文献

J-GLOBAL ID：202202240039214296   整理番号：22A0976858

分極Gauss多重極モデルのための応力テンソルと定圧シミュレーション【JST・京大機械翻訳】

Stress tensor and constant pressure simulation for polarizable Gaussian multipole model

著者 (4件)： Wei Haixin (Departments of Materials Science and Engineering, Molecular Biology and Biochemistry, Chemical and Biomolecular Engineering, and Biomedical Engineering, Graduate Program in Chemical and Materials Physics, University of California, Irvine, Irvine, California 92697, USA) ,  Cieplak Piotr (SBP Medical Discovery Institute, 10901 North Torrey Pines Road, La Jolla, California 92037, USA) ,  Duan Yong (UC Davis Genome Center and Department of Biomedical Engineering, University of California, Davis, One Shields Avenue, Davis, California 95616, USA) ,  Luo Ray (Departments of Materials Science and Engineering, Molecular Biology and Biochemistry, Chemical and Biomolecular Engineering, and Biomedical Engineering, Graduate Program in Chemical and Materials Physics, University of California, Irvine, Irvine, California 92697, USA)
資料名： Journal of Chemical Physics  (Journal of Chemical Physics)
巻： 156  号： 11  ページ： 114114-114114-15  発行年： 2022年 
JST資料番号： C0275A  ISSN： 0021-9606  CODEN： JCPSA6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 著者らの以前の論文は,分極性Gauss多重極(pGM)静電学[Wei et al.,J.Chem.Phys.153(11),114116(2020)]でモデル化した系に対する分子動力学(MD)シミュレーションの理論を確立した。特に,pGM静電気の効率的な実装を容易にするために,永久多重極と誘導閉形式エネルギーと力表現を定義するための共有基底ベクトルフレームワークを提案した。本研究では,pGM静電学による定圧MDシミュレーションのためのpGM内部応力テンソルを導出するために前進した。3つの異なる定式化を,それぞれ,柔軟で,剛性で,そして,短距離スクリーニングシステムのために提示した。解析式をAmberパッケージのSANDERプログラムに実装し,pGM水分子の2つの異なるボックスの有限差分法で初めて検証した。これに続いて,512pGM水分子のボックスに対する一定温度および定圧MDシミュレーションが続いた。著者らの結果は,シミュレーションシステムが物理的に妥当な状態で安定化し,外部適用圧力のバランスを維持することを示した。さらに,シミュレーション挙動に関してpGMと古典的点電荷モデルの間にいくつかの基本的差異が観察され,pGM静電気を利用するためにはより広範なパラメタリゼーションが必要であることを示した。Copyright 2022 AIP Publishing LLC All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 圧力 ,  温度 ,  差分法 ,  *シミュレーション ,  静電気 ,  *分極 ,  剛性 ,  *多重極 ,  定式化 ,  水分子 ,  分子動力学 ,  *応力テンソル
準シソーラス用語： 静電気学 ,  分子動力学シミュレーション ,  閉形式 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 物理化学一般  (CB01010X) ,  液体構造一般  (BK02010E) ,  溶液論一般  (CB05010Z)

タイトルに関連する用語 (5件)： 分極 ,  多重極 ,  モデル ,  応力テンソル ,  シミュレーション