単一膵島のプロテオーム解析のためのウェルプレートμFASP【JST・京大機械翻訳】

Sandbaumhueter Friederike A.; Nezhyva Mariya; Eriksson Olle; Engberg Adam; Kreuger Johan; Andren Per E.; Andren Per E.; Jansson Erik T.

文献

J-GLOBAL ID：202202243865050736 整理番号：22A1160876

単一膵島のプロテオーム解析のためのウェルプレートμFASP【JST・京大機械翻訳】

Well-Plate μFASP for Proteomic Analysis of Single Pancreatic Islets

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資料名：
巻： 21 号： 4 ページ： 1167-1174 発行年： 2022年
JST資料番号： A1632A ISSN： 1535-3893 CODEN： JPROBS 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

フィルター支援試料調製(FASP)はトリプシン消化のためのボトムアッププロテオミクスで広く使用されている。しかし,この方法のサンプル回収収率は,出発物質の量によって制限される。消化蛋白質の~100ngは完全な蛋白質同定に十分であるが,プロテオミクス情報はフィルタからの不完全なペプチド回収のため蛋白質含有量<10μgで失われる。1μg蛋白質試料に適したフレキシブルウェルプレートμFASPデバイスとプロトコルを開発し最適化した。HeLa消化物の1μgにおいて,μFASPを有する1295±10蛋白質を同定し,次いで液体クロマトグラフィー-質量分析による分析を行った。対照的に,標準FASPプロトコルで524±5の蛋白質のみを同定したが,ベンチマークとして標準FASP後20μgで1395±4蛋白質を同定した。さらに,著者らは,よくプレートのμFASPを有する単一膵島のペプチド学とプロテオーム研究を組み合わせた。ここでは,神経ペプチドを分離し,ボトムアッププロテオーム分析のため残りのフィルター蛋白質を消化した。著者らの結果は,グルコース異化,膵臓ホルモン処理,および分泌ペプチドホルモンに関与する蛋白質の発現に対する種間不均一性を示した。生物学的材料が乏しい試料のプロテオーム特性化に有用なツールを提供する方法を考察した。すべてのプロテオミクスデータはDOI:10.6019/PXD029039の下で利用可能である。Copyright 2022 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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蛋白質・ペプチド一般

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