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J-GLOBAL ID：202202240428763804   整理番号：22A0448624

タバコ(Nicotiana tabacum)におけるミトコンドリアシチジン-ウリジンRNAエディティングの動的景観はその組織特異性を示す【JST・京大機械翻訳】

Dynamic landscape of mitochondrial Cytidine-to-Uridine RNA editing in tobacco (Nicotiana tabacum) shows its tissue specificity

著者 (16件)： Fang Jing (Key Laboratory of Plant Germplasm Enhancement and Specialty Agriculture, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, Hubei, China) ,  Fang Jing (Center of Economic Botany, Core Botanical Gardens, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, Hubei, China) ,  Fang Jing (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Jiang Xiaohan (Key Laboratory of Plant Germplasm Enhancement and Specialty Agriculture, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, Hubei, China) ,  Jiang Xiaohan (Center of Economic Botany, Core Botanical Gardens, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, Hubei, China) ,  Jiang Xiaohan (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Wang Tengfei (Key Laboratory of Plant Germplasm Enhancement and Specialty Agriculture, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, Hubei, China) ,  Wang Tengfei (Center of Economic Botany, Core Botanical Gardens, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, Hubei, China) ,  Wang Tengfei (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Deng Zhiyu (Key Laboratory of Plant Germplasm Enhancement and Specialty Agriculture, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, Hubei, China) ,  Deng Zhiyu (Center of Economic Botany, Core Botanical Gardens, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, Hubei, China) ,  Deng Zhiyu (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Zhang Aidi (Key Laboratory of Plant Germplasm Enhancement and Specialty Agriculture, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, Hubei, China) ,  Zhang Aidi (Center of Economic Botany, Core Botanical Gardens, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, Hubei, China) ,  Zhang Xiujun (Key Laboratory of Plant Germplasm Enhancement and Specialty Agriculture, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, Hubei, China) ,  Zhang Xiujun (Center of Economic Botany, Core Botanical Gardens, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, Hubei, China)
資料名： Plant Cell, Tissue and Organ Culture  (Plant Cell, Tissue and Organ Culture)
巻： 148  号： 2  ページ： 363-376  発行年： 2022年 
JST資料番号： W0852A  ISSN： 0167-6857  CODEN： PTCEDJ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNA編集は高等植物におけるRNAレベルでの一般的なヌクレオチド修飾である。しかし,組織間のRNA編集の動的分布についてはほとんど知られていない。本研究では,タバコ(Nicotiana tabacum)におけるミトコンドリアRNAエディティングの組織特異性を,4つのタバコ組織:根,茎,葉,および花からの公的に利用可能なRNA-seqデータに基づいて調査した。その結果,60のミトコンドリア遺伝子に関与する473のRNA編集部位を同定した。結果は,タバコ組織の間の編集部位の不均等な分布を示し,合計106の部位と11の遺伝子が4つの生体組織における組織特異的編集として同定され,6つの遺伝子に位置する合計11の部位が,統計的(p-値<0.01)に差別的に編集された。RNA編集遺伝子とRNA編集因子の発現を分析し,ほとんどの組織特異的編集遺伝子が低レベルで発現することを観察した。異なる組織間で差次的に発現した約20のRNA編集因子があり,異なる組織でのRNA編集の不均一性がRNA編集因子の発現調節から生じることを示した。著者らの分析は,高等植物におけるRNA編集事象の景観,調節,および機能の理解への洞察を提供する。重要なメッセージ:保存編集部位の動的景観はタバコにおけるミトコンドリアRNA編集の組織特異性を明らかにした。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature B.V. 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *タバコ ,  生体組織 ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  ヌクレオチド ,  *ミトコンドリア ,  *組織特異性 ,  不均一性 ,  ミトコンドリア遺伝子 ,  *RNAエディティング
準シソーラス用語： 発現調節 ,  高等植物 ,  RNA-seq ,  ミトコンドリアRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： RNA編集 ,  ミトコンドリア ,  PPR ,  組織特異性

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (8件)： タバコ ,  Nicotiana ,  ミトコンドリア ,  シチジン ,  ウリジン ,  RNAエディティング ,  景観 ,  組織特異性