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J-GLOBAL ID：202202244741211787   整理番号：22A0974217

薬物設計のためのオープンソースソフトウェアによる蛋白質-リガンド結合自由エネルギーのプレエクススケール計算【JST・京大機械翻訳】

Pre-Exascale Computing of Protein-Ligand Binding Free Energies with Open Source Software for Drug Design

著者 (6件)： Gapsys Vytautas (Computational Biomolecular Dynamics Group, Max-Planck Institute for Biophysical Chemistry, Germany) ,  Hahn David F. (Computational Chemistry, Janssen Research and Development, Janssen Pharmaceutica N. V., Belgium) ,  Tresadern Gary (Computational Chemistry, Janssen Research and Development, Janssen Pharmaceutica N. V., Belgium) ,  Mobley David L. (Department of Pharmaceutical Sciences, University of California, California, United States) ,  Rampp Markus (Max-Planck Computing and Data Facility, Germany) ,  de Groot Bert L. (Computational Biomolecular Dynamics Group, Max-Planck Institute for Biophysical Chemistry, Germany)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 62  号： 5  ページ： 1172-1177  発行年： 2022年 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 今日,薬物設計プロジェクトは分子動力学シミュレーションに基づく高度に正確な蛋白質-配位子結合自由エネルギー予測から恩恵を受ける。このような計算は過去に計算的に高価であるが,現在,オープンソースソフトウェアパッケージ上に構築されたワークフローは,数日において数百の化合物をスクリーニングするために,プレエキサスケールコンピューティング資源を効率的に活用できることを実証する。工業的薬物発見プロジェクトを反映するために組み立てられた大量の医薬品関連標的に関する自由エネルギー計算の結果を報告する。Copyright 2022 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 計算機シミュレーション ,  予測 ,  *タンパク質 ,  *薬物 ,  *ドラッグデザイン ,  ワークフロー
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  *オープンソース ,  *結合自由エネルギー ,  自由エネルギー計算 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  薬物の研究法  (GV01020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： 薬物設計 ,  オープンソースソフトウェア ,  蛋白質 ,  リガンド結合 ,  自由エネルギー ,  計算