文献

J-GLOBAL ID：202202240160117251   整理番号：22A0329322

NTRK融合検出のための標的次世代シークエンシングアッセイと標準物質の評価【JST・京大機械翻訳】

Evaluating Targeted Next-Generation Sequencing Assays and Reference Materials for NTRK Fusion Detection

著者 (12件)： Bormann Chung Christina (Genentech Research and Early Development, Genentech, Inc., South San Francisco, California) ,  Lee Jeeyun (Division of Hematology/Oncology, Samsung Medical Center Sungkyunkwan University School of Medicine, Seoul, Republic of Korea) ,  Barritault Marc (Department of Molecular Biopathology, Pathological Anatomy and Cytology, East Group Hospital, Hospices Civils de Lyon, Bron, France) ,  Bringuier Pierre-Paul (Department of Molecular Biopathology, Pathological Anatomy and Cytology, East Group Hospital, Hospices Civils de Lyon, Bron, France) ,  Bringuier Pierre-Paul (Histology Laboratory, Universite Claude Bernard Lyon 1, Villeurbanne, France) ,  Xu Zhaolin (Department of Pathology, QE II Health Sciences Center, Halifax, Nova Scotia, Canada) ,  Huang Weei-Yuarn (Department of Laboratory Medicine and Molecular Diagnostics, Sunnybrook Health Sciences Center, University of Toronto, Toronto, Ontario, Canada) ,  Beharry Andrea (Department of Laboratory Medicine, William Osler Health System, Brampton, Ontario, Canada) ,  Castillo Joseph (Genentech Research and Early Development, Genentech, Inc., South San Francisco, California) ,  Christiansen Jason (Assay Development, Roche Sequencing Solutions, Inc., Pleasanton, California) ,  Lin Jennifer C. (Genentech Research and Early Development, Genentech, Inc., South San Francisco, California) ,  Sheffield Brandon S. (Department of Laboratory Medicine, William Osler Health System, Brampton, Ontario, Canada)
資料名： Journal of Molecular Diagnostics  (Journal of Molecular Diagnostics)
巻： 24  号： 1  ページ： 18-32  発行年： 2022年 
JST資料番号： W3144A  ISSN： 1525-1578  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 神経栄養性チロシン受容体キナーゼ(NTRK1/2/3)融合は,固形腫瘍の約0.3%で発癌性ドライバーである。トロポミオシン受容体キナーゼ阻害剤から利益を得ることができるNTRK融合陽性腫瘍患者を同定するための高品質試験が推奨されるが,次世代シークエンシング(NGS)を含む現在のNTRK試験景観は断片化され,アッセイのアベイラビリティは広く異なる。4つの一般的に利用できるRNAベースのNGSアッセイ,Archerの融合Plex Lung Panel(AFL),Illumina TruSight Oncology 500(TSO500),Thermo Fisher Oncomin精度アッセイ及びOncomin Center Assay(OFA)の分析及び臨床成績を評価した。局所アッセイに従って,実験が,摘出試料[ホルマリン固定,パラフィン包埋細胞株およびSeraSeqホルマリン固定,パラフィン包埋参照材料],NTRK融合陰性臨床試料,およびNTRK融合陽性臨床検体を用いて行われた。検出の推定値は4つのアッセイで変化した:AFL(細胞株)の30から620の融合コピー,TSO500のおよそ30から290コピー,OFAとOncominの精密検査のおよそ1から28コピー。すべての分析はNTRK融合検出に対して100%の特異性を示したが,品質管理パス率は可変(AFL,43%;TSO500,77%;およびOFA,83%)であった。品質管理検証臨床試料におけるNTRK融合検出率は,すべてのアッセイで100%であった。4つのRNAベースのNGSアッセイの強度と限界のこの比較は,NTRK融合陽性腫瘍患者を同定するための最適アッセイ選択に関して医師と病理学者を知らせる。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 品質管理 ,  RNA【核酸】 ,  腫瘍 ,  受容体 ,  発癌性 ,  *標準物質 ,  アベイラビリティ ,  トロポミオシン ,  *遺伝学実験技術 ,  推定量 ,  品質検査 ,  固形腫瘍
準シソーラス用語： 細胞株 ,  特異性 ,  臨床検体 ,  *次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 抗腫よう薬の臨床への応用  (GW16020L) ,  腫ようの薬物療法  (GE03032C)

タイトルに関連する用語 (6件)： 融合 ,  標的 ,  次世代シークエンシング ,  アッセイ ,  標準物質 ,  評価