Diaportheにおける種境界を解明するためのバーコードとしての内部転写スペーサ領域の空洞【JST・京大機械翻訳】

Hilario Sandra; Santos Liliana; Phillips Alan J.L.; Alves Artur

文献

J-GLOBAL ID：202202243360189892 整理番号：22A0234118

Diaportheにおける種境界を解明するためのバーコードとしての内部転写スペーサ領域の空洞【JST・京大機械翻訳】

Caveats of the internal transcribed spacer region as a barcode to resolve species boundaries in Diaporthe

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資料名：
巻： 126 号： 1 ページ： 54-74 発行年： 2022年
JST資料番号： D0107B ISSN： 1878-6146 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

Diaportheの種は,重要な植物病原体として主に報告されている。この属における種の同定は形態学的および分子的特徴によって補完されている。しかし,このプロセスを遅らせた一つの重要な要因は,適切な国際植物衛生対策を作成するためのロバストな種概念を定式化するのに strしい。内部転写スペーサー(ITS)rDNA領域の広範な利用にかかわらず,真菌に対する一次DNAバーコードとして確立されたが,種内変異の傾向は,系統発生解析の誤解な解釈が報告された。したがって,本研究は,特定の例を用いて,ITS領域が種制限のために問題となるかもしれない方法を説明することを目指した。ITS領域は高度に変化し,Diaporthe malorumとDiaporthe novemの系統は1つ以上のクレードに落下し,もしそれ自身で分析されるならば,異なる分類群として認識されるであろうことを示した。多様なITSパラログもD.novemのゲノム内に共存することが証明された。また,ITSは協奏進化から脱出し,重複事象を被った。さらに,本研究はDiaporthe属における推定雑種の存在を初めて報告した。著者らの知見は,ITS領域における種内およびゲノム内変異に対する新たな手がかりを提供し,バーコーディング,すなわち,Diaporthe属における種の同定に関するその価値についての疑問を提起する。したがって,著者らは,ITS領域が,新規分類群の記述の前に,慎重に,常に,一致して分析されることを推薦する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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微生物形態学・分類学

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