サツマイモDof遺伝子ファミリーマイニングおよび発現分析【JST・京大機械翻訳】

Jin Rong; Jiang Wei; Liu Ming; Zhao Peng; Zhang Qiangqiang; Li Tiexin; Wang Danfeng; Fan Wenjing; Zhang Aijun; Tang Zhonghou

文献

J-GLOBAL ID：202202240529220897 整理番号：22A0990500

サツマイモDof遺伝子ファミリーマイニングおよび発現分析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide characterization and expression analysis of Dof family genes in sweetpotato

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著者 (10件)： , , , , , , , , ,
資料名：
巻： 48 号： 3 ページ： 608-623 発行年： 2022年
JST資料番号： C2128A ISSN： 0496-3490 CODEN： TSHPA9 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：中国語 (ZH)

単亜鉛フィンガータンパク質スーパーファミリーDof(DNAbindingwithonefinger)転写因子は植物の各種生命活動に幅広く関与している。サツマイモ泰中6号のゲノムを参照として、46個のサツマイモDof遺伝子を獲得し、各ファミリーメンバーはC2-Dof亜鉛フィンガー構造を持ち、その染色体上の位置に従って、IbDof1~IbDof46と命名した。この遺伝子ファミリーは4つのサブファミリー(AD)に分類でき、異なるサブファミリーの遺伝子構造とモチーフの分布は著しい差異がある。モチーフ1とモチーフ2は全てのサブファミリーに存在し,モチーフ5とモチーフ9はサブファミリーAにのみ存在し,モチーフ6,モチーフ7,モチーフ8とモチーフ10はサブファミリーDに存在した。IbDofの進化は極めて保守的で,12対の染色体複製事象と5対の直列反復配列イベント(IbDof2/IbDof3,IbDof12/IbDof13,IbDof9/IbDof10)を共有した。IbDof28/IbDof29およびIbDof32/IbDof33),分岐時間平均は3552万年前および186万年前であり,Ka/Ks比は0.07(IbDof12/IbDof13)から0であった。68(IbDof6/IbDof25)は、サツマイモの野生近縁種Ipomoeatrifidaと同じ染色体上のDof相同遺伝子対38対がある。組織特異性分析によると、IbDof各亜族は各組織器官において発現強度が異なるが、亜族内部は異なる発現傾向を示した。IbDofプロモーター配列には、逆境とホルモン応答などの関連要素が含まれており、リアルタイム蛍光定量PCRの更なる分析は、IDof遺伝子が低温、干ばつ、高塩とH2O2などの非生物的ストレスによって誘導されることを示している。例えば、大部分のIbDofは低温制御により発現される。IbDof10とIbDof14は乾燥ストレスによって誘導される。IbDof2,IbDof14,IbDof37,IbDof41およびIbDof43は,高塩分によって誘導された。IbDof8、IbDof10、IbDof25とIbDof41はH2O2によって誘導され、これはIbDofファミリーメンバーが協同的にサツマイモの成長発育と非生物的ストレス過程に関与することを表明した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

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分子遺伝学一般

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