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J-GLOBAL ID：202202240267148972   整理番号：22A1025031

遺伝子EDIL3およびADGRB3内の変異体は離乳時のKatahdinヒツジにおける多様な糞便卵数と関連する【JST・京大機械翻訳】

Variants Within Genes EDIL3 and ADGRB3 are Associated With Divergent Fecal Egg Counts in Katahdin Sheep at Weaning

著者 (9件)： Becker Gabrielle M. (1Department of Animal, Veterinary and Food Sciences, University of Idaho, Moscow, ID, United States) ,  Burke Joan M. (2USDA, ARS, Dale Bumpers Small Farms Research Center, Booneville, AR, United States) ,  Lewis Ronald M. (3Department of Animal Science, University of Nebraska-Lincoln, Lincoln, NE, United States) ,  Miller James E. (4Department of Pathobiological Sciences, School of Veterinary Medicine, Louisiana State University, Baton Rouge, LA, United States) ,  Morgan James L. M. (5Round Mountain Consulting, Fayetteville, AR, United States) ,  Rosen Benjamin D. (6USDA, ARS, Animal Genomics and Improvement Laboratory, Beltsville, MD, United States) ,  Van Tassell Curtis P. (6USDA, ARS, Animal Genomics and Improvement Laboratory, Beltsville, MD, United States) ,  Notter David R. (7Department of Animal and Poultry Sciences, Virginia Tech, Blacksburg, VA, United States) ,  Murdoch Brenda M. (1Department of Animal, Veterinary and Food Sciences, University of Idaho, Moscow, ID, United States)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 817319  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 胃腸線虫(GIN)は世界的にヒツジ生産に深刻な脅威をもたらす。薬剤使用の潜在的環境効果に関する成長懸念と結びついた駆虫薬耐性は,GIN制御の他の方法を実行する必要性を示した。本研究の目的は,GINに対する宿主応答に関与する遺伝的機構の現在の理解を改善するために,KatahdinヒツジにおけるGINに対する耐性または感受性と関連する遺伝的変異を試験することであった。583Katahdinヒツジの高密度遺伝子型データと立方根形質転換離乳糞便卵数(tFEC)を用いて,線形回帰と症例対照研究を行った。ケースコントロールGWASは,より低い糞便卵数と関連した遺伝子接着G蛋白質共役受容体B3(ADGRB3)のイントロン内で2つの有意なSNP(P値1.49e-08から1.01e-08)を同定した。線形回帰で,4つの有意なSNP(P値7.82e-08から3.34e-08)を,遺伝子EGF様反復と円板状ドメイン3(EDIL3)の最初のイントロン内で同定した。これらの同定されたSNPは,非常に高い連鎖不均衡(r20.996-1)であり,代替ホモ接合遺伝子型を有する動物は,他のすべての遺伝子型と比較して,有意に高い離乳tFEC表現型を有した。有意なSNPは,推定転写因子結合部位(TFBS)と参照と代替対立遺伝子の間の潜在的lncRNA差異を同定するために,公共データベースを通して質問された。TFBSの変化は2つのSNPで予測され,1つの有意なSNPは,ウシゲノムにおいて既知のlncRNAと90%以上の類似性を持つ予測lncRNA配列内にあることを見出した。遺伝子EDIL3は炎症の阻害と分解におけるその役割のために他の種で記載されている。lncRNA発現および/または転写因子結合を介したEDIL3発現の潜在的変化は,全体的な免疫応答に影響し,GIN感染を制御するKatahdinヒツジの能力を低下させる可能性がある。本研究は,GINへの感受性の遺伝的メカニズムの理解に向けたEDIL3とADGRB3のさらなる研究の基礎を築くものであり,これらのSNPsがヒツジの寄生虫耐性形質を改善するための遺伝学的戦略に寄与することを示唆する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *遺伝 ,  *遺伝子 ,  遺伝子型 ,  炎症 ,  寄生虫 ,  成長 ,  線虫類 ,  *ヒツジ ,  免疫反応 ,  対立遺伝子 ,  *離乳 ,  イントロン ,  転写因子 ,  ゲノムワイド関連解析

著者キーワード (5件)： 胃腸線虫 ,  ぜん虫 ,  寄生虫 ,  GWAS ,  毛ヒツジ

分類 (2件)： 羊,山羊  (FD02050F) ,  動物の寄生虫病  (FE02030M)

引用文献 (106件)：

• AboshadyH. M., StearM. J., JohanssonA., JonasE., BambouJ. C. (2020). Immunoglobulins as Biomarkers for Gastrointestinal Nematodes Resistance in Small Ruminants: A Systematic Review. Sci. Rep. 10 (1), 7765. doi: 10.1038/s41598-020-64775-x
• AhbaraA. M., RouatbiM., GharbiM., RekikM., HaileA., RischkowskyB., et al (2021). Genome-wide Insights on Gastrointestinal Nematode Resistance in Autochthonous Tunisian Sheep. Sci. Rep. 11 (1), 9250. doi: 10.1038/s41598-021-88501-3
• Al KalaldehM., GibsonJ., LeeS. H., GondroC., van der WerfJ. H. J. (2019). Detection of Genomic Regions Underlying Resistance to Gastrointestinal Parasites in Australian Sheep. Genet. Sel Evol. 51 (1), 37. doi: 10.1186/s12711-019-0479-1
• ArdlieK. G., KruglyakL., SeielstadM. (2002). Patterns of Linkage Disequilibrium in the Human Genome. Nat. Rev. Genet. 3, 299-309. doi: 10.1038/nrg777
• BallantyneM., McDonaldR., BakerA. (2016). lncRNA/MicroRNA Interactions in the Vasculature. Clin. Pharmacol. Ther. 99 (5), 494-501. doi: 10.1002/cpt.355

タイトルに関連する用語 (6件)： 遺伝子 ,  変異体 ,  離乳 ,  ヒツジ ,  糞便 ,  卵数