文献

J-GLOBAL ID：202202242678500079   整理番号：22A0222752

綿繊維とファジー発生中のGL2相互作用レプレッサー(GIR)遺伝子のゲノムワイド同定と発現解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide identification and expression analysis of GL2-interacting-repressor (GIR) genes during cotton fiber and fuzz development

著者 (10件)： Feng Xiaoxu (State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, Henan, China) ,  Feng Xiaoxu (Plant Genetics, Gembloux Agro Bio-Tech, University of Liege, Gembloux, Belgium) ,  Cheng Hailiang (State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, Henan, China) ,  Zuo Dongyun (State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, Henan, China) ,  Zhang Youping (State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, Henan, China) ,  Wang Qiaolian (State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, Henan, China) ,  Lv Limin (State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, Henan, China) ,  Li Shuyan (State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, Henan, China) ,  Yu John Z. (Southern Plains Agricultural Research Center, USDA-ARS, Crop Germplasm Research Unit, College Station, Texas, USA) ,  Song Guoli (State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, Henan, China)
資料名： Planta  (Planta)
巻： 255  号： 1  ページ： 23  発行年： 2022年 
JST資料番号： C0607A  ISSN： 0032-0935  CODEN： PLANAB  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 主な結論:GL2相互作用レプレッサー(GIR)ファミリーメンバーは,Gossypium arboreumにおける新規に発見されたユニークな経路を介した繊維/ファジィ形成に寄与する可能性がある。ワタ繊維発達と毛状突起と根毛の形成の間には類似性がある。GL2相互作用レプレッサー(GIR)は根毛と毛状突起形成の重要な調節因子である。GaGIR1として注釈付けされたGaFzl遺伝子は,トリコーム発生とファジィ開始と負の関係がある。しかし,ワタの他のGIR遺伝子に関する利用可能な情報は比較的少なく,特にワタの繊維発達への影響に関してもそうである。本研究では,21のGIRファミリー遺伝子を2倍体ワタ種Gossypium arboreumにおいて同定した;これらの遺伝子を3群に分けた。GIR遺伝子は,それらの系統発生関係,構造,染色体分布および進化動態に関して特徴づけた。これらのGIR遺伝子は,Ga06上で検出されたGIR遺伝子なしで,二倍体ワタゲノムの12の染色体に不均等に分布していることが明らかになった。プロモーター領域のシス作用要素は,光,植物ホルモン,防御活性及びストレスに応答すると予測された。トランスクリプトミクスデータとqRT-PCRの結果は,ほとんどのGIR遺伝子が野生型対照とフズレス変異系統の間で異なって発現されないことを明らかにした。さらに,21のファミリー遺伝子の14は高レベルで発現し,これらの遺伝子が繊維発生とファジィ形成の間に重要な役割を担っていることを示した。さらに,Ga01G0231は主に根サンプルで発現し,フズ開始および発生よりも根毛形成における役割を示唆した。本研究の結果は,GIR遺伝子の理解と,育種によるワタ繊維の改善へのそれらの潜在的有用性を強化した。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *相互作用 ,  *遺伝子 ,  染色体 ,  植物ホルモン ,  系統発生 ,  育種 ,  *レプレッサー ,  プロモーター領域 ,  根毛 ,  二倍体 ,  野生型 ,  ワタ属
準シソーラス用語： トランスクリプトーム解析 ,  調節因子 ,  トリコーム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： シス作用要素 ,  発現パターン ,  ファミリー遺伝子 ,  Gossypium arboreum ,  GaGIR

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  繊維料作物  (FC03077U)

タイトルに関連する用語 (8件)： 綿繊維 ,  ファジー ,  相互作用 ,  レプレッサー ,  遺伝子 ,  ゲノム ,  同定 ,  発現解析