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J-GLOBAL ID：202202244842758881   整理番号：22A1036302

ceRNAネットワーク構築および免疫浸潤解析に基づく明細胞腎細胞癌の新規予後シグネチャの同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of Novel Prognostic Signatures for Clear Cell Renal Cell Carcinoma Based on ceRNA Network Construction and Immune Infiltration Analysis

著者 (4件)： Zhou Lu (Department of Radiation Oncology, Cancer Hospital of China Medical University, Liaoning Cancer Hospital & Institute, No. 44 Xiaoheyan Road, Dadong District, Shenyang, 110042 Liaoning, China) ,  Ye Juan (Department of Radiology, Suzhou Kowloon Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, No. 118 Wansheng Street, Suzhou Industrial Park, Suzhou, 215028 Jiangsu, China) ,  Wen Fengyun (Department of Radiation Oncology, Cancer Hospital of China Medical University, Liaoning Cancer Hospital & Institute, No. 44 Xiaoheyan Road, Dadong District, Shenyang, 110042 Liaoning, China) ,  Yu Hong (Department of Radiation Oncology, Cancer Hospital of China Medical University, Liaoning Cancer Hospital & Institute, No. 44 Xiaoheyan Road, Dadong District, Shenyang, 110042 Liaoning, China)
資料名： Disease Markers  (Disease Markers)
巻： 2022  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： W1784A  ISSN： 0278-0240  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【目的】明細胞腎細胞癌(ccRCC)は世界的に有意な罹患率と死亡率を有し,従来の放射線療法と化学療法にしばしば耐性がある。免疫チェックポイント遮断(ICB)は,有望な抗癌治療としてccRCC患者で注目されている。さらに,競合内因性RNA(ceRNA)ネットワークは種々の腫瘍の発生と進行に重要である。この研究は,ccRCC患者におけるceRNA調節と免疫細胞浸潤の間の信頼できる予後シグネチャを同定し,可能性のある機構を探索することを目的にした。方法および結果。ccRCCサンプルの遺伝子発現プロファイリングと臨床情報を,癌ゲノムアトラス(TCGA)データベースから得た。包括的バイオインフォマティクス解析により,差次的に発現したmRNA(DEmRNA;[数式:原文を参照]),lncRNA(DElncRNA;[数式:原文を参照])およびmiRNA(DEmiRNA;[数式:原文を参照])を同定し,ceRNAネットワークを確立した。CIBERSORTアルゴリズムを適用して,ccRCC組織における22種類の腫瘍浸潤免疫細胞(TIIC)の割合を計算した。その後,単変量Cox,Lassoおよび多変量Cox回帰分析を用いて,ceRNA関連およびTIIC関連予後シグネチャを構築した。加えて,共発現分析により,重要な遺伝子とTIICの間の関係を検討し,MALAT1,miR-1271-5p,KIAA1324と濾胞ヘルパーT細胞の間の相互作用がccRCCの進行と密接に相関することを示した。最後に,潜在的MALAT1/miR-1271-5p/KIAA1324軸がccRCC細胞株におけるqRT-PCRによるceRNA理論と一致することを予備的に検証した。結論.ceRNAネットワークおよびTIICに基づいて,著者らは,優れた予測値を有する2つの予後シグネチャを構築し,ccRCC患者に対する予後および個別化治療の改善に寄与する可能性のある分子調節機構を検討した。Copyright 2022 Lu Zhou et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  相互作用 ,  回帰分析 ,  データベース ,  *ネットワーク ,  *浸潤 ,  *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  遺伝子 ,  薬物療法 ,  患者 ,  *予後 ,  *腎細胞癌
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  癌治療 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 泌尿生殖器の腫よう  (GM04000S) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (39件)：

• R. Pichler, "Immune checkpoint inhibitors in uro-oncology: urgent call for biomarkers," Cancers, vol. 12, no. 10, article 2768, 2020.
• J. J. Hsieh, M. P. Purdue, S. Signoretti, C. Swanton, L. Albiges, M. Schmidinger, D. Y. Heng, J. Larkin, V. Ficarra, "Renal cell carcinoma," Nature Reviews. Disease Primers, vol. 3, no. 1, article 17009, 2017.
• L. Salmena, L. Poliseno, Y. Tay, L. Kats, P. P. Pandolfi, "A ceRNA hypothesis: the Rosetta Stone of a hidden RNA language?," Cell, vol. 146, no. 3, pp. 353-358, 2011.
• G. Guo, Q. Kang, X. Zhu, Q. Chen, X. Wang, Y. Chen, J. Ouyang, L. Zhang, H. Tan, R. Chen, S. Huang, J. L. Chen, "A long noncoding RNA critically regulates Bcr-Abl-mediated cellular transformation by acting as a competitive endogenous RNA," Oncogene, vol. 34, no. 14, pp. 1768-1779, 2015.
• L. Vuong, R. R. Kotecha, M. H. Voss, A. A. Hakimi, "Tumor microenvironment dynamics in clear-cell renal cell carcinoma," Cancer Discovery, vol. 9, no. 10, pp. 1349-1357, 2019.

タイトルに関連する用語 (10件)： ceRNA ,  ネットワーク構築 ,  免疫 ,  浸潤 ,  解析 ,  明細胞 ,  腎細胞癌 ,  予後 ,  シグネチャ ,  同定