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J-GLOBAL ID：202202241072658584   整理番号：22A0570684

全球規模での都市微生物の未知種の注釈は新しい機能的多様性と地域環境関連を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Annotating unknown species of urban microorganisms on a global scale unveils novel functional diversity and local environment association

著者 (43件)： Wu Jun (Center for Bioinformatics and Computational Biology, and the Institute of Biomedical Sciences, School of Life Sciences, East China Normal University, Shanghai, 200241, China) ,  Danko David (Weill Cornell Medicine, USA) ,  Danko David (The Bin Talal Bin Abdulaziz Alsaud Institute for Computational Biomedicine, USA) ,  Afshinnekoo Ebrahim (Weill Cornell Medicine, USA) ,  Afshinnekoo Ebrahim (The Bin Talal Bin Abdulaziz Alsaud Institute for Computational Biomedicine, USA) ,  Bezdan Daniela (Weill Cornell Medicine, USA) ,  Bezdan Daniela (The Bin Talal Bin Abdulaziz Alsaud Institute for Computational Biomedicine, USA) ,  Bhattacharyya Malay (Machine Intelligence Unit, Indian Statistical Institute, Kolkata, India) ,  Bhattacharyya Malay (Centre for Artificial Intelligence and Machine Learning, Indian Statistical Institute, Kolkata, India) ,  Castro-Nallar Eduardo (Universidad Andres Bello, Center for Bioinformatics and Integrative Biology, Facultad de Ciencias de la Vida, Argentina) ,  Chmielarczyk Agnieszka (Jagiellonian University, Faculty of Medicine, Department of Microbiology, Poland) ,  Hazrin-Chong Nur Hazlin (Department of Biological Sciences and Biotechnology, Faculty of Science and Technology, Universiti Kebangsaan Malaysia, 43600, UKM Bangi, Selangor, Malaysia) ,  Deng Youping (University of Hawaii, John A. Burns School of Mecidine, USA) ,  Dias-Neto Emmanuel (Medical Genomics Group, A.C. Camargo Cancer Center and LIM-27 Faculdade de Medicina, USP, Sao Paulo, Brazil) ,  Frolova Alina (Institute of Molecular Biology and Genetics of National Academy of Science of Ukraine, Ukraine) ,  Mason-Buck Gabriella (Department of Analytical, Environmental and Forensic Sciences, King’s College London, UK) ,  Iraola Gregorio (Microbial Genomics Laboratory, Institut Pasteur de Montevideo, Uruguay) ,  Iraola Gregorio (Center for Integrative Biology, Universidad Mayor, Santiago de Chile, Chile) ,  Iraola Gregorio (Wellcome Sanger Institute, Hinxton, United Kingdom) ,  Jang Soojin (Institut Pasteur Korea, South Korea) ,  Labaj Pawel (Malopolska Centre of Biotechnology, Jagiellonian University, Poland) ,  Lee Patrick K.H. (School of Energy and Environment, City University of Hong Kong, Hong Kong SAR, China) ,  Nieto-Caballero Marina (University of Colorado at Boulder, Civil, Environmental and Architectural Department, Boulder, 80303, USA) ,  Osuolale Olayinka O. (Applied Environmental Metagenomics and Infectious Diseases Research (AEMIDR), Department of Biological Sciences, Elizade University, Nigeria) ,  Ouzounis Christos A. (BCPL-CPERI, Centre for Research & Technology Hellas, Thessalonica, GR, 57001, Greece) ,  Perlin Michael H. (Department of Biology, Program on Disease Evolution, University of Louisville, Louisville, KY, 40292, USA) ,  Prithiviraj Bharath (Reckitt Health, Montvale, NJ, USA) ,  Prithiviraj Bharath (Dept. of Biology, City University of New York, Brooklyn, 11210, NY, USA) ,  Rascovan Nicolas (Aix-Marseille Universite, IRD, AP-HM, IHU Mediterranee Infection, France) ,  Rozanska Anna (Jagiellonian University, Faculty of Medicine, Department of Microbiology, Poland) ,  Schriml Lynn M. (University of Maryland School of Medicine, Institute for Genome Sciences, USA) ,  Semmler Torsten (Robert Koch Institute Berlin, Germany) ,  Suzuki Haruo (Faculty of Environment and Information Studies, Keio University, Fujisawa, Kanagawa, Japan) ,  Ugalde Juan A. (Millennium Initiative for Collaborative Research on Bacterial Resistance, Germany) ,  Young Ben (Weill Cornell Medicine, USA) ,  Young Ben (The Bin Talal Bin Abdulaziz Alsaud Institute for Computational Biomedicine, USA) ,  Werner Johannes (High Performance and Cloud Computing Group, Zentrum fuer Datenverarbeitung (ZDV), Eberhard Karls University of Tuebingen, Waechterstrasse 76, 72074, Tuebingen, Germany) ,  Zambrano Maria Mercedes (Corporacion Corpogen Research Center, Bogota, Colombia) ,  Zhao Yongxiang (Biological Targeting Diagnosis and Therapy Research Center, Guangxi Medical University, Nanning, 530021, China) ,  Mason Christopher (Weill Cornell Medicine, USA) ,  Mason Christopher (The Bin Talal Bin Abdulaziz Alsaud Institute for Computational Biomedicine, USA) ,  Shi Tieliu (Center for Bioinformatics and Computational Biology, and the Institute of Biomedical Sciences, School of Life Sciences, East China Normal University, Shanghai, 200241, China) ,  Shi Tieliu (Beijing Advanced Innovation Center for Big Data-Based Precision Medicine, Beihang University & Capital Medical University, Beijing, 100083, China)
資料名： Environmental Research  (Environmental Research)
巻： 207  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： D0574A  ISSN： 0013-9351  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 都市生態系において,微生物はヒトの健康と都市生活を直接支持する主要な生態学的機能を維持する際に重要な役割を果たす。しかし,都市環境に関与する種構成と機能に関する知識はまだ限られており,これは主にメタゲノム研究における参照ゲノムの欠如が未分類の読み取りの半分以上から成る。ここでは,MetaSUB Consortiumによって60の都市を横断して,マストランジットシステムにおけるマッチング材料によって,種々の一般的表面から採取した4728の試料から732の新規な細菌種を明らかにした。新種の数は都市集団と有意に正に相関し,より新しい種は皮膚関連試料で同定できる。新しい遺伝子カタログの詳細な分析は,機能的用語が有意な地理的識別性を有することを示した。さらに,著者らは,より多くの生合成遺伝子クラスタ(BGC)が新種で発見できることを明らかにした。BGCと属間の共起関係とBGCの地理的特異性も,天然物の合成経路のためのより多くの情報を提供することができる。既知の都市ミクロビオーム多様性を拡大して,都市ミクロビオームの分類と機能的特性化のための付加的機構を示唆した。人間生活に及ぼす都市ミクロビオームの大きな影響を考慮して,著者らの研究は,人間と都市環境の間の微生物相互作用解析を容易にすることができた。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *微生物 ,  細菌 ,  *都市 ,  生合成 ,  遺伝子 ,  ゲノム ,  生態学 ,  新種 ,  都市環境
準シソーラス用語： 遺伝子クラスタ ,  常在菌叢ゲノム ,  メタゲノム ,  微生物相互作用 ,  合成経路 ,  ヒトの健康 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 都市環境マイクロバイオーム ,  メタゲノム解析 ,  新しい種の発見 ,  機能的多様性 ,  生合成遺伝子クラスター

分類 (2件)： 環境汚染一般  (SB01000C) ,  粒状物調査測定  (SB03060E)

タイトルに関連する用語 (6件)： 全球規模 ,  都市 ,  微生物 ,  注釈 ,  多様性 ,  地域環境