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J-GLOBAL ID：202202243210174449   整理番号：22A1159080

Panax vietnamensisの初期発生段階におけるギンセノシド生合成関連遺伝子の異なる発現【JST・京大機械翻訳】

Differential expression of ginsenoside biosynthesis-related genes at an early developmental stage of Panax vietnamensis

著者 (8件)： Luu Ly H. (Institute of Genome Research, Vietnam Academy of Science and Technology, Hanoi, Vietnam) ,  Pham Hang L. B. (Institute of Genome Research, Vietnam Academy of Science and Technology, Hanoi, Vietnam) ,  Huynh Hue T. T. (Institute of Genome Research, Vietnam Academy of Science and Technology, Hanoi, Vietnam) ,  Huynh Hue T. T. (Vietnam Academy of Science and Technology, Graduate University of Science and Technology, Hanoi, Vietnam) ,  Nguyen Linh N. (Institute of Genome Research, Vietnam Academy of Science and Technology, Hanoi, Vietnam) ,  Vu Trinh T. (Institute of Genome Research, Vietnam Academy of Science and Technology, Hanoi, Vietnam) ,  Le Hien T. T. (Institute of Genome Research, Vietnam Academy of Science and Technology, Hanoi, Vietnam) ,  Le Hien T. T. (Vietnam Academy of Science and Technology, Graduate University of Science and Technology, Hanoi, Vietnam)
資料名： Plant Biotechnology Reports  (Plant Biotechnology Reports)
巻： 16  号： 2  ページ： 215-228  発行年： 2022年 
JST資料番号： W2417A  ISSN： 1863-5466  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ベトナムの重要な薬用植物であるPanax vietnamensis Ha et Grusv.は,いくつかの貴重なギンセノシドから成る。他のPanax種と比較して,そのトランスクリプトームおよびギンセノシド生合成関連遺伝子に関する分子およびin silico研究は,まだ不足している。本研究では,P.vietnamensisの1年葉と根のトランスクリプトームを,Illuminaシステムを用いて配列決定し,分析した。選択したギンセノシド生合成関連遺伝子の発現をリアルタイムPCRを用いて確認した。全体で,42,724,41,564,および43,021のユニジーンを,それぞれ葉,根,および葉と根組織のために組み立てた。両組織からの単一遺伝子の60%以上を,遺伝子およびゲノムの京都エンシクロペディア,Pfam,遺伝子オントロジー,バイオテクノロジー情報(NCBI)非冗長蛋白質配列データベース,および遺伝子の進化遺伝子学から少なくとも1つのデータベースを用いて機能的に注釈付けした。さらに,各cDNAライブラリーにおける優勢な転写物の発現を分析し,同定した。さらに,ギンセノシド生合成に関与する酵素をコードする457の単遺伝子を同定した。MVAと非MVA経路の両方を介したギンセノシド生合成に関連する酵素をコードする多くの遺伝子を示した。定量的PCR分析は,β-アミリンシンターゼ(β-AS),チトクロームP450(CYP716A53v2,CYP716A52v2),およびUDP-グリコシルトランスフェラーゼ(UGT74AE2)が,葉よりも根において高度に発現していたことを示した。これらの結果は,P.vietnamensisの葉と根の最初の成長年に,どのようにして遺伝子がどのように発現し,ギンセノシドが産生され,蓄積されるかの疑問に答えることができる。P.vietnamensisの1年葉と根のこの最初の包括的トランスクリプトームデータは,異なる組織と発育段階におけるオタネニンジン発生,生合成,主要な二次代謝産物経路,および関連する遺伝子発現のさらなる研究に有用である。また,データはバイオテクノロジーツールを用いたオタネニンジン生合成の改善に有用な情報を提供する。Copyright Korean Society for Plant Biotechnology 2022 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *生合成 ,  アミノ酸配列 ,  *遺伝子 ,  グリコシルトランスフェラーゼ ,  転写【遺伝】 ,  葉 ,  成長段階 ,  遺伝学 ,  遺伝子発現 ,  *トチバニンジン属 ,  二次代謝産物 ,  トランスクリプトーム ,  リアルタイムPCR法
準シソーラス用語： *ジンセノシド類 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ギンセノシド ,  MEP経路 ,  MVA経路 ,  トランスクリプトーム ,  Panax vietnamensis

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： Panax ,  初期発生 ,  段階 ,  ギンセノシド ,  生合成 ,  遺伝子 ,  発現