽陰性 ,  蛋白質構造 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (5件)： 大腸菌 ,  熱不安定性 ,  ウラシル-DNAグリコシラーゼ ,  計算 ,  設計