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J-GLOBAL ID：202202243123098107   整理番号：22A0971982

プロテオームワイド架橋質量分析のための二次元分画法【JST・京大機械翻訳】

Two-Dimensional Fractionation Method for Proteome-Wide Cross-Linking Mass Spectrometry Analysis

著者 (6件)： Jiao Fenglong (Department of Physiology & Biophysics, University of California, Irvine, California, United States) ,  Yu Clinton (Department of Physiology & Biophysics, University of California, Irvine, California, United States) ,  Wheat Andrew (Department of Physiology & Biophysics, University of California, Irvine, California, United States) ,  Wang Xiaorong (Department of Physiology & Biophysics, University of California, Irvine, California, United States) ,  Rychnovsky Scott D. (Department of Chemistry, University of California, Irvine, California, United States) ,  Huang Lan (Department of Physiology & Biophysics, University of California, Irvine, California, United States)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 94  号： 10  ページ： 4236-4242  発行年： 2022年 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 架橋質量分析(XL-MS)は,蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)の研究および蛋白質複合体の構造の解明のための緊急技術である。種々のMS開裂架橋剤の開発は架橋ペプチドの同定を促進し,システムレベルでのXL-MS研究を可能にした。しかし,現在のXL-MS技術により明らかにされた細胞ネットワークの範囲と深さは限られている。プロテオームの本質的に広いダイナミックレンジと複雑性のため,高度に豊富な蛋白質からの干渉は複雑な試料中の低豊度架橋ペプチドの同定を妨げる。したがって,MS分析前のペプチド濃縮はプロテオームワイド研究に対する架橋同定の強化に必要である。サイズ排除(SEC)と強カチオン交換(SCX)を含むクロマトグラフィー技術は架橋ペプチドの分離に成功したが,PPIマッピングの深さをさらに改善するためには新しい分画法がまだ必要である。ここでは,プロテオームワイドXL-MS分析の適用範囲を拡大するため,ペプチドSECをチップベース高pH逆相(HpHt)分画と統合することにより,二次元(2D)分離戦略を示した。MS切断架橋剤DSSOと組み合わせ,既存のアプローチと比較して,架橋ペプチドの同定を改善したHEK293細胞溶解物からin vitro PPIをマッピングすることに成功した。ここで開発した方法は有効であり,複雑な試料の架橋研究に一般化できる。Copyright 2022 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *質量分析 ,  クロマトグラフィー ,  ペプチド ,  タンパク質 ,  *二次元 ,  ダイナミックレンジ ,  画分 ,  逆相 ,  陽イオン交換 ,  タンパク質複合体 ,  in vitro実験 ,  メルト ,  HEK293細胞 ,  *プロテオーム
準シソーラス用語： 蛋白質間相互作用 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (3件)： プロテオーム ,  架橋 ,  質量分析