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J-GLOBAL ID：202202242906450093   整理番号：22A0315259

CCKA受容体のEGFR,LDR及びN末端フラグメントとペプチド結合コレステロール代謝産物及びベツリン酸の相互作用のin silico研究【JST・京大機械翻訳】

In silico studies of interactions of peptide-conjugated cholesterol metabolites and betulinic acid with EGFR, LDR, and N-terminal fragment of CCKA receptors

著者 (5件)： Bashant Madeline M. (Department of Chemistry, Fordham University, Bronx, NY, USA) ,  Mitchell Saige M. (Department of Chemistry, Fordham University, Bronx, NY, USA) ,  Hart Lucy R. (Department of Chemistry, Fordham University, Bronx, NY, USA) ,  Lebedenko Charlotta G. (Department of Chemistry, Fordham University, Bronx, NY, USA) ,  Banerjee Ipsita A. (Department of Chemistry, Fordham University, Bronx, NY, USA)
資料名： Journal of Molecular Modeling  (Journal of Molecular Modeling)
巻： 28  号： 1  ページ： 16  発行年： 2022年 
JST資料番号： W4628A  ISSN： 1610-2940  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,コレステロール代謝産物3-ヒドロキシ-5-コレステレン酸(3-HC)と3-オキソ-4-コレステレン酸(3-OC)および天然トリテルペノイドベツリン酸を腫瘍標的化ペプチドYHWYGYTPQNVIと共役させることにより3種の新規リガンドを設計した。非共役ペプチドと複合体との分子間相互作用を,リガンドドッキングと分子動力学を用いて膵臓腺癌細胞で一般的に過剰発現する3つの受容体で調べた。本研究は,EGFRとLDLR受容体を潜在的に標的化するための貴重な足場として設計した複合体の有用性を実証した。結果は,複合体がEGFRと強い結合親和性と安定な複合体の形成を示し,一方,非共役ペプチド,BT-ペプチド複合体,3-HC-ペプチド抱合体はLDLR受容体とかなり安定な複合体の形成を示した。EGFRに対して,2つの受容体キナーゼドメインを調べた。CCKA-RのN末端ドメインとの相互作用は比較的弱かった。LDLRでは,βプロペラ領域で結合が生じた。CCKA-RのN末端フラグメントに対して,複合体は受容体において有意な配座転移を誘導した。100nsの分子動力学シミュレーションは,BT-ペプチド複合体と非共役ペプチドが最高の結合を有し,EGFRと最も安定な複合体を形成することを示した。RMSDと軌道解析は,これらの分子が60ns以内で,ほとんどの場合,動的に安定な形態へ移行することを示した。NMA分析は,各々の受容体と比較的高い相互作用を示す抱合体の間で,変形能に対する最も高い電位が,CCKA-R受容体のN末端-47アミノ酸領域およびLDLR-受容体に対し最も低いことを示した。このように,新しく設計した化合物は,LDLRまたはEGFRを過剰発現する腫瘍細胞を標的化するための薬剤デリバリー材料を開発するため,将来評価できる。グラフ抽象;Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 分子 ,  分子間相互作用 ,  計算機シミュレーション ,  配座転移 ,  *ペプチド ,  共役 ,  腫瘍細胞 ,  複合体 ,  親和性 ,  分子動力学 ,  遺伝子発現 ,  ターゲティング ,  *EGF受容体
準シソーラス用語： リガンド ,  結合親和性 ,  ドメイン構造 ,  分子動力学シミュレーション ,  過剰発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 受容体ターゲティング ,  過剰発現 ,  腫瘍標的ペプチド ,  コレステロール誘導体 ,  EGFR ,  LDLR

分類 (1件)： 細胞膜の受容体  (EF04030C)

タイトルに関連する用語 (11件)： 受容体 ,  EGFR ,  LDR ,  N末端 ,  フラグメント ,  ペプチド結合 ,  コレステロール ,  代謝産物 ,  ベツリン酸 ,  相互作用 ,  研究