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J-GLOBAL ID：202202244476133605   整理番号：22A1177816

Yersinia pestisの迅速検出のための新しいループ媒介等温増幅アッセイ【JST・京大機械翻訳】

A Novel Loop-Mediated Isothermal Amplification Assay for Rapid Detection of Yersinia pestis

著者 (5件)： Bai Ying (Bacterial Diseases Branch, Division of Vector-Borne Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Fort Collins, CO, United States) ,  Rizzo Maria Rosales (Bacterial Diseases Branch, Division of Vector-Borne Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Fort Collins, CO, United States) ,  Parise Christina (Bacterial Diseases Branch, Division of Vector-Borne Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Fort Collins, CO, United States) ,  Maes Sarah (Bacterial Diseases Branch, Division of Vector-Borne Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Fort Collins, CO, United States) ,  Eisen Rebecca J. (Bacterial Diseases Branch, Division of Vector-Borne Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Fort Collins, CO, United States)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 13  ページ： 863142  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ペストの原因菌であるYersinia pestisの迅速検出は,病気の蔓延予防のための迅速な防除手段を可能にするための野外調査中に必須である。特に,限られた資源を有するペスト-流行領域において,Affordable,効率的で,信頼でき,簡単な検出アッセイは極めて有用である。著者らは,乾燥浴加熱器上で65°Cで簡単に培養することにより,30分以内にY.pestisを検出するループ媒介等温増幅(LAMP)アッセイを開発した。このアッセイは6つの特異的プライマーを用いてpMT1プラスミド上に位置するcaf1A遺伝子を標的にした。Y.pestisの存在は反応の色変化に基づいて視覚的に検出される。分析性能の比較のため,蛍光色素検出によるリアルタイムLAMPを,同じ6プライマーを用いてリアルタイムPCR装置で行った。感度評価は,検出限界(LOD)が,乾燥浴加熱器とリアルタイムPCR機器で,それぞれ0.2と0.03pgであることを示した。分析は100%特異的であり,密接に関連するエルシニア属と他の細菌種との交差反応性はなかった。野外採集されたノミのLAMPアッセイを試験し,Y.pestisを以前に公表されたペンタプレックスリアルタイムPCRアッセイと同一の結果で成功裏に検出したことを示した。これらの知見から,比較的安価で単純なLAMPアッセイを用いて野外調査をサポートでき,より高価な複雑なPCRアッセイに匹敵する結果が得られることを示唆した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 視覚 ,  加熱器 ,  細菌 ,  変色 ,  遺伝子 ,  プラスミド ,  *ペスト菌 ,  *Yersinia ,  検出限界 ,  プライマー【遺伝】 ,  防除 ,  リアルタイムPCR法
準シソーラス用語： 蛍光色素 ,  交差反応性 ,  起因菌 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： アッセイ開発 ,  LAMP ,  乾燥浴ヒータ ,  リアルタイムLAMP ,  ペスト ,  Yersinia pestis

分類 (1件)： 微生物検査法  (EG02020G)

引用文献 (56件)：

• Al-Jawdah A. D., Ivanova I. G., Waller H., Perkins N. D., Lakey J. H., Peters D. T. (2019). Induction of the immunoprotective coat of Yersinia pestis at body temperature is mediated by the Caf1R transcription factor. BMC Microbiol. 19:68. doi: 10.1186/s12866-019-1444-4
• Bai Y., Motin V., Enscore R. E., Osikowicz L., Rizzo M. R., Hojgaard A., et al (2020). Pentaplex real-time PCR for differential detection of Yersinia pestis and Y. pseudotuberculosis and application for testing fleas collected during plague epizootics. Microbiologyopen 9:e1105. doi: 10.1002/mbo3.1105
• Bai Y., Osikowicz L. M., Kosoy M. Y., Eisen R. J., Atiku L. A., Mpanga J. T., et al (2017). Comparison of zoonotic bacterial agents in fleas collected from small mammals or host-seeking fleas from a Ugandan region where plague is endemic. mSphere 2:e00402-17. doi: 10.1128/mSphere.00402-17
• Ben-Gurion R., Shafferman A. (1981). Essential virulence determinants of different Yersinia species are carried on a common plasmid. Plasmid 5 183-187. doi: 10.1016/0147-619x(81)90019-6
• Bodulev O. L., Sakharov I. Y. (2020). Isothermal nucleic acid amplification techniques and their use in bioanalysis. Biochemistry 85 147-166. doi: 10.1134/S0006297920020030

タイトルに関連する用語 (4件)： Yersinia ,  ループ ,  増幅 ,  アッセイ