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J-GLOBAL ID：202202240368033967   整理番号：22A1179015

固着細菌培養中の種間相互作用の代謝プロファイリングは,Xanthomonas retroflexusに応答してPaenibacillus amylolyticusの増殖および胞子形成誘導を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Metabolic Profiling of Interspecies Interactions During Sessile Bacterial Cultivation Reveals Growth and Sporulation Induction in Paenibacillus amylolyticus in Response to Xanthomonas retroflexus

著者 (14件)： Herschend Jakob (1Section of Microbiology, Department of Biology, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark) ,  Ernst Madeleine (2Collaborative Mass Spectrometry Innovation Center, Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, University of California, San Diego, La Jolla, CA, United States) ,  Ernst Madeleine (3Section for Clinical Mass Spectrometry, Danish Center for Neonatal Screening, Department of Congenital Disorders, Statens Serum Institut, Copenhagen, Denmark) ,  Koren Klaus (4Aarhus University Centre for Water Technology (WATEC), Department of Biology, Aarhus University, Aarhus, Denmark) ,  Melnik Alexey V. (2Collaborative Mass Spectrometry Innovation Center, Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, University of California, San Diego, La Jolla, CA, United States) ,  da Silva Ricardo R. (2Collaborative Mass Spectrometry Innovation Center, Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, University of California, San Diego, La Jolla, CA, United States) ,  Roder Henriette L. (1Section of Microbiology, Department of Biology, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark) ,  Damholt Zacharias B. V. (5Department of Biotechnology and Biomedicine, Technical University of Denmark, Kgs Lyngby, Denmark) ,  Haegglund Per (5Department of Biotechnology and Biomedicine, Technical University of Denmark, Kgs Lyngby, Denmark) ,  Svensson Birte (5Department of Biotechnology and Biomedicine, Technical University of Denmark, Kgs Lyngby, Denmark) ,  Sorensen Soren J. (1Section of Microbiology, Department of Biology, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark) ,  Kuehl Michael (6Marine Biological Section, Department of Biology, University of Copenhagen, Helsingor, Denmark) ,  Dorrestein Pieter C. (2Collaborative Mass Spectrometry Innovation Center, Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, University of California, San Diego, La Jolla, CA, United States) ,  Burmolle Mette (1Section of Microbiology, Department of Biology, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark)
資料名： Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (Web)  (Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (Web))
巻： 12  ページ： 805473  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7063A  ISSN： 2235-2988  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 種間相互作用を研究するための微生物学者のために利用可能なツールボックスは,急速に成長し,そして,連続的により高度な装置によって,著者らは,微生物群落の確立と機能に関する著者らの知識を拡大することができた。しかし,複雑な生体系における分子種間相互作用の解明は課題として残っており,従って,相互作用は単純化されたコミュニティにおいてしばしば研究されている。ここでは,2つの共分離細菌,Xanthomonas retroflexusとPaenibacillus amylolyticusの間の観察された種間相互作用の詳細な特性化を行った。化学的環境をマッピングするためのマイクロセンサ測定を用いて,X.retroflexusがアミノ酸の分解とアンモニアの放出を介してその局所環境のアルカリ化を促進する方法を示した。2つの種が近接して成長したとき,改良局所環境は,P.amylolyticusの形態学的変化と成長を誘発し,続いて胞子形成を誘導した。2D空間メタボロミクスは,X.retroflexusによるオリゴペプチド構造の分解の可視化とマッピングと,例えば膜関連代謝産物の放出によるP.amylolyticusの形態学的変化を可能にした。プロテオーム分析と顕微鏡を用いて,栄養成長から胞子形成への移行を検証した。要約すると,マイクロセンサ,顕微鏡,メタボロミクスおよびプロテオミクスアプローチの組み合わせ適用による環境プロファイリングが,種間相互作用から生じる増殖および胞子形成促進効果を明らかにすることができる。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *付着 ,  解析 ,  アンモニア ,  アミノ酸 ,  *代謝 ,  *胞子形成 ,  可視化 ,  オリゴペプチド ,  *Xanthomonas ,  二次元 ,  ミクロフローラ ,  モルフォロジー ,  プロテオミクス ,  プロテオーム
準シソーラス用語： メタボロミクス ,  オミックス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： pH安定化 ,  オミクス ,  胞子形成 ,  マイクロセンサ ,  種間相互作用

分類 (3件)： 異種生物間相互作用  (EE01050A) ,  微生物生理一般  (EG03051L) ,  微生物の生態  (EG03040J)

引用文献 (72件)：

• Anand D., Chaudhuri A. (2016). Bacterial Outer Membrane Vesicles: New Insights and Applications. Mol. Membr Biol. 33, 125-137. doi: doi: 10.1080/09687688.2017.1400602
• Aziz R. K., Bartels D., Best A. A., DeJongh M., Disz T., Edwards R. A., et al. (2008). The RAST Server: Rapid Annotations Using Subsystems Technology. BMC Genomics 9, 75. doi: doi: 10.1186/1471-2164-9-75
• Bagyan I., Noback M., Bron S., Paidhungat M., Setlow P. (1998). Characterization of Yhcn, a New Forespore-Specific Gene of Bacillus Subtilis. Gene 212, 179-188. doi: doi: 10.1016/S0378-1119(98)00172-3
• Becking L. G. M. B., Canfield D. E. (2015). Baas Becking’s Geobiology (Chichester, UK: John Wiley & Sons, Ltd). doi: doi: 10.1002/9781118295472
• Benjamini Y., Hochberg Y. (1995). Controlling the False Discovery Rate: A Practical and Powerful Approach to Multiple Testing. J. R. Stat. Soc Ser. B 57, 289-300. doi: doi: 10.1111/j.2517-6161.1995.tb02031.x

タイトルに関連する用語 (10件)： 細菌培養 ,  種間相互作用 ,  代謝 ,  プロファイリング ,  Xanthomonas ,  応答 ,  Paenibacillus ,  増殖 ,  胞子形成 ,  誘導