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J-GLOBAL ID：202202244554511058   整理番号：22A1036330

エンハンサーRNAの包括的解析はブドウ膜黒色腫における新規予後バイオマーカーとしてのLINC00689とELFN1-AS1を同定する【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive Analysis of Enhancer RNAs Identifies LINC00689 and ELFN1-AS1 as Novel Prognostic Biomarkers in Uveal Melanoma

著者 (9件)： Zhao Su (Department of Ophthalmology, The Affiliated Hospital of Guizhou Medical University, Guiyang, Guizhou, China) ,  Zhao Su (School of Clinical Medicine, The Guizhou Medical University, Guiyang, Guizhou, China) ,  Jiang Hao (Department of Ophthalmology, The Affiliated Hospital of Guizhou Medical University, Guiyang, Guizhou, China) ,  Liu Jing (Department of Ophthalmology, The Affiliated Hospital of Guizhou Medical University, Guiyang, Guizhou, China) ,  Li Dao-yuan (Department of Ophthalmology, The Affiliated Hospital of Guizhou Medical University, Guiyang, Guizhou, China) ,  Li Bing (Department of Ophthalmology, The Affiliated Hospital of Guizhou Medical University, Guiyang, Guizhou, China) ,  Long Qiu-rong (Department of Ophthalmology, The Affiliated Hospital of Guizhou Medical University, Guiyang, Guizhou, China) ,  Zheng Lei (Shenzhen Eye Hospital, Shenzhen, 5180403 Guangdong, China) ,  Gu Hao (Department of Ophthalmology, The Affiliated Hospital of Guizhou Medical University, Guiyang, Guizhou, China)
資料名： Disease Markers  (Disease Markers)
巻： 2022  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： W1784A  ISSN： 0278-0240  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Enhancer RNA(eRNA)は,uval黒色腫を含むいくつかの腫瘍の病理学における重要なプレーヤーとして出現している。ここでは,ブドウ膜黒色腫(UVM)患者におけるeRNAの予後値を検討した。UVM患者の発現データと生存データをTCGAとGSE22138データセットからダウンロードした。ログランク検定によるKaplan-Meier法を用いて,UVMにおける生存関連eRNAをスクリーニングした。GEPIAを適用して,eRNAの発現と無病生存率の間の関連を分析した。KEGGアッセイを適用して重要なeRNAの潜在的シグナル伝達経路を調べた。eRNAの予後値を,Rパッケージ生存による多変量解析によってさらに調査した。eRNAsを汎癌で検証した。本研究では,TCGAデータセットに基づくUVMにおける89の生存関連eRNAを同定した。GSE22138データセットに基づいて,UVMにおいて27の生存関連eRNAを見出した。2つのeRNA(LINC00689とELFN1-AS1)だけが2つのデータセットで重複した。多変量解析の結果は,LINC00689とELFN1-AS1の両方がUVM患者における独立予後因子であることを明らかにした。汎癌検証結果は,8つの腫瘍におけるLINC00689とELFN1-AS1の予後値をさらに確認した。全体として,著者らは,臨床意思決定のためのUVM患者の予後および診断バイオマーカーとして役立つ可能性がある2つの新規UVM関連eRNA,LINC00689およびELFN1-AS1を同定した。Copyright 2022 Su Zhao et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 意思決定 ,  多変量解析 ,  *RNA【核酸】 ,  腫瘍 ,  統計的方法 ,  因子 ,  生存率 ,  *予後 ,  *黒色腫 ,  *悪性黒色腫 ,  *ぶどう膜疾患 ,  *バイオマーカー
準シソーラス用語： 無病生存率 ,  Kaplan-Meier法 ,  予後因子 ,  KEGG ,  *ブドウ膜黒色腫 ,  予後予測能 ,  Rパッケージ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 眼の腫よう  (GP04000B) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (32件)：

• M. J. Jager, C. L. Shields, C. M. Cebulla, M. H. Abdel-Rahman, H. E. Grossniklaus, M. H. Stern, R. D. Carvajal, R. N. Belfort, R. Jia, J. A. Shields, B. E. Damato, "Uveal melanoma," Nature Reviews. Disease Primers, vol. 6, no. 1, 2020.
• C. Chattopadhyay, D. W. Kim, D. S. Gombos, J. Oba, Y. Qin, M. D. Williams, B. Esmaeli, E. A. Grimm, J. A. Wargo, S. E. Woodman, S. P. Patel, "Uveal melanoma: from diagnosis to treatment and the science in between," Cancer, vol. 122, no. 15, pp. 2299-2312, 2016.
• S. Kaliki, C. L. Shields, J. A. Shields, "Uveal melanoma: estimating prognosis," Indian Journal of Ophthalmology, vol. 63, no. 2, pp. 93-102, 2015.
• K. N. Smit, M. J. Jager, A. de Klein, E. Kiliҫ, "Uveal melanoma: towards a molecular understanding," Progress in Retinal and Eye Research, vol. 75, 2020.
• C. Rodriguez-Vidal, D. Fernandez-Diaz, B. Fernandez-Marta, N. Lago-Baameiro, M. Pardo, P. Silva, L. Paniagua, M. J. Blanco-Teijeiro, A. Piñeiro, M. Bande, "Treatment of metastatic uveal melanoma: systematic review," Cancers, vol. 12, no. 9, pp. 2557, 2020.

タイトルに関連する用語 (6件)： エンハンサーRNA ,  解析 ,  ブドウ膜黒色腫 ,  予後 ,  バイオマーカー ,  同定