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J-GLOBAL ID：202202244640288208   整理番号：22A1025033

リポ多糖刺激下のブロイラの肝臓においてm=6A mRNAメチル化は遺伝子発現と脂質代謝に関連する【JST・京大機械翻訳】

m⁶A mRNA Methylation Was Associated With Gene Expression and Lipid Metabolism in Liver of Broilers Under Lipopolysaccharide Stimulation

著者 (11件)： Guo Feng (1College of Animal Science and Veterinary Medicine, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang, China) ,  Guo Feng (2Postdoctoral Research and Development Base, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang, China) ,  Zhang Yanhong (1College of Animal Science and Veterinary Medicine, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang, China) ,  Ma Jinyou (1College of Animal Science and Veterinary Medicine, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang, China) ,  Yu Yan (1College of Animal Science and Veterinary Medicine, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang, China) ,  Wang Qiuxia (1College of Animal Science and Veterinary Medicine, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang, China) ,  Gao Pei (1College of Animal Science and Veterinary Medicine, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang, China) ,  Wang Li (1College of Animal Science and Veterinary Medicine, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang, China) ,  Xu Zhiyong (1College of Animal Science and Veterinary Medicine, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang, China) ,  Wei Xiaobing (1College of Animal Science and Veterinary Medicine, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang, China) ,  Jing Mengna (1College of Animal Science and Veterinary Medicine, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 818357  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 肝炎症は常に異常な脂質代謝を伴う。N6-メチルアデノシン(m6A)mRNAメチル化が不規則な炎症性脂質レベルに影響するかどうかは不明である。ここでは,LPS刺激炎症の急性期および正常状態のニワトリ肝臓におけるm6A修飾パターンを,m6AおよびRNA配列決定およびバイオインフォマティクス分析により検討した。5,066遺伝子に分布する合計7,815m6Aピークを正常なニワトリ肝臓で同定し,大部分はCDS,3′UTR領域,および停止コドン周辺に位置した。LPS腹腔内投与の2時間後に,m6A修飾パターンは変化し,1200の異なるm6Aピークを示した。超-及び低-m6Aピークは特異的に位置し,前者は主にCDS領域に位置し,後者は3′UTR及び停止コドン近くの領域に位置した。高または低メチル化遺伝子は異なるGOオントロジーと経路に富んでいた。共分析は,m6Aメチル化レベルの折畳み変化とmRNA発現の相対的折畳み変化の間に有意な正の相関を明らかにした。さらに,蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)の計算予測は,変化したm6Aメチル化およびmRNA発現レベルを有する遺伝子が脂質代謝,免疫応答,DNA複製および蛋白質ユビキチン化に関与する過程にクラスタ化されることを示した。CD18とSREBP-1は,それぞれ,免疫プロセスと脂質代謝でクラスタ化された2つのハブ遺伝子であった。Hub遺伝子AGPAT2は,PPIネットワークにおいて免疫応答と脂質代謝クラスターを連結することが示唆された。本研究は,LPS誘発炎症の急性期におけるブロイラーニワトリ肝臓の最初のm6Aマップを提示した。所見は炎症におけるm6A仲介脂質代謝障害の可能な機構に光を当てる。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *肝臓 ,  *メチル化 ,  *RNA【核酸】 ,  *mRNA ,  *遺伝子 ,  炎症 ,  *ブロイラー ,  免疫反応 ,  *リポ多糖類 ,  *脂質代謝 ,  クラスタ化 ,  折畳み ,  *遺伝子発現
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  mRNA発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： m=6Aシークエンシング ,  ニワトリ ,  肝臓 ,  炎症 ,  脂質代謝 ,  m=6Aシークエンシング

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  免疫反応一般  (ED03010T)

引用文献 (29件)：

• ChenY., ZhouC., SunY., HeX., XueD. (2020). m6A RNA Modification Modulates Gene Expression and Cancer-Related Pathways in clear Cell Renal Cell Carcinoma. Epigenomics 12 (2), 87-99. doi: 10.2217/epi-2019-0182
• DavalosD., AkassoglouK. (2012). Fibrinogen as a Key Regulator of Inflammation in Disease. Semin. Immunopathol 34 (1), 43-62. doi: 10.1007/s00281-011-0290-8
• DominissiniD., Moshitch-MoshkovitzS., SchwartzS., Salmon-DivonM., UngarL., OsenbergS., et al (2012). Topology of the Human and Mouse m6A RNA Methylomes Revealed by m6A-Seq. Nature 485 (7397), 201-206. doi: 10.1038/nature11112
• DuH., ZhaoY., HeJ., ZhangY., XiH., LiuM., et al (2016). YTHDF2 Destabilizes m6A-Containing RNA through Direct Recruitment of the CCR4-Not Deadenylase Complex. Nat. Commun. 7, 12626. doi: 10.1038/ncomms12626
• FengZ., LiQ., MengR., YiB., XuQ. (2018). METTL 3 Regulates Alternative Splicing of MyD88 upon the Lipopolysaccharide-induced Inflammatory Response in Human Dental Pulp Cells. J. Cel Mol Med 22 (5), 2558-2568. doi: 10.1111/jcmm.13491

タイトルに関連する用語 (8件)： リポ多糖 ,  刺激 ,  ブロイラ ,  肝臓 ,  mRNA ,  メチル化 ,  遺伝子発現 ,  脂質代謝