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J-GLOBAL ID：202202240003059094   整理番号：22A0808414

確率的マイクロバイオーム集合は文脈に依存する【JST・京大機械翻訳】

Stochastic microbiome assembly depends on context

著者 (5件)： Jones Eric W. (Department of Physics, Simon Fraser University, Burnaby, BC V5A 1S6, Canada) ,  Carlson Jean M. (Complex Systems Group, Department of Physics, University of California, Santa Barbara, CA 93106) ,  Sivak David A. (Department of Physics, Simon Fraser University, Burnaby, BC V5A 1S6, Canada) ,  Ludington William B. (Department of Embrylogy, Carnegie Institution for Science, Baltimore, MD 21218) ,  Ludington William B. (Department of Biology, Johns Hopkins University, Baltimore, MD 21218)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 119  号： 7  ページ： e2115877119  発行年： 2022年 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 観察研究は,個体間のミクロビオーム組成の実質的な変動を明らかにした。ノトバイオティック動物における標的研究は,いくつかの細菌菌株が決定論的にコロニー形成することを示し,一方,他のコロニーは確率的にコロニーを形成することを示すことにより,この変動性を強調する。この変動性のいくつかは,環境,食事,および個体間の遺伝的差異のような外部因子によって説明可能であるが,本論文では,モデル生物Drosophila melanogasterに対して,細菌間の相互作用が微生物集合過程に影響し,同じに飼育され,収容され,給餌された同質遺伝子生物の間でさえ,ミクロビオーム変動のベースラインレベルに寄与することを示した。細菌種の既知組合せを与えた無胚ハエでは,同じ高濃度で給餌しても,いくつかの種が他より頻繁にコロニーを形成することを見出した。異なる状況におけるコロニー形成確率に基づく細菌種間の相互作用の存在を推論する生態学的手法を開発し,2種実験からの存在/不在データのみを必要とした。各細菌種のコロニー形成が独立した確率過程として扱われる確率モデルの進行性配列を用いて,実験にわたるコロニー形成結果の経験的分布を再現する。文脈依存相互作用を組み込むことは,モデルの性能を実質的に改善することを見出した。確率的,文脈依存ミクロビオーム集合は,糞便微生物叢移植およびプロバイオティクス投与のような臨床治療の基礎となり,合成糞便移植および投与処方の設計を知らせるべきである。Copyright 2022 The Author(s). Published by PNAS. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 確率過程 ,  相互作用 ,  微生物 ,  細菌 ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  細胞増殖 ,  生物 ,  ミクロフローラ ,  *コロニー ,  生態学 ,  確率モデル ,  プロバイオティクス
準シソーラス用語： キイロショウジョウバエ ,  高濃度 ,  コロニー形成 ,  同質遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： マイクロバイオーム ,  コミュニティ組立 ,  ショウジョウバエ ,  生態学的相互作用

分類 (2件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  細胞分裂・増殖  (EF02020D)

タイトルに関連する用語 (4件)： 確率 ,  マイクロバイオーム ,  集合 ,  文脈